Geeni
HNF4A
hepatocyte nuclear factor 4 alpha
- HGNC 5024↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000101076↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 3172↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 20q13.12
- Koordinaatit
- Kromosomi 20: 44 355 699–44 432 845 (GRCh38)
- Eksonit
- 10 eksonia 77,1 kb:n alueella
- Proteiini
- 452 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- NR2A1, HNF4
- Aiemmat symbolit
- TCF14, MODY, MODY1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000316673.9NM_175914.5
- Lokustyyppi
- Protein-coding
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hnf4a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue HNF4A ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Diabetes mellitus
Metabolinen sairaus, jolle on ominaista poikkeuksellisen korkea verensokeri. Sen taustalla on insuliinin tuotannon väheneminen tai insuliiniresistenssi ja herkistymisen heikentyminen.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 6 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Teplizumabi (Tzield) vaiheen 2 oireettoman tyypin 1 diabeteksen hoitoon (FDA:n hyväksymä vuonna 2022); insuliinikorvaushoito kliinisen tyypin 1 diabeteksen alkaessa; TrialNet-vasta-aineseulonta suuren riskin sukulaisille; suljetun kierron insuliininantojärjestelmät
Fanconin renotubulaarinen oireyhtymä ja renaalinen glukosuria
- Perinnöllinen Fanconin renotubulaarinen oireyhtymä
Perinnöllisten proksimaalisten tiehyethäiriöiden ryhmä, jonka aiheuttavat geenit, kuten GATM, EHHADH ja HNF4A. Siinä virtsaan menetetään useita aineita, mikä voi vaikuttaa luihin ja munuaisten toimintaan.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tiedon avulla voidaan seurata munuaisten toimintaa ja luiden terveyttä sekä tarvittaessa korvata menetettyjä mineraaleja.
Nuorten aikuisiän diabetes (MODY)
- Autosomaalinen dominantti
MODY (maturity-onset diabetes of the young) on harvinainen, suvussa esiintyvä diabetesmuoto, joka on kliinisesti ja geneettisesti heterogeeninen. Sille on ominaista nuori sairastumisikä (yleensä 10–45 vuotta), oman insuliinituotannon säilyminen, haimasolujen autoimmuniteetin puuttuminen, lihavuuden ja insuliiniresistenssin puuttuminen sekä joissakin alatyypeissä haimän ulkopuoliset oireet.
- 5 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
GCK-MODY: hoitoa ei yleensä tarvita; HNF1A/HNF4A-MODY: pieniannoksiset sulfonyyliureat; HNF1B-MODY: insuliini ja munuaisten seuranta; monigeeninen tyypin 2 diabetes: elintapamuutos, metformiini, GLP-1-agonistit tai SGLT2-estäjät sairauksien yhteisvaikutusten mukaan
HNF4A-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 4,6 kb geenin 77,1 kb:stä; 1 359 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: HNF4A
118
HNF4A-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 77,1 kb geenistä HNF4A, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 4,6 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (104)
Tässä ovat HNF4A-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A52Cfs*5 | c.152dup | Eksoni 2 | 44 406 158 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A107D | c.320C>A | Eksoni 4 | 44 413 694 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A185T | c.553G>A | Eksoni 5 | 44 414 633 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| c.-12G>A | Eksoni 1 | 44 355 793 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.1A>G | Eksoni 1 | 44 355 805 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.1A>T | Eksoni 1 | 44 355 805 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.1del | Eksoni 1 | 44 355 804 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.2T>A | Eksoni 1 | 44 355 806 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.2T>C | Eksoni 1 | 44 355 806 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima | |
| c.3G>A | Eksoni 1 | 44 355 807 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABCC8ATP binding cassette subfamily C member 8Yhteisiä sairauksia: 2
- APPL1adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 1Yhteisiä sairauksia: 2
- CELcarboxyl ester lipaseYhteisiä sairauksia: 2
- GCKglucokinaseYhteisiä sairauksia: 2
- HNF1AHNF1 homeobox AYhteisiä sairauksia: 2
- HNF1BHNF1 homeobox BYhteisiä sairauksia: 2
- INSinsulinYhteisiä sairauksia: 2
- KCNJ11potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 11Yhteisiä sairauksia: 2
- KLF11KLF transcription factor 11Yhteisiä sairauksia: 2
- NEUROD1neuronal differentiation 1Yhteisiä sairauksia: 2
- PDX1pancreatic and duodenal homeobox 1Yhteisiä sairauksia: 2
- AKT2AKT serine/threonine kinase 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin HNF4A liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita HNF4A voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Laboratory abnormality
- Elevated alkaline phosphatase
- Glucose in urine
- High liver enzymes
- High urine protein levels
- Low blood phosphate level
- Low blood sugar
- Metabolic acidosis
- Abnormal circulating fatty acid concentration
Näytä 22 piirrettä lisää
- Hyperinsulinemia
- Hyperinsulinemic hypoglycemia
- Hypoketotic hypoglycemia
- Low blood sugar in newborn
- Low blood sugar when fasting
- Abnormal circulating C-peptide concentration
- Abnormal oral glucose tolerance
- Glucose intolerance
- High blood sugar
- Increased hepatic glycogen content
- Metabolic ketoacidosis
- Renal Fanconi syndrome
- Diabetes mellitus
- Insulin resistant diabetes
- Transient neonatal diabetes mellitus
- Abnormal urinary amino-acid findings
- Body fails to respond to insulin
- Diabetic ketoacidosis
- High urine phosphate levels
- Low blood uric acid levels
- Maturity-onset diabetes of the young
- Noninsulin-dependent diabetes
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.17-8666dff2.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). HNF4A-geeni: hepatocyte nuclear factor 4 alpha. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/hnf4a
Dante Labs. HNF4A-geeni: hepatocyte nuclear factor 4 alpha [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/hnf4a
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa