Genas
MITF
melanocyte inducing transcription factor
- HGNC 7105↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000187098↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 4286↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 3p13
- Koordinatės
- Chromosoma 3: 69 739 464–69 968 332 (GRCh38)
- Eksonai
- 10 eksonų per 228,9 kb
- Baltymas
- 526 aminorūgščių
- Taip pat žinomas kaip
- MI, bHLHe32
- Ankstesni simboliai
- WS2A, WS2
- MANE Select transkriptas
- ENST00000352241.9NM_001354604.2
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mitf.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite MITF ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Melanoma
- Predispozicija šeiminei kutaniniai melanomaiAutosominis dominantinis
Paveldimas melanomos polinkis, kurį sukelia variantai genuose, pavyzdžiui, CDKN2A, CDK4, MITF ir POT1.
- 1 GenCC pateikėjas vertina jį kaip definityvų arba stiprų
▶Veiksmingumas
Reguliarus visos odos tikrinimas, apsauga nuo saulės ir, CDKN2A nešiotojams, galimybė svarstyti kasos vėžio stebėseną.
Vaardenburgo sindromas
Būklių grupė (1–4 tipai), sukelianti klausos sutrikimą ir plaukų, odos bei akių pigmento pokyčius; ją lemia tokie genai kaip PAX3, MITF, SOX10, EDNRB ir EDN3.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 5 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
Kaip išdėstytas MITF
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 4,8 kb iš 228,9 kb geno; 1 581 šių bazių koduoja baltymą.
Sekoskaita: MITF
2Maža
Kiek sunku sekti MITF trumpaisiais skaitiniais, iš 100Kiekvienas stulpelis rodo MITF egzonų bazių dalį tokio tipo sunkiuose regionuose. Balas juos sveria pagal tai, kiek kiekvienas iš jų apsunkina trumpųjų skaitinių iškvietimą: 0, kai nė viena bazė nepatenka į jokį regioną, 100, kai kiekviena bazė patenka į visus jų.
- Atvaizdavimas į genomąRuožai, kuriuose 100 arba 250 bp skaitinių negali būti vienareikšmiškai įtvirtinti, todėl ten esantis rezultatas gali būti nerastas arba klaidingas. Svoris: 35 %.0 %
- HomologijaSegmentinės dublikacijos: kopijos kituose genomo vietose, pavyzdžiui paralogai ir pseudogenai, kai tapatumas 90 % ar didesnis. Svoris: 30 %.0 %
- PasikartojimaiTandeminiai pasikartojimai ir vieno nukleotido serijos, kuriose skaitiniai slysta ir gali neapimti. Svoris: 15 %.5,2 %
- GC kiekisLangai, kurių GC kiekis yra mažesnis nei 25 % arba didesnis nei 65 %, ir kuriuos bibliotekos paruošimas apima silpnai. Svoris: 10 %.8,2 %
- Nuorodinio genomo aprėptisSpragos nuorodinėje sekoje šalia, kur nėra sekos, prie kurios trumpieji skaitiniai galėtų prisijungti. Svoris: 10 %.0 %
101
MITF pozicija, kurioje ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba greičiausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomo sekoskaita apima visus 228,9 kb geno MITF, įskaitant intronus, o ne tik 4,8 kb eksonų.
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- CDK4cyclin dependent kinase 4Turi 1 bendrą būklę
- CDKN2Acyclin dependent kinase inhibitor 2ATuri 1 bendrą būklę
- EDN3endothelin 3Turi 1 bendrą būklę
- EDNRBendothelin receptor type BTuri 1 bendrą būklę
- KITLGKIT ligandTuri 1 bendrą būklę
- PAX3paired box 3Turi 1 bendrą būklę
- POT1protection of telomeres 1Turi 1 bendrą būklę
- SNAI2snail family transcriptional repressor 2Turi 1 bendrą būklę
- SOX10SRY-box transcription factor 10Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su MITF
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti MITF, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-17: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Genome in a Bottle genomo stratifikacijos iš NIST: sekoskaitos sunkumo balas.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.18-e609d43e.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). MITF genas: melanocyte inducing transcription factor. Pasiekta 2026 m. spalio 18 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/mitf
Dante Labs. MITF genas: melanocyte inducing transcription factor [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 18 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/mitf
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites