Geen
KCNE1
potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1
- HGNC 6240↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000180509↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 3753↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 21q22.12
- Koordinaadid
- Kromosoom 21: 34 446 690–34 512 210 (GRCh38)
- Eksonid
- 4 eksonit, ulatus 65,5 kb
- Valk
- 129 aminohapet
- Tuntud ka kui
- minK, IsK, JLNS2, LQT5
- MANE Select transkript
- ENST00000399286.3NM_000219.6
- Lookuse tüüp
- Protein-coding
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
Selle lehe andmed
Lehe aadressile saab lisada .json või päringusse application/json, et lugeda seda JSON-vormingus.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/kcne1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe KCNE1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanne
Long-QT-sündroom
Südame repolarisatsiooni häire, mida iseloomustab pikenenud QT-intervall ja ohtlike ventrikulaarsete arütmiate, näiteks torsades de pointes'i, risk.
- 3 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
▶Tegevusvõimalikkus
Beetablokaatorid, ICD-seadme paigaldamine, füüsilise koormuse piiramine, geneetiline nõustamine
Kuidas KCNE1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,5 kb kogupikkusega 65,5 kb; neist 390 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: KCNE1
23
KCNE1 positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist 23 (100%) asuvad piirkondades, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Low mappability (23 kohta)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
- Segmental duplications (23 kohta)Copies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy.
Terve genoom katab kogu KCNE1 geeni 65,5 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 3,5 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- CACNA1Ccalcium voltage-gated channel subunit alpha1 CJagab 1 haigust
- CALM1calmodulin 1Jagab 1 haigust
- CALM2calmodulin 2Jagab 1 haigust
- CALM3calmodulin 3Jagab 1 haigust
- KCNH2potassium voltage-gated channel subfamily H member 2Jagab 1 haigust
- KCNJ2potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 2Jagab 1 haigust
- KCNQ1potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1Jagab 1 haigust
- SCN5Asodium voltage-gated channel alpha subunit 5Jagab 1 haigust
- TRDNtriadinJagab 1 haigust
Geeniga KCNE1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida KCNE1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the cardiovascular system
- Extra heart beat
- Fainting spell
- Prolonged QT interval
- Sinus bradycardia
- Prolonged QTc interval
- Abnormal heart rate
- Palpitations
- Quivering upper heart chambers resulting in irregular heartbeat
Näita veel 4 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-17: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.17-8666dff2.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). KCNE1 geen: potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/kcne1
Dante Labs. KCNE1 geen: potassium voltage-gated channel subfamily E regulatory subunit 1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/kcne1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast