Gen
SCN3A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 3
- HGNC 10590↗(yeni sekmede açılır)
- Ensembl gen ENSG00000153253↗(yeni sekmede açılır)
- NCBI Gene 6328↗(yeni sekmede açılır)
Özet
- Sitogenetik konum
- 2q24.3
- Koordinatlar
- Kromozom 2: 165.087.526–165.204.050 (GRCh38)
- Eksonlar
- 116,5 kb boyunca 28 ekson
- Protein
- 2.000 amino asit
- Diğer adları
- Nav1.3
- MANE Select transkripti
- ENST00000283254.12NM_006922.4
- Lokus türü
- gene with protein product
- Çok yüksek
- Yüksek
- Düşük
- Çok düşük
Referans genomGRCh38hg38
Gen ve varyant sayfalarındaki konumlar, bu tarayıcıda yaptığınız bu seçimi izler.
SCN3A ve genomunuzun geri kalanını tek bir testle okuyun.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde
Genome Test'imi alBu gen için derlenmiş ilgili rapor
Epilepsi (Tam Panel)
- Epilepsi
Buna bağlı 171 gen arasından biri
Nöronal deşarjın anormal şekilde artmasıyla ortaya çıkan, geçici duyusal veya motor nörolojik işlev bozukluğu ya da psişik işlev bozukluğuyla seyreden bir beyin hastalığıdır. Bu nöbetler bilinç kaybı veya konvülsiyonlarla birlikte olabilir ya da olmayabilir.
- ClinGen bu bağlantıyı kesin olarak derecelendiriyor
- 5 GenCC bildiren kurum, bunu kesin veya güçlü olarak derecelendiriyor
SCN3A geninin yapısı
- Kodlayan dizi
- Çevrilmeyen bölge
- İntron
- Transkripsiyon yönü
- Bilinen hastalığa yol açan bölgeler
- Kısa okumaların zorlandığı bölgeler
- Sayfası olan varyantlar
Genin MANE Select transkriptinin ekzonları (v1.5 sürümü), NCBI ve EMBL-EBI kaynaklı, GRCh38 referans genomu üzerinde.
Kromozom bantları, UCSC'nin GRCh38 ideogramından (2022-10-29).
Yakındaki genler, Ensembl 116 sürümünden, GRCh38 üzerinde.
Ekzonlar genin 116,5 kb uzunluğunun 9,1 kb'sini oluşturur; bu bazların 6.003 tanesi proteini kodlar.
Bir genom testi SCN3A genini nasıl okur
29
SCN3A içinde, ClinVar'ın bir değişikliği patojenik veya muhtemelen patojenik olarak sınıflandırdığı konumlar
Bunların 6 tanesi (%21), kısa okumaların zorlandığı bölgelere düşüyor.
- Low mappability (6 konum)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Tam genom, SCN3A genindeki 116,5 kb'lik bölgenin tamamını kapsar; yalnızca 9,1 kb'lik ekzonları değil, intronlar da dahil olmak üzere.
Sayfası olan varyantlar (2)
Burada sayfası bulunan SCN3A varyantları, en çok inceleme yıldızına sahip olanlar önce gelecek şekilde listelenmiştir. Her sayfa, varyantla ilgili ClinVar'ın kamuya açık kaydını açıklar; hiçbir zaman bir sonuç değildir.
| Varyant | HGVS c. | Ekzon veya intron | Konum (GRCh38) | ClinVar sınıflandırması | İnceleme durumu |
|---|---|---|---|---|---|
| F195Lfs*54 | c.585_586del | Ekzon 6 | 165.164.407 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
| I875T | c.2624T>C | Ekzon 17 | 165.130.238 | Patojenik | ★★★★4 üzerinden 3 yıldız Uzman panelince gözden geçirilmiş |
Aynı durumlarla ilişkili genler
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 11 durumu paylaşıyor
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferase1 durumu paylaşıyor
- ACTL6Bactin like 6B1 durumu paylaşıyor
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 221 durumu paylaşıyor
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A11 durumu paylaşıyor
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunit1 durumu paylaşıyor
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 21 durumu paylaşıyor
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 91 durumu paylaşıyor
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulator1 durumu paylaşıyor
- ARXaristaless related homeobox1 durumu paylaşıyor
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 21 durumu paylaşıyor
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 31 durumu paylaşıyor
SCN3A ile bağlantılı özellikler
Human Phenotype Ontology, SCN3A geninin neden olabileceği nadir hastalıklarda görülen özellikler olarak bunları listeler. Her özelliğin sayfasında, o özellikle bağlantılı diğer genler listelenir.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Seizure affecting one half of brain
- EEG with focal epileptiform discharges
- Encephalopathy
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormality of coordination
48 özellik daha göster
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- EEG with multifocal slow activity
- Focal impaired awareness seizure
- Grand mal seizures
- Inability to walk
- Intellectual disability
- Interictal EEG abnormality
- Loss of developmental milestones
- More grooves in brain
- Nocturnal seizures
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Ataxia
- Attention deficit
- Autism
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Clonic seizure
- Cognitive impairment
- Degeneration of cerebrum
- Deja vu
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Focal aware seizure
- Focal cortical dysplasia
- Hallucinations of sound
- Hypsarrhythmia
- Impulsivity
- Infantile spasms
- Intellectual disability, borderline
- Involuntary movements
- Jerking
- Loss of expressive speech
- Mental deterioration
- Multifocal epileptiform discharges
- Pins and needles feeling
- Simple febrile seizure
- Tremor
- Unsteady walk
- Visual hallucinations
- Hemimegalencephaly
- Repeated seizures without recovery between them
- Absent speech development
- Epileptic encephalopathy
Dış bağlantılar
Gen kayıtları
Transkript
Protein
Bilgilerin kaynağı
- HGNC: genin sembolü, adı, diğer sembolleri ve konumu.
- NCBI ve EMBL-EBI'dan MANE Select v1.5: transkript, eksonları ve kodlayıcı dizisi.
- GenCC ve ClinGen, 2026-10-16 sürümü: genin hangi durumlarla ilişkili olduğu ve bu ilişkinin ne kadar güçlü olduğu.
- ACMG ikincil bulgular listesi, SF v3.2.
- ClinVar ve GIAB tabakalandırmaları: bilinen hastalığa neden olan bölgeler ve kısa okumaların zorlandığı bölgeler.
- Human Phenotype Ontology, 2026-09-01 sürümü: genle bağlantılı özellikler. Daha fazla bilgi için hpo.jax.org adresini ziyaret edin.
- Veri sürümü 2026.10.16-c6eea6bf.
Bu sayfayı alıntıla
Dante Labs. (t.y.). SCN3A geni: sodium voltage-gated channel alpha subunit 3. Erişim tarihi: 17 Ekim 2026, adres: https://dantelabs.com/tr/genes/scn3a
Dante Labs. SCN3A geni: sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 [Internet]. [alıntı tarihi 17 Ekim 2026]. Erişilebilir adres: https://dantelabs.com/tr/genes/scn3a
Tek bir test. Ömür boyu yanıtlar.
$449'den başlayanÜcretsiz kargo · Sonuçlar 6–8 hafta içinde