Gen
GAA
alpha glucosidase
- HGNC 4065↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000171298↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 2548↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 17q25.3
- Koordinater
- Kromosom 17: 80 101 581–80 119 881 (GRCh38)
- Eksoner
- 20 eksoner over 18,3 kb
- Protein
- 952 aminosyrer
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000302262.8NM_000152.5
- Lokustype
- Protein-coding
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/gaa.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes GAA og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Pompes sykdom
- Pompes sykdom (glykogenlagringssykdom type II)Autosomal recessiv
Glykogenlagringssykdom på grunn av syre maltasemangel (AMD) er et autosomalt recessivt trekk som fører til metabolisk myopati som rammer hjerte- og respirasjonsmuskulatur i tillegg til skjelettmuskulatur og andre vev. AMD omfatter et bredt spekter av kliniske presentasjoner, forårsaket av opphopning av glykogen i lysosomer: Glykogenlagringssykdom på grunn av syre maltasemangel med debut i spedbarnsalderen, ikke-klassisk debut i spedbarnsalderen og debut i voksen alder. Former med tidlig debut er mer alvorlige og ofte dødelige.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 7 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- På ACMGs liste over sekundære funn
▶Handlingsnytte
Enzymerstatningsbehandling (alglukosidase alfa; cipaglukosidase alfa + miglustat, overlegen ved senbegynt sykdom); respiratorisk støtte (BiPAP/CPAP/mekanisk ventilasjon); fysioterapi; genterapi i kliniske studier
Bredere grupperinger
Lysosomal lagringssykdom
- Lysosomal lagringssykdom (andre og uspesifiserte typer)
Ett av 59 gener knyttet til den
Dekker lysosomale lagringssykdommer uten egen rapport, som Farber-sykdom og andre ASAH1-relaterte sykdommer, mangel på prosaposin (PSAP), multippel sulfatasemangel, mukopolysakkaridose type IX og X, og Dorfman-Chanarin-sykdom; arvegangen varierer mellom undertypene, oftest autosomal recessiv.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 7 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
- På ACMGs liste over sekundære funn
Slik er GAA bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Varianter med egen side
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 3,8 kb av genets 18,3 kb, og 2 859 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av GAA
679
posisjoner i GAA der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem ligger i en region som korte leseavlesninger har vanskelig for å dekke.
En helgenomsekvensering dekker alle 18,3 kb av GAA, inkludert introner, ikke bare de 3,8 kb med eksoner.
Varianter med egen side (486)
De GAA-variantene med egen side her, med flest stjerner for vurdering først. Hver side beskriver ClinVars offentlige opplysninger om varianten, aldri et resultat.
| Variant | HGVS c. | Ekson eller intron | Posisjon (GRCh38) | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A14Rfs*18 | c.40_47del | Ekson 2 | 80 104 622 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A150Gfs*27 | c.448dup | Ekson 2 | 80 105 032 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A382Lfs*10 | c.1143del | Ekson 7 | 80 108 554 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A486P | c.1456G>C | Ekson 10 | 80 110 745 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A610Dfs*88 | c.1824_1828dup | Ekson 13 | 80 112 644 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A691Sfs*7 | c.2066_2070dup | Ekson 15 | 80 113 240 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| A761Ifs*35 | c.2281delinsAT | Ekson 16 | 80 117 059 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| c.-32-1G>C | Intron 1 | 80 104 554 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.-32-2A>G | Intron 1 | 80 104 553 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.-32-3C>A | Intron 1 | 80 104 552 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme tilstandene
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseDeler 1 tilstand
- AGAaspartylglucosaminidaseDeler 1 tilstand
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Deler 1 tilstand
- ARSAarylsulfatase ADeler 1 tilstand
- ARSBarylsulfatase BDeler 1 tilstand
- ARSKarylsulfatase family member KDeler 1 tilstand
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Deler 1 tilstand
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Deler 1 tilstand
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninDeler 1 tilstand
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseDeler 1 tilstand
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinDeler 1 tilstand
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinDeler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til GAA
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene GAA kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Laboratory abnormality
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Elevated circulating CK-MB concentration
- Elevated circulating NT-proBNP concentration
- Fluid around lungs
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Increased muscle glycogen content
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Decreased reflex response
- Delayed ability to sit
- Delayed ability to stand
- Multifocal hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Absent reflexes
- Motor delay
- Intellectual disability
Vis 1 egenskap til
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). GAA-genet: alpha glucosidase. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/gaa
Dante Labs. GAA-genet: alpha glucosidase [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/gaa
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker