Gen
OCRL
OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase
- HGNC 8108↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000122126↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 4952↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- Xq26.1
- Koordinater
- Kromosom X: 129 540 259–129 592 556 (GRCh38)
- Exoner
- 24 exoner på 52,3 kb
- Protein
- 901 aminosyror
- Arvsgång
- X-bundet recessiv
- Även känd som
- OCRL1, Dent-2
- MANE Select-transkript
- ENST00000371113.9NM_000276.4
- Lokustyp
- gene with protein product
- Mycket hög
- Säker
- Låg
- Mycket låg
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs OCRL, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterad rapport som är relevant för denna gen
Dent-sjukdom och Lowes syndrom
- Lowes syndrom (okulocerebrorenalt syndrom)X-bundet recessiv
Ett X-kopplat tillstånd orsakat av varianter i OCRL, med medfödda katarakter, försenad utveckling och dysfunktion i njurtubuli hos män.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 7 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Att veta detta styr vården av ögon, utveckling och njurar, och bärarkvinnor kan erbjudas en ögonundersökning.
- Dent-sjukdomX-bundet recessiv
En X-kopplad sjukdom i njurtubuli orsakad av varianter i CLCN5 eller OCRL, med proteinuri av lågmolekylära proteiner, högt kalcium i urinen, njurstenar och progressiv kronisk njursjukdom hos män.
- 4 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
Att veta detta möjliggör uppföljning och åtgärder för att minska kalcium i urinen och bromsa njurskadan, samt testning av kvinnliga släktingar som kan vara bärare.
Nedärvning
- X-bundet recessiv
- Förändringen finns på X-kromosomen, så en kopia påverkar män, som har ett X, medan kvinnor med en oftast är bärare. En bärande mor för den vidare till varje barn med en chans på en av två.
Så är OCRL uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 5,2 kb av genens 52,3 kb, och 2 706 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest OCRL
99
positioner i OCRL där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
1 av dem (1 %) ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
- Low mappability (1 ställe)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalys täcker alla 52,3 kb av OCRL, med introner inräknade, inte bara de 5,2 kb exoner.
Gener kopplade till samma tillstånd
Egenskaper kopplade till OCRL
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som OCRL kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of head or neck
- Frontal bossing
- Full cheeks
- Long face
- Sparse scalp hair
- Abnormal dentition
- Abnormal tooth enamel
- Big lower jaw
- Decreased number of teeth
Visa ytterligare 19 egenskaper
- Deep philtrum
- Delayed eruption of teeth
- Dental cavities
- Dental crowding
- Drooping lower lip
- Flat back of skull
- Gum disease
- Inflamed gums
- Inflammation of the lips
- Little lower jaw
- Long philtrum
- Narrow palate
- Odontogenic neoplasm
- Open bite
- Open mouth
- Taurodontia
- Thin red part of the upper lip
- Upward slanting of the opening between the eyelids
- Thin dental enamel
Laboratory abnormality
- Elevated urine calcium levels
- Low-molecular-weight proteinuria
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Dehydration
- High urine protein levels
- Low blood sodium levels
- Proximal renal tubular acidosis
- Abnormal circulating calcium-phosphate regulating hormone concentration
Visa ytterligare 17 egenskaper
- Deficient in vitamin D
- Elevated blood creatine phosphokinase
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Joint swelling
- Low blood phosphate level
- Low blood potassium levels
- Blood in urine
- Elevated serum cholesterol
- Higher than normal levels of lactate in blood
- Hypoammonemia
- Oligosacchariduria
- Bicarbonaturia
- High urine phosphate levels
- Reduced Inositol polyphosphate 5-phosphatase OCRL-1 activity in cultured fibroblasts
- Renal Fanconi syndrome
Abnormality of the musculoskeletal system
- Low muscle tone, in neonatal onset
- Arthritis
- Double-Jointed
- Recurrent fractures
- Scoliosis
- Softening of the bones
- Abnormal shape of end part of bone
- Abnormality of the ribs
Visa ytterligare 6 egenskaper
Abnormality of the genitourinary system
- Abnormal renal tubule morphology
- Glomerulopathy
- Renal failure
- Undescended testes
- Absent sperm in semen
- Increased calcium level in kidney
- Kidney stone
- Multiple kidney cysts
Visa ytterligare 4 egenskaper
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). OCRL-genen: OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase. Hämtad 16 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ocrl
Dante Labs. OCRL-genen: OCRL inositol polyphosphate-5-phosphatase [Internet]. [citerad 16 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ocrl
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor