Genas
SLC25A20
solute carrier family 25 member 20
- HGNC 1421↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000178537↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 788↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 3p21.31
- Koordinatės
- Chromosoma 3: 48 856 926–48 898 882 (GRCh38)
- Eksonai
- 9 eksonų per 42 kb
- Baltymas
- 301 aminorūgštis
- Taip pat žinomas kaip
- CAC
- Ankstesni simboliai
- CACT
- MANE Select transkriptas
- ENST00000319017.5NM_000387.6
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc25a20.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite SLC25A20 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Riebalų oksidacijos ir karnitino ciklo sutrikimai
- Riebalų rūgščių oksidacijos ir ketogenezės sutrikimaiAutosominis recesyvinis
Fermentų ir transporterių defektų grupė, įskaitant MCAD, VLCAD, LCHAD, SCAD ir HADH trūkumą, pirminį karnitino trūkumą bei karnitino-acilkarnitino translokazės trūkumą, kurie badaujant ar sergant gali sukelti mažą cukraus kiekį kraujyje, raumenų irimą, širdies ir kepenų problemas.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Žinodami galite vengti ilgo badavimo, turėti pagalbos planą sergant ir, kai tinka, keisti karnitino vartojimą ar riebalų kiekį maiste, o tai gali užkirsti kelią gyvybei pavojingiems epizodams.
Kaip išdėstytas SLC25A20
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 1,8 kb iš 42 kb geno; 906 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: SLC25A20
2Maža
Kiek sunku sekti SLC25A20 trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo SLC25A20 egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.3,5 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.11 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
74
SLC25A20 pozicijos, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 42 kb geno SLC25A20, įskaitant intronus, o ne tik 1,8 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ACAD9acyl-CoA dehydrogenase family member 9Turi 1 bendrą būklę
- ACADMacyl-CoA dehydrogenase medium chainTuri 1 bendrą būklę
- ACADSacyl-CoA dehydrogenase short chainTuri 1 bendrą būklę
- ACADVLacyl-CoA dehydrogenase very long chainTuri 1 bendrą būklę
- ETFAelectron transfer flavoprotein subunit alphaTuri 1 bendrą būklę
- ETFBelectron transfer flavoprotein subunit betaTuri 1 bendrą būklę
- ETFDHelectron transfer flavoprotein dehydrogenaseTuri 1 bendrą būklę
- HADHhydroxyacyl-CoA dehydrogenaseTuri 1 bendrą būklę
- HADHAhydroxyacyl-CoA dehydrogenase trifunctional multienzyme complex subunit alphaTuri 1 bendrą būklę
- HMGCL3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA lyaseTuri 1 bendrą būklę
- HMGCS23-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA synthase 2Turi 1 bendrą būklę
- SLC22A5solute carrier family 22 member 5Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su SLC25A20
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti SLC25A20, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Laboratory abnormality
- Fatty infiltration of liver
- Low blood sugar in newborn
- Reduced circulating 6-pyruvoyltetrahydropterin synthase activity
- Reduced tissue carnitine-acylcarnitine translocase activity
- Elevated circulating fatty acylcarnitine concentration
- Elevated creatine kinase after exercise
- Elevated urinary dicarboxylic acid level
- High blood ammonia levels
Abnormality of the cardiovascular system
- Heart stops beating
- Abnormal heart rate
- Disease of the heart muscle
- Low blood pressure
- Ventricular tachycardia
- Extra heart beat
- Interruption of electrical communication between upper and lower chambers of heart
- Slow heartbeats
Rodyti dar 1 savybę
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.17-8666dff2.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). SLC25A20 genas: solute carrier family 25 member 20. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/slc25a20
Dante Labs. SLC25A20 genas: solute carrier family 25 member 20 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/slc25a20
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites