Gen
VPS13B
vacuolar protein sorting 13 homolog B
- HGNC 2183↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000132549↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 157680↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 8q22.2
- Souřadnice
- Chromozom 8: 99 013 274–99 877 580 (GRCh38)
- Exony
- 62 exonů na 864,3 kb
- Protein
- 3 997 aminokyselin
- Další názvy
- BLTP5B
- Předchozí symboly
- CHS1, COH1
- Transkript MANE Select
- ENST00000357162.7NM_152564.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si VPS13B i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Intellectual Disability
Jeden z 233 genů spojených s touto vazbou
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 8 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Jak je VPS13B uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 14 kb z 864,3 kb genu; 11 994 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte VPS13B
828
pozic v genu VPS13B, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 864,3 kb genu VPS13B, včetně intronů, nikoli jen 14 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Sdílí 1 onemocnění
- ADKadenosine kinaseSdílí 1 onemocnění
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxSdílí 1 onemocnění
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Sdílí 1 onemocnění
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Sdílí 1 onemocnění
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- ANK3ankyrin 3Sdílí 1 onemocnění
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Sdílí 1 onemocnění
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Sdílí 1 onemocnění
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Sdílí 1 onemocnění
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Sdílí 1 onemocnění
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ASdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s VPS13B
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit VPS13B. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Full lips
- Little lower jaw
- Narrow palate
- Prominent eyelashes
- Short philtrum
- Thick eyebrow
Zobrazit ještě 18 rysů
- Abnormal dentition
- Abnormal eyelashes
- Abnormality of the eyelid
- Aplasia/Hypoplasia of the tongue
- Cheekbone underdevelopment
- Decreased number of teeth
- Decreased size of maxilla
- Gum enlargement
- High, narrow palate
- Long eyelashes
- Low frontal hairline
- Open mouth
- Prominent nasal bridge
- Increased size of tooth
- Skin tag in front of the ear
- Beaked nose
- Decreased facial muscle tone
- Macrodontia of permanent maxillary central incisor
Abnormality of the nervous system
- Autism spectrum disorder
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Thick corpus callosum
- Abnormal speech pattern
- Epilepsy
Zobrazit ještě 2 rysů
Abnormality of the musculoskeletal system
- Double-Jointed
- Low muscle tone
- Abnormality of the hip bone
- Funnel chest
- Hunched back
- Scoliosis
- Excessive inward curvature of lower spine
- Low muscle tone, in neonatal onset
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen VPS13B: vacuolar protein sorting 13 homolog B. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/vps13b
Dante Labs. Gen VPS13B: vacuolar protein sorting 13 homolog B [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/vps13b
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů