Gen
SLC26A4
solute carrier family 26 member 4
- HGNC 8818↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000091137↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 5172↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 7q22.3
- Souřadnice
- Chromozom 7: 107 660 828–107 717 809 (GRCh38)
- Exony
- 21 exonů na 57 kb
- Protein
- 780 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- PDS
- Předchozí symboly
- DFNB4
- Transkript MANE Select
- ENST00000644269.2NM_000441.2
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si SLC26A4 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Congenital Hypothyroidism
A thyroid hormone deficiency present from birth.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Pendred Syndrome
- Autozomálně recesivní
Pendred syndrome (PDS) is a clinically variable genetic disorder characterized by bilateral sensorineural hearing loss and euthyroid goiter.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Hearing aids progressing to cochlear implantation; thyroid monitoring (annual TSH, thyroid ultrasound); avoidance of head trauma; surgical cochlear implantation with EVA-specific technique; levothyroxine if hypothyroid
- Autosomal recessive nonsyndromic hearing loss 4 (enlarged vestibular aqueduct)Autozomálně recesivní
SLC26A4-related hearing loss with an enlarged vestibular aqueduct but without goitre; part of the same spectrum as Pendred syndrome.
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Thyroid Cancer
- Inherited Thyroid Metabolism Disease
An inherited metabolic disease that is has its basis in the disruption of thyroid hormone metabolic process.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Hypothyroidism
Abnormally low levels of thyroid hormone.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- Thyroid Gland Disorder
A disease involving the thyroid gland.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 4 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Širší skupiny
Hearing Loss and Deafness
- Nonsyndromic Genetic Hearing Loss
Jeden z 97 genů spojených s touto vazbou
Inherited hearing loss without other medical features, including the common recessive forms caused by GJB2, OTOF, SLC26A4, STRC and many other genes, as well as dominant, X-linked and mitochondrial forms.
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Knowing the genetic cause can guide hearing support and cochlear implant decisions, gene-therapy trial eligibility (for example OTOF) and family counselling.
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je SLC26A4 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 4,7 kb z 57 kb genu; 2 343 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte SLC26A4
444
pozic v genu SLC26A4, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 57 kb genu SLC26A4, včetně intronů, nikoli jen 4,7 kb exonů.
Varianty se stránkou (14)
Varianty genu SLC26A4 se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| c.919-2A>GIVS7-2A>G | Intron 7 | 107 683 453 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| C282Y | c.845G>A | Exon 7 | 107 683 281 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| C565Y | c.1694G>A | Exon 15 | 107 700 162 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| F335L | c.1003T>C | Exon 9 | 107 689 054 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| I124Yfs*58 | c.365dup | Exon 4 | 107 672 192 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| I655V | c.1963A>G | Exon 17 | 107 701 986 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| K715N | c.2145G>T | Exon 19 | 107 710 109 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| L117F | c.349C>T | Exon 4 | 107 672 182 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| L236V | c.706C>G | Exon 6 | 107 675 050 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| R185T | c.554G>C | Exon 5 | 107 674 302 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- DUOX2dual oxidase 2Sdílí 4 onemocnění
- DUOXA2dual oxidase maturation factor 2Sdílí 4 onemocnění
- IYDiodotyrosine deiodinaseSdílí 4 onemocnění
- SLC5A5solute carrier family 5 member 5Sdílí 4 onemocnění
- TGthyroglobulinSdílí 4 onemocnění
- TPOthyroid peroxidaseSdílí 4 onemocnění
- IGSF1immunoglobulin superfamily member 1Sdílí 3 onemocnění
- IRS4insulin receptor substrate 4Sdílí 3 onemocnění
- NKX2-5NK2 homeobox 5Sdílí 3 onemocnění
- PAX8paired box 8Sdílí 3 onemocnění
- SECISBP2SECIS binding protein 2Sdílí 3 onemocnění
- SLC26A7solute carrier family 26 member 7Sdílí 3 onemocnění
Rysy spojené s SLC26A4
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit SLC26A4. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen SLC26A4: solute carrier family 26 member 4. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/slc26a4
Dante Labs. Gen SLC26A4: solute carrier family 26 member 4 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/slc26a4
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů