Gen
GAA
alpha glucosidase
- HGNC 4065↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000171298↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 2548↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 17q25.3
- Souřadnice
- Chromozom 17: 80 101 581–80 119 881 (GRCh38)
- Exony
- 20 exonů na 18,3 kb
- Protein
- 952 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Transkript MANE Select
- ENST00000302262.8NM_000152.5
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si GAA i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Pompe Disease
- Pompe Disease (Glycogen Storage Disease II)Autozomálně recesivní
Glycogen storage disease due to acid maltase deficiency (AMD) is an autosomal recessive trait leading to metabolic myopathy that affects cardiac and respiratory muscles in addition to skeletal muscle and other tissues. AMD represents a wide spectrum of clinical presentations caused by an accumulation of glycogen in lysosomes: Glycogen storage disease due to acid maltase deficiency, infantile onset, non-classic infantile onset and adult onset. Early onset forms are more severe and often fatal.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 7 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- V seznamu ACMG pro sekundární nálezy
Co přináší znalost
Enzyme replacement therapy (alglucosidase alfa; cipaglucosidase alfa + miglustat, superior in late-onset disease); respiratory support (BiPAP/CPAP/mechanical ventilation); physiotherapy; gene therapy in clinical trials
Širší skupiny
Lysosomal Storage Disease
- Lysosomal storage disease (other and unspecified types)
Jeden z 59 genů spojených s touto vazbou
Covers lysosomal storage diseases without a dedicated report, such as Farber disease and other ASAH1-related disorders, prosaposin (PSAP) deficiencies, multiple sulfatase deficiency, mucopolysaccharidosis types IX and X, and Dorfman-Chanarin disease; inheritance varies by subtype, most often autosomal recessive.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 7 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
- V seznamu ACMG pro sekundární nálezy
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je GAA uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 3,8 kb z 18,3 kb genu; 2 859 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte GAA
679
pozic v genu GAA, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 18,3 kb genu GAA, včetně intronů, nikoli jen 3,8 kb exonů.
Varianty se stránkou (486)
Varianty genu GAA se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A14Rfs*18 | c.40_47del | Exon 2 | 80 104 622 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A150Gfs*27 | c.448dup | Exon 2 | 80 105 032 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A382Lfs*10 | c.1143del | Exon 7 | 80 108 554 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A486P | c.1456G>C | Exon 10 | 80 110 745 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A610Dfs*88 | c.1824_1828dup | Exon 13 | 80 112 644 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A691Sfs*7 | c.2066_2070dup | Exon 15 | 80 113 240 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| A761Ifs*35 | c.2281delinsAT | Exon 16 | 80 117 059 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| c.-32-1G>C | Intron 1 | 80 104 554 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.-32-2A>G | Intron 1 | 80 104 553 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.-32-3C>A | Intron 1 | 80 104 552 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseSdílí 1 onemocnění
- AGAaspartylglucosaminidaseSdílí 1 onemocnění
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Sdílí 1 onemocnění
- ARSAarylsulfatase ASdílí 1 onemocnění
- ARSBarylsulfatase BSdílí 1 onemocnění
- ARSKarylsulfatase family member KSdílí 1 onemocnění
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Sdílí 1 onemocnění
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Sdílí 1 onemocnění
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninSdílí 1 onemocnění
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseSdílí 1 onemocnění
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinSdílí 1 onemocnění
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s GAA
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit GAA. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Laboratory abnormality
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Elevated circulating CK-MB concentration
- Elevated circulating NT-proBNP concentration
- Fluid around lungs
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Increased muscle glycogen content
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Decreased reflex response
- Delayed ability to sit
- Delayed ability to stand
- Multifocal hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Absent reflexes
- Motor delay
- Intellectual disability
Zobrazit ještě 1 rys
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen GAA: alpha glucosidase. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/gaa
Dante Labs. Gen GAA: alpha glucosidase [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/gaa
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů