Geen
KCNQ1
potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1
- HGNC 6294↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000053918↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 3784↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 11p15.5-p15.4
- Koordinaadid
- Kromosoom 11: 2 445 008–2 849 105 (GRCh38)
- Eksonid
- 16 eksonit, ulatus 404,1 kb
- Valk
- 676 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne dominantne
- Tuntud ka kui
- Kv7.1, KCNA8, KVLQT1, JLNS1, LQT1
- Varasemad tähised
- LQT, KCNA9
- MANE Select transkript
- ENST00000155840.12NM_000218.3
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Loe KCNQ1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Perekondlik kodade virvendus
- Autosoomne dominantne
Perekondades esinev kodade virvendus, mis on seotud muutustega geenides nagu KCNQ1, KCNJ2, GJA5, MYL4, NPPA ja SCN5A.
- 1 GenCC-i esitaja hindab seda kindlaks või tugevaks
Mida teadmine muudab
Sellest teadmine toetab sugulaste varasemat EKG-kontrolli ning insuldi ennetamise õigeaegset arutamist.
Long-QT-sündroom
Südame repolarisatsiooni häire, mida iseloomustab pikenenud QT-intervall ja ohtlike ventrikulaarsete arütmiate, näiteks torsades de pointes'i, risk.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: kindel
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
- ACMG teisese leiu loetelus
Mida teadmine muudab
Beetablokaatorid, ICD-seadme paigaldamine, füüsilise koormuse piiramine, geneetiline nõustamine
Lühendatud QT-intervalli sündroom
- Autosoomne dominantne
Südame elektrisüsteemi geneetiline haigus, mille tunnuste ja sümptomite kompleksi kuuluvad EKG-l lühike QT-intervall (< 300 ms), mis südame löögisageduse muutumisel oluliselt ei muutu, kõrged ja teravatipulised T-lained ning struktuurselt normaalne süda. Lühendatud QT-intervalli sündroom näib pärandavat autosomaalselt domineeriva tüübi järgi ning on tuvastatud mõned haigestunud perekonnad.
- ClinGen hindab seost järgmiselt: tugev
- 3 GenCC-i esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Pärandumine
- Autosoomne dominantne
- Üks muudetud koopia kumbast vanemast tahes on piisav. Vanem, kellel see on, annab selle edasi igale lapsele kahe võimalusest ühe tõenäosusega.
Kuidas KCNQ1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
- Variandid, millel on leht
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,2 kb kogupikkusega 404,1 kb; neist 2031 alust kodeerivad valku.
Kuidas genoomitest loetakse KCNQ1
369
kohad geenis KCNQ1, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu lõigul, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab.
Täisgenoomi analüüs hõlmab kogu geeni KCNQ1 404,1 kb, sealhulgas introne, mitte ainult eksoneid (3,2 kb).
Variandid, millel on leht (120)
Siin on KCNQ1 variandid, millel on leht, kõige rohkem hindamistähti kõigepealt. Iga leht kirjeldab ClinVari avalikku andmekogu variandi kohta, mitte tulemust.
| Variant | HGVS c. | Ekson või intron | Positsioon (GRCh38) | ClinVari klassifikatsioon | Ülevaatuse staatus |
|---|---|---|---|---|---|
| c.477+1G>A | Intron 2 | 2 528 019 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.477+5G>A | Intron 2 | 2 528 023 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| c.1032G>A | Ekson 7 | 2 583 545 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud | |
| G589D | c.1766G>A | Ekson 15 | 2 778 009 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| L273F | c.817C>T | Ekson 6 | 2 572 882 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| R366W | c.1096C>T | Ekson 8 | 2 585 275 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| R518X | c.1552C>T | Ekson 12 | 2 768 881 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| S225L | c.674C>T | Ekson 4 | 2 571 394 | Tõenäoliselt patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| V254M | c.760G>A | Ekson 5 | 2 572 089 | Patogeenne | ★★★★3 tähte 4-st ekspertkomisjoni hinnatud |
| A178T | c.532G>A | Ekson 3 | 2 570 682 | Patogeenne | ★★★★2 tähte 4-st kriteeriumid esitatud, mitu esitajat, vastuolusid ei ole |
Samade haigustega seotud geenid
- KCNJ2potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 2Jagab 3 haigust
- KCNH2potassium voltage-gated channel subfamily H member 2Jagab 2 haigust
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CJagab 1 haigust
- CALM1calmodulin 1Jagab 1 haigust
- CALM2calmodulin 2Jagab 1 haigust
- CALM3calmodulin 3Jagab 1 haigust
- GJA5gap junction protein alpha 5Jagab 1 haigust
- KCNE1potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1Jagab 1 haigust
- MYL4myosin light chain 4Jagab 1 haigust
- SCN5Asodium voltage-gated channel alpha subunit 5Jagab 1 haigust
- SLC4A3solute carrier family 4 member 3Jagab 1 haigust
- TRDNtriadinJagab 1 haigust
Geeniga KCNQ1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida KCNQ1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the cardiovascular system
- Fainting spell
- Prolonged QTc interval
- Shortened QT interval
- Permanent atrial fibrillation
- Slow heartbeats
- Abnormal heart rate
- Palpitations
- Paroxysmal atrial fibrillation
Näita veel 10 tunnust
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
- Torsade de pointes
- Ventricular fibrillation
- Heart attack
- Interruption of electrical communication between upper and lower chambers of heart
- Sudden cardiac death
- Ventricular arrhythmia
- Disease of the heart muscle
- Enlarged heart
- Prolonged QT interval
Abnormality of the genitourinary system
- Enlarged kidney
- Gonadoblastoma
- Increased calcium level in kidney
- Kidney stone
- Nephroblastoma
- Overgrowth of external genitalia
- Renal cortical cysts
- Undescended testes
Näita veel 1 tunnus
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). KCNQ1 geen: potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/kcnq1
Dante Labs. KCNQ1 geen: potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/kcnq1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast