Gen
GAA
alpha glucosidase
- HGNC 4065↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000171298↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 2548↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 17q25.3
- Koordinater
- Kromosom 17: 80 101 581–80 119 881 (GRCh38)
- Exoner
- 20 exoner på 18,3 kb
- Protein
- 952 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- MANE Select-transkript
- ENST00000302262.8NM_000152.5
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs GAA, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Pompe-sjukdom
- Pompe-sjukdom (glykogenlagringssjukdom typ II)Autosomalt recessiv
Glykogenlagringssjukdom på grund av brist på syramaltas (AMD) är ett autosomalt recessivt arvsmönster som leder till metabol myopati som drabbar hjärt- och andningsmuskulaturen utöver skelettmuskulatur och andra vävnader. AMD omfattar ett brett spektrum av kliniska bilder orsakade av ansamling av glykogen i lysosomer: glykogenlagringssjukdom på grund av brist på syramaltas med debut i spädbarnsåldern, icke-klassisk debut i spädbarnsåldern och debut i vuxen ålder. Former med tidig debut är svårare och leder ofta till döden.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 7 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- På ACMG:s lista över sekundära fynd
Vad kunskapen förändrar
Enzymersättningsbehandling (alglukosidas alfa; cipaglukosidas alfa + miglustat, överlägsen vid sen debut av sjukdomen); andningsstöd (BiPAP/CPAP/mekanisk ventilation); fysioterapi; genterapi i kliniska prövningar
Bredare grupperingar
Lysosomal lagringssjukdom
- Lysosomal lagringssjukdom (andra och ospecificerade typer)
En av 59 gener kopplade till den
Omfattar lysosomala lagringssjukdomar utan egen rapport, till exempel Farbers sjukdom och andra ASAH1-relaterade sjukdomar, brist på prosaposin (PSAP), multipel sulfatasbrist, mukopolysackaridos typ IX och X samt Dorfman-Chanarins sjukdom; nedärvningen varierar mellan undertyperna, oftast autosomalt recessiv.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 7 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
- På ACMG:s lista över sekundära fynd
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är GAA uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 3,8 kb av genens 18,3 kb, och 2 859 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest GAA
679
positioner i GAA där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 18,3 kb av GAA, med introner inräknade, inte bara de 3,8 kb exoner.
Varianter med egen sida (486)
De GAA-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A14Rfs*18 | c.40_47del | Exon 2 | 80 104 622 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| A150Gfs*27 | c.448dup | Exon 2 | 80 105 032 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| A382Lfs*10 | c.1143del | Exon 7 | 80 108 554 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| A486P | c.1456G>C | Exon 10 | 80 110 745 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| A610Dfs*88 | c.1824_1828dup | Exon 13 | 80 112 644 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| A691Sfs*7 | c.2066_2070dup | Exon 15 | 80 113 240 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| A761Ifs*35 | c.2281delinsAT | Exon 16 | 80 117 059 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| c.-32-1G>C | Intron 1 | 80 104 554 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.-32-2A>G | Intron 1 | 80 104 553 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.-32-3C>A | Intron 1 | 80 104 552 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
Gener kopplade till samma tillstånd
- ABHD5abhydrolase domain containing 5, lysophosphatidic acid acyltransferaseDelar 1 tillstånd
- AGAaspartylglucosaminidaseDelar 1 tillstånd
- AP5Z1adaptor related protein complex 5 subunit zeta 1Delar 1 tillstånd
- ARSAarylsulfatase ADelar 1 tillstånd
- ARSBarylsulfatase BDelar 1 tillstånd
- ARSKarylsulfatase family member KDelar 1 tillstånd
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Delar 1 tillstånd
- CLCN6Cl-/H+ antiporter 6Delar 1 tillstånd
- CLN3CLN3 lysosomal/endosomal transmembrane protein, batteninDelar 1 tillstånd
- CLN5CLN5 lysosomal BMP synthaseDelar 1 tillstånd
- CLN6CLN6 transmembrane ER proteinDelar 1 tillstånd
- CLN8CLN8 transmembrane ER and ERGIC proteinDelar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till GAA
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som GAA kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Laboratory abnormality
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Elevated circulating CK-MB concentration
- Elevated circulating NT-proBNP concentration
- Fluid around lungs
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Increased muscle glycogen content
Abnormality of the cardiovascular system
- Right axis deviation
- Sinus tachycardia
- Enlarged and thickened heart muscle
- Enlarged heart
- Left ventricular hypertrophy
- Left ventricular outflow tract obstruction
- Heart murmur
- Low-output congestive heart failure
Visa ytterligare 4 egenskaper
Abnormality of the musculoskeletal system
- Difficulty descending stairs
- Difficulty walking up stairs
- Generalized muscle weakness
- Muscle weakness
- Reduced maximal expiratory pressure
- Reduced maximal inspiratory pressure
- Decreased muscle tone in infant
- Decreased lung function due to weak breathing muscles
Visa ytterligare 4 egenskaper
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Decreased reflex response
- Delayed ability to sit
- Delayed ability to stand
- Multifocal hyperintensity of cerebral white matter on MRI
- Absent reflexes
- Motor delay
- Intellectual disability
Visa ytterligare 1 egenskap
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). GAA-genen: alpha glucosidase. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/gaa
Dante Labs. GAA-genen: alpha glucosidase [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/gaa
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor