Geeni
HNF1A
HNF1 homeobox A
- HGNC 11621↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000135100↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 6927↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 12q24.31
- Koordinaatit
- Kromosomi 12: 120 978 543–121 002 512 (GRCh38)
- Eksonit
- 10 eksonia 24 kb:n alueella
- Proteiini
- 631 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- HNF1, LFB1, HNF1α
- Aiemmat symbolit
- MODY3, TCF1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000257555.11NM_000545.8
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hnf1a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue HNF1A ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Diabetes mellitus
Metabolinen sairaus, jolle on ominaista poikkeuksellisen korkea verensokeri. Sen taustalla on insuliinin tuotannon väheneminen tai insuliiniresistenssi ja herkistymisen heikentyminen.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 4 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Toimenpidettävyys
Teplizumabi (Tzield) vaiheen 2 oireettoman tyypin 1 diabeteksen hoitoon (FDA:n hyväksymä vuonna 2022); insuliinikorvaushoito kliinisen tyypin 1 diabeteksen alkaessa; TrialNet-vasta-aineseulonta suuren riskin sukulaisille; suljetun kierron insuliininantojärjestelmät
Nuorten aikuisiän diabetes (MODY)
- Autosomaalinen dominantti
MODY (maturity-onset diabetes of the young) on harvinainen, suvussa esiintyvä diabetesmuoto, joka on kliinisesti ja geneettisesti heterogeeninen. Sille on ominaista nuori sairastumisikä (yleensä 10–45 vuotta), oman insuliinituotannon säilyminen, haimasolujen autoimmuniteetin puuttuminen, lihavuuden ja insuliiniresistenssin puuttuminen sekä joissakin alatyypeissä haimän ulkopuoliset oireet.
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelossa
Toimenpidettävyys
GCK-MODY: hoitoa ei yleensä tarvita; HNF1A/HNF4A-MODY: pieniannoksiset sulfonyyliureat; HNF1B-MODY: insuliini ja munuaisten seuranta; monigeeninen tyypin 2 diabetes: elintapamuutos, metformiini, GLP-1-agonistit tai SGLT2-estäjät sairauksien yhteisvaikutusten mukaan
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
HNF1A-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
- Variantit, joilla on sivu
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,4 kb geenin 24 kb:stä; 1 896 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: HNF1A
246
HNF1A-geenin kohdat, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet luvut hankalasti tavoittavat.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 24 kb geenistä HNF1A, mukaan lukien introni-alueet, eikä pelkästään 3,4 kb eksoneja.
Variantit, joilla on sivu (245)
Tässä ovat HNF1A-variantit, joilla on sivu, eniten arvostelutähtiä saaneet ensin. Jokainen sivu kuvaa ClinVarin julkista tietuetta variantista, ei koskaan tulosta.
| Variantti | HGVS c. | Eksoni tai introni | Sijainti (GRCh38) | ClinVar-luokitus | Arvioinnin tila |
|---|---|---|---|---|---|
| A15Gfs*15 | c.42_51delinsTG | Eksoni 1 | 120 978 810 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A116T | c.346G>A | Eksoni 2 | 120 988 852 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A116V | c.347C>T | Eksoni 2 | 120 988 853 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A209E | c.626C>A | Eksoni 3 | 120 993 619 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A209Sfs*11 | c.620dup | Eksoni 3 | 120 993 609 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A239T | c.715G>A | Eksoni 4 | 120 994 165 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A276D | c.827C>A | Eksoni 4 | 120 994 277 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A276G | c.827C>G | Eksoni 4 | 120 994 277 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A406V | c.1217C>T | Eksoni 6 | 120 996 650 | Todennäköisesti patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
| A501T | c.1501G>A | Eksoni 7 | 120 997 665 | Patogeeninen | ★★★★3 tähteä neljästä asiantuntijapaneelin arvioima |
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- ABCC8ATP binding cassette subfamily C member 8Yhteisiä sairauksia: 2
- APPL1adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 1Yhteisiä sairauksia: 2
- CELcarboxyl ester lipaseYhteisiä sairauksia: 2
- GCKglucokinaseYhteisiä sairauksia: 2
- HNF1BHNF1 homeobox BYhteisiä sairauksia: 2
- HNF4Ahepatocyte nuclear factor 4 alphaYhteisiä sairauksia: 2
- INSinsulinYhteisiä sairauksia: 2
- KCNJ11potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 11Yhteisiä sairauksia: 2
- KLF11KLF transcription factor 11Yhteisiä sairauksia: 2
- NEUROD1neuronal differentiation 1Yhteisiä sairauksia: 2
- PDX1pancreatic and duodenal homeobox 1Yhteisiä sairauksia: 2
- AKT2AKT serine/threonine kinase 2Yhteinen sairaus: 1
Geeniin HNF1A liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita HNF1A voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Laboratory abnormality
- Decreased circulating 1,5 anhydroglucitol concentration
- Decreased circulating free fatty acid level
- Elevated circulating C-peptide concentration
- Hyperinsulinemic hypoglycemia
- Low blood sugar in newborn
- Abnormal circulating C-peptide concentration
- Abnormal oral glucose tolerance
- Glucose in urine
Näytä 17 piirrettä lisää
- Glucose intolerance
- High blood sugar
- Hyperinsulinemia
- Hypoglycemic seizures
- Hypoketotic hypoglycemia
- Low blood sugar after a meal
- Low blood sugar when fasting
- Maturity-onset diabetes of the young
- Insulin resistant diabetes
- Ketotic hypoglycemia
- Transient neonatal diabetes mellitus
- Body fails to respond to insulin
- Diabetes mellitus
- Diabetic ketoacidosis
- Ketoacidosis
- Noninsulin-dependent diabetes
- Type 1 diabetes
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). HNF1A-geeni: HNF1 homeobox A. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/hnf1a
Dante Labs. HNF1A-geeni: HNF1 homeobox A [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/hnf1a
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa