Gen
HMGCS2
3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2
- HGNC 5008↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000134240↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 3158↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 1p12
- Współrzędne
- Chromosom 1: 119 748 002–119 768 905 (GRCh38)
- Eksony
- 10 eksonów na odcinku 20,9 kb
- Białko
- 508 aminokwasów
- Dziedziczenie
- Autosomalne recesywne
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000369406.8NM_005518.4
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj HMGCS2 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Zaburzenia utleniania kwasów tłuszczowych i cyklu karnityny
- Zaburzenia utleniania kwasów tłuszczowych i ketogenezyAutosomalne recesywne
Grupa defektów enzymów i transporterów, w tym niedobór MCAD, VLCAD, LCHAD, SCAD i HADH, pierwotny niedobór karnityny oraz niedobór translokazy karnityna-acylokarnityna, które mogą powodować niski poziom cukru we krwi, rozpad mięśni oraz problemy serca i wątroby w okresach głodzenia lub choroby.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Co zmienia znajomość wyniku
Znajomość schorzenia pozwala unikać długotrwałego głodzenia, przygotować plan postępowania na wypadek choroby oraz, jeśli to właściwe, modyfikować podaż karnityny lub tłuszczu w diecie, co może zapobiegać epizodom zagrażającym życiu.
Dziedziczenie
- Autosomalne recesywne
- Potrzebna jest zmieniona kopia od każdego z rodziców. Przy jednej zmienionej kopii osoba jest nosicielem i zwykle nie ma objawów; gdy oboje rodzice są nosicielami, każde dziecko ma szansę jeden do czterech odziedziczyć dwie kopie.
Budowa genu HMGCS2
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 2,4 kb z 20,9 kb genu; 1527 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje HMGCS2
48
pozycje w HMGCS2, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 20,9 kb genu HMGCS2, łącznie z intronami, a nie tylko 2,4 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Wspólne schorzenie: 1
- ACADMacyl-CoA dehydrogenase medium chainWspólne schorzenie: 1
- ACADSacyl-CoA dehydrogenase short chainWspólne schorzenie: 1
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainWspólne schorzenie: 1
- ETFAelectron transfer flavoprotein subunit alphaWspólne schorzenie: 1
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit betaWspólne schorzenie: 1
- ETFDHelectron transfer flavoprotein dehydrogenaseWspólne schorzenie: 1
- HADHhydroxyacyl-CoA dehydrogenaseWspólne schorzenie: 1
- HADHAhydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alphaWspólne schorzenie: 1
- HMGCL3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyaseWspólne schorzenie: 1
- SLC22A5solute carrier family 22 member 5Wspólne schorzenie: 1
- SLC25A20solute carrier family 25 member 20Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem HMGCS2
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać HMGCS2. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Laboratory abnormality
- Elevated circulating alanine aminotransferase concentration
- Elevated circulating aspartate aminotransferase concentration
- Increased circulating free fatty acid level
- Increased circulating lactate dehydrogenase concentration
- Low blood phosphate level
- Elevated urinary 3-hydroxybutyric acid
- Elevated urinary dicarboxylic acid level
- Fatty infiltration of liver
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen HMGCS2: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2. Pobrano 16 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/hmgcs2
Dante Labs. Gen HMGCS2: 3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2 [Internet]. [cytowano 16 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/hmgcs2
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni