Gen
VPS13B
vacuolar protein sorting 13 homolog B
- HGNC 2183↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000132549↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 157680↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 8q22.2
- Koordinater
- Kromosom 8: 99.013.274–99.877.580 (GRCh38)
- Exoner
- 62 exoner fordelt over 864,3 kb
- Protein
- 3.997 aminosyrer
- Også kendt som
- BLTP5B
- Tidligere symboler
- CHS1, COH1
- MANE Select-transkript
- ENST00000357162.7NM_152564.5
- Lokustype
- gene with protein product
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs VPS13B og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurateret rapport relevant for dette gen
Intellektuel funktionsnedsættelse
Et af 233 gener, der er knyttet til det
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 8 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er VPS13B opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 14 kb af genets 864,3 kb; 11.994 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest VPS13B
828
positioner i VPS13B, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 864,3 kb af VPS13B, inklusive introner, og ikke kun de 14 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deler 1 sygdom
- ADKadenosine kinaseDeler 1 sygdom
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeler 1 sygdom
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deler 1 sygdom
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deler 1 sygdom
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeler 1 sygdom
- ANK3ankyrin 3Deler 1 sygdom
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deler 1 sygdom
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deler 1 sygdom
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deler 1 sygdom
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 sygdom
- ARID1AAT-rich interaction domain 1ADeler 1 sygdom
Træk knyttet til VPS13B
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, VPS13B kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Downward slanting of the opening between the eyelids
- Full lips
- Little lower jaw
- Narrow palate
- Prominent eyelashes
- Short philtrum
- Thick eyebrow
Vis 18 træk mere
- Abnormal dentition
- Abnormal eyelashes
- Abnormality of the eyelid
- Aplasia/Hypoplasia of the tongue
- Cheekbone underdevelopment
- Decreased number of teeth
- Decreased size of maxilla
- Gum enlargement
- High, narrow palate
- Long eyelashes
- Low frontal hairline
- Open mouth
- Prominent nasal bridge
- Increased size of tooth
- Skin tag in front of the ear
- Beaked nose
- Decreased facial muscle tone
- Macrodontia of permanent maxillary central incisor
Abnormality of the nervous system
- Autism spectrum disorder
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intellectual disability
- Thick corpus callosum
- Abnormal speech pattern
- Epilepsy
Vis 2 træk mere
Abnormality of the musculoskeletal system
- Double-Jointed
- Low muscle tone
- Abnormality of the hip bone
- Funnel chest
- Hunched back
- Scoliosis
- Excessive inward curvature of lower spine
- Low muscle tone, in neonatal onset
Vis 1 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). VPS13B-genet: vacuolar protein sorting 13 homolog B. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/vps13b
Dante Labs. VPS13B-genet: vacuolar protein sorting 13 homolog B [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/vps13b
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger