Gene
KCNB1
potassium voltage-gated channel subfamily B member 1
- HGNC 6231↗(abre num novo separador)
- Gene Ensembl ENSG00000158445↗(abre num novo separador)
- Gene NCBI 3745↗(abre num novo separador)
Resumo
- Localização citogenética
- 20q13.13
- Coordenadas
- Cromossoma 20: 49 363 877–49 482 668 (GRCh38)
- Exões
- 2 exões ao longo de 118,8 kb
- Proteína
- 858 aminoácidos
- Também conhecido como
- Kv2.1
- Transcrito MANE Select
- ENST00000371741.6NM_004975.4
- Tipo de locus
- Codificantes de proteínas
- Muito elevada
- Confiável
- Baixa
- Muito baixa
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Epilepsia (Painel Completo)
- Epilepsia
Um de 171 genes ligados a este
Uma perturbação cerebral caracterizada por episódios de descarga neuronal anormalmente aumentada, que resultam em episódios transitórios de disfunção neurológica sensorial ou motora, ou de disfunção psíquica. Estes episódios podem ou não estar associados a perda de consciência ou convulsões.
- 4 submissores da GenCC classificam-na como definitiva ou forte
Como KCNB1 está organizado
- Sequência codificante
- Região não traduzida
- Intrão
- Sentido da transcrição
- Locais conhecidos associados a doença
- Regiões onde as leituras curtas têm dificuldade
Exões do transcrito MANE Select do gene (versão v1.5), da NCBI e da EMBL-EBI, na montagem de referência GRCh38.
Bandas cromossómicas do ideograma GRCh38 da UCSC (2022-10-29).
Genes próximos da versão 116 do Ensembl, em GRCh38.
Os exões representam 11,9 kb dos 118,8 kb do gene; 2577 dessas bases codificam a proteína.
Sequenciação de KCNB1
2Fácil
Grau de dificuldade de sequenciar KCNB1 com leituras curtas, numa escala de 0 a 100
0 · Fácil100 · Difícil
Quase todos os exões de KCNB1 se situam em zonas onde as leituras curtas se alinham de forma limpa.
O que acresce: a proporção dos exões de KCNB1 em cada tipo de região difícil
- MapeabilidadeTroços onde leituras de 100 ou 250 pb não podem ser posicionadas de forma única, pelo que uma chamada nessa zona pode estar em falta ou ser incorreta. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 100.0%
- HomologiaDuplicações segmentares: cópias noutros pontos do genoma, como parálogos e pseudogenes, com 90% de identidade ou mais. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 60.0%
- Partilhado com o chrYAs regiões pseudoautossómicas e a região transposta do X, onde o chrX e o chrY têm a mesma sequência ou uma quase idêntica, pelo que uma leitura de um pode ser posicionada no outro. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 60.0%
- Cobertura da referênciaLacunas na montagem de referência nas proximidades, onde não existe sequência à qual as leituras se possam alinhar. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 50.0%
- RepetiçõesRepetições em tandem e sequências de uma só base, em que as leituras escorregam e podem não as abranger. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 30.5,8%
- Conteúdo em GCJanelas com menos de 25% ou mais de 65% de G e C, que a preparação da biblioteca cobre de forma deficiente. Por si só, um gene inteiramente neste tipo de região obteria a pontuação 20.3,6%
Uma pontuação da Dante Labs baseada na nossa própria investigação, construída a partir dos mapas de regiões difíceis de sequenciar Genome in a Bottle do NIST.Como é calculada a pontuaçãoCada barra representa a proporção das bases dos exões de KCNB1 que se encontram nesse tipo de região difícil. Qualquer tipo pode, por si só, tornar um gene difícil, e cada tipo adicional acrescenta menos: 0 quando nenhuma base está em nenhuma, 100 quando todas as bases estão em zonas onde as leituras não podem ser posicionadas de forma única.
70
posições em KCNB1 onde a ClinVar classifica uma alteração como patogénica ou provavelmente patogénica
Nenhuma delas se situa numa região que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
Um genoma completo cobre todos os 118,8 kb de KCNB1, incluindo os intrões, e não apenas os 11,9 kb de exões.
ClinVar pathogenic variants (76)
The KCNB1 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogénica 27
- Patogénica/provavelmente patogénica 7
- Provavelmente patogénica 42
| Variante | Conditions | Classificação na ClinVar | Estado de revisão |
|---|---|---|---|
| NM_004975.4(KCNB1):c.1136G>T (p.Gly379Val) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.935G>A (p.Arg312His) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.916C>T (p.Arg306Cys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 and 1 other | Patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1747C>T (p.Arg583Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1297C>T (p.Arg433Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1106G>T (p.Trp369Leu) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1041C>G (p.Ser347Arg) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.986A>G (p.Asn329Ser) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.934C>T (p.Arg312Cys) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.629C>T (p.Thr210Met) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica/provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1217C>T (p.Ala406Val) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1088del (p.Ser363fs) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.595A>T (p.Ile199Phe) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Provavelmente patogénica | ★★★★2 estrelas em 4 critérios fornecidos, vários submissores, sem conflitos |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1503dup (p.Lys502Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1249T>C (p.Ser417Pro) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1248C>A (p.Phe416Leu) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1246T>C (p.Phe416Leu) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1229C>T (p.Pro410Leu) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1222C>T (p.Pro408Ser) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1201G>A (p.Gly401Arg) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1169G>A (p.Gly390Glu) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1141G>A (p.Gly381Arg) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1123A>G (p.Met375Val) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1121C>T (p.Thr374Ile) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
| NM_004975.4(KCNB1):c.1109G>A (p.Trp370Ter) (opens in a new tab) | developmental and epileptic encephalopathy, 26 | Patogénica | ★★★★1 estrela em 4 critérios fornecidos, um único submissor |
See all 76 with every other KCNB1 variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Genes associados às mesmas condições
- AARS1alanyl-tRNA synthetase 1Partilha 1 condição
- ABAT4-aminobutyrate aminotransferasePartilha 1 condição
- ACTL6Bactin like 6BPartilha 1 condição
- ADAM22ADAM metallopeptidase domain 22Partilha 1 condição
- ALDH7A1aldehyde dehydrogenase 7 family member A1Partilha 1 condição
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitPartilha 1 condição
- AP3B2adaptor related protein complex 3 subunit beta 2Partilha 1 condição
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Partilha 1 condição
- ARV1ARV1 fatty acid homeostasis modulatorPartilha 1 condição
- ARXaristaless related homeoboxPartilha 1 condição
- ATP1A2ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 2Partilha 1 condição
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Partilha 1 condição
Características associadas a KCNB1
A Human Phenotype Ontology indica estas características como sinais das doenças raras que KCNB1 pode causar. A página de cada característica lista os outros genes a ela associados.
Abnormality of the nervous system
- Global developmental delay
- Grand mal seizures
- Sudden loss of muscle tone
- Encephalopathy
- Abnormality of coordination
- Absent speech development
- Atypical absence seizure
- Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset
Mostrar mais 29 características
- Decreased reflex response
- Delayed speech and language development
- EEG with multifocal slow activity
- Epilepsy
- Focal impaired awareness seizure
- Hypsarrhythmia
- Infantile spasms
- Intellectual disability
- Loss of developmental milestones
- Stereotypical hand wringing
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal gait
- Abnormal myelination
- Ataxia
- Attention deficit
- Autism
- Behavioral abnormality
- Brain degeneration
- Degeneration of cerebrum
- Diminished deep tendon reflex
- Disorder of involuntary muscle movements
- Impulsivity
- Involuntary movements
- Jerking
- Mental deterioration
- Tremor
- Unsteady walk
- Repeated seizures without recovery between them
- Epileptic encephalopathy
Ligações externas
Registos do gene
Transcrito
Proteína
De onde vem isto
- HGNC: o símbolo do gene, o nome, outros símbolos e a localização.
- MANE Select v1.5, da NCBI e da EMBL-EBI: o transcrito, os seus exões e a sequência codificante.
- GenCC e ClinGen, publicados em 2026-10-19: as condições a que o gene está associado e a força dessa associação.
- A lista de achados secundários do ACMG, SF v3.2.
- ClinVar e as estratificações GIAB: locais conhecidos que causam doença e as regiões que as leituras curtas têm dificuldade em analisar.
- As estratificações do genoma Genome in a Bottle, do NIST: a pontuação de dificuldade de sequenciação.
- Human Phenotype Ontology, versão 2026-09-01: as características associadas ao gene. Saiba mais em hpo.jax.org.
- Versão de dados 2026.10.19-9814e911.
Citar esta página
Dante Labs. (s.d.). Gene KCNB1: potassium voltage-gated channel subfamily B member 1. Consultado em 20 de outubro de 2026, em https://dantelabs.com/pt/genes/kcnb1
Dante Labs. Gene KCNB1: potassium voltage-gated channel subfamily B member 1 [Internet]. [consultado em 20 de outubro de 2026]. Disponível em: https://dantelabs.com/pt/genes/kcnb1
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