Gen
SCN3A
sodium voltage-gated channel alpha subunit 3
- HGNC 10590↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000153253↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 6328↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 2q24.3
- Współrzędne
- Chromosom 2: 165 087 526–165 204 050 (GRCh38)
- Eksony
- 28 eksonów na odcinku 116,5 kb
- Białko
- 2000 aminokwasów
- Znany również jako
- Nav1.3
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000283254.12NM_006922.4
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj SCN3A oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Padaczka (pełny panel)
- Padaczka
Jeden z 171 powiązanych z nim genów
Zaburzenie mózgu charakteryzujące się epizodami nieprawidłowo nasilonej aktywności wyładowań neuronalnych, które prowadzą do przejściowych zaburzeń czuciowych lub ruchowych albo zaburzeń psychicznych. Epizodom tym może, ale nie musi, towarzyszyć utrata przytomności lub drgawki.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 5 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Budowa genu SCN3A
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 9,1 kb z 116,5 kb genu; 6003 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje SCN3A
29
pozycje w SCN3A, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
6 z nich (21%) przypada na regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Low mappability (6 miejsc)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 116,5 kb genu SCN3A, łącznie z intronami, a nie tylko 9,1 kb eksonów.
Warianty z podstroną (2)
Warianty SCN3A z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| F195Lfs*54 | c.585_586del | Ekson 6 | 165 164 407 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| I875T | c.2624T>C | Ekson 17 | 165 130 238 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Wspólne schorzenie: 1
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferaseWspólne schorzenie: 1
- ACTL6Bactin like 6BWspólne schorzenie: 1
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Wspólne schorzenie: 1
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Wspólne schorzenie: 1
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitWspólne schorzenie: 1
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Wspólne schorzenie: 1
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Wspólne schorzenie: 1
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorWspólne schorzenie: 1
- ARXaristaless related homeoboxWspólne schorzenie: 1
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Wspólne schorzenie: 1
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem SCN3A
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać SCN3A. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal autonomic nervous system physiology
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Seizure affecting one half of brain
- EEG with focal epileptiform discharges
- Encephalopathy
- Abnormal cerebral white matter morphology
- Abnormality of coordination
Pokaż jeszcze 48 cech
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- EEG with multifocal slow activity
- Focal impaired awareness seizure
- Grand mal seizures
- Inability to walk
- Intellectual disability
- Interictal EEG abnormality
- Loss of developmental milestones
- More grooves in brain
- Nocturnal seizures
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Ataxia
- Attention deficit
- Autism
- Autism spectrum disorder
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Clonic seizure
- Cognitive impairment
- Degeneration of cerebrum
- Deja vu
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Focal aware seizure
- Focal cortical dysplasia
- Hallucinations of sound
- Hypsarrhythmia
- Impulsivity
- Infantile spasms
- Intellectual disability, borderline
- Involuntary movements
- Jerking
- Loss of expressive speech
- Mental deterioration
- Multifocal epileptiform discharges
- Pins and needles feeling
- Simple febrile seizure
- Tremor
- Unsteady walk
- Visual hallucinations
- Hemimegalencephaly
- Repeated seizures without recovery between them
- Absent speech development
- Epileptic encephalopathy
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen SCN3A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 3. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/scn3a
Dante Labs. Gen SCN3A: sodium voltage-gated channel alpha subunit 3 [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/scn3a
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni