Gen
LGI1
leucine rich glioma inactivated 1
- HGNC 6572↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000108231↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 9211↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 10q23.33
- Współrzędne
- Chromosom 10: 93 757 936–93 798 159 (GRCh38)
- Eksony
- 8 eksonów na odcinku 40,2 kb
- Białko
- 557 aminokwasów
- Znany również jako
- IB1099, ETL1, EPITEMPIN
- Poprzednie symbole
- EPT
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000371418.9NM_005097.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/lgi1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj LGI1 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Padaczka (pełny panel)
- Padaczka
Jeden z 171 powiązanych z nim genów
Zaburzenie mózgu charakteryzujące się epizodami nieprawidłowo nasilonej aktywności wyładowań neuronalnych, które prowadzą do przejściowych zaburzeń czuciowych lub ruchowych albo zaburzeń psychicznych. Epizodom tym może, ale nie musi, towarzyszyć utrata przytomności lub drgawki.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 3 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Budowa genu LGI1
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 2,2 kb z 40,2 kb genu; 1674 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie LGI1
46
pozycje w LGI1, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadna z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odnajdują.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 40,2 kb LGI1, łącznie z intronami, a nie tylko 2,2 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólne schorzenie: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseWspólne schorzenie: 1
- ACTL6Bactin like 6BWspólne schorzenie: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Wspólne schorzenie: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Wspólne schorzenie: 1
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitWspólne schorzenie: 1
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Wspólne schorzenie: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Wspólne schorzenie: 1
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorWspólne schorzenie: 1
- ARXaristaless related homeoboxWspólne schorzenie: 1
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Wspólne schorzenie: 1
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem LGI1
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać LGI1. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Absent speech development
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
- Delayed ability to sit
- Delayed ability to walk
- Delayed speech and language development
- EEG with focal epileptiform discharges
- Epilepsy
- Generalized clonic seizure
Pokaż jeszcze 78 cech
- Grand mal seizures
- Inability to walk by childhood/adolescence
- Motor delay
- Poor eye contact
- Severe global developmental delay
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Epileptic encephalopathy
- Focal motor seizure
- Generalized myoclonic seizure
- Global developmental delay
- Hallucinations of sound
- Increased reflexes
- Intellectual disability
- Repeated seizures without recovery between them
- Seizure affecting one half of brain
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty finding words
- Difficulty sleeping
- EEG abnormality
- EEG with burst suppression
- Focal autonomic seizure with epigastric sensation/nausea/vomiting/other gastrointestinal phenomena
- Focal aware seizure
- Focal aware sensory seizure with auditory features
- Focal impaired awareness seizure
- Focal sensory seizure with auditory features
- Focal tonic seizure
- Hypsarrhythmia
- Interictal epileptiform activity
- Lethargy
- Multifocal epileptiform discharges
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Autism spectrum disorder
- Brief seizures with staring spells
- Choreoathetosis
- CNS hypomyelination
- Degeneration of cerebellum
- Deja vu
- Delayed CNS myelination
- Delayed myelination
- Diffuse cerebral atrophy
- Diffuse white matter abnormalities
- Disorder of involuntary muscle movements
- EEG with abnormally slow frequencies
- EEG with generalized epileptiform discharges
- EEG with spike-wave complexes
- Episodic ataxia
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Fewer and broader ridges in brain
- Focal automatism seizure
- Focal autonomic seizure
- Focal autonomic seizure with palpitations/tachycardia/bradycardia/asystole
- Focal clonic seizure
- Focal sensory seizure with cephalic sensation
- Focal sensory seizure with vestibular features
- Focal sensory seizure with visual features
- Generalized tonic seizure
- Infantile spasms
- Intellectual disability, mild
- Jerking
- Loss of developmental milestones
- More active than typical
- Nocturnal seizures
- Self-injurious behavior
- Sudden loss of muscle tone
- Teeth grinding
- Thin corpus callosum
- Tremor
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Uni- and bilateral multifocal epileptiform discharges
- Ventriculomegaly
- Visual hallucinations
- Behavioral abnormality
- Depression
- Dystonia
- Generalized-onset seizure
- Impulsivity
- Migraine
- Brain imaging abnormality
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen LGI1: leucine rich glioma inactivated 1. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/lgi1
Dante Labs. Gen LGI1: leucine rich glioma inactivated 1 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/lgi1
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni