Gen
TNFRSF1A
TNF receptor superfamily member 1A
- HGNC 11916↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000067182↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 7132↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 12p13.31
- Współrzędne
- Chromosom 12: 6 328 771–6 342 076 (GRCh38)
- Eksony
- 10 eksonów na odcinku 13,3 kb
- Białko
- 455 aminokwasów
- Znany również jako
- TNF-R, TNFAR, TNFR60, TNF-R-I, CD120a, TNF-R55
- Poprzednie symbole
- TNFR1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000162749.7NM_001065.4
- Typ locus
- Kodujące białko
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tnfrsf1a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj TNFRSF1A oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Dziedziczne zespoły okresowej gorączki
- Zespół okresowy związany z receptorem TNF (TRAPS)Autosomalne dominujące
Wywoływany zmianami w TNFRSF1A, prowadzi do długotrwałych epizodów gorączki z bólem brzucha, bólem mięśni, wysypką i obrzękiem oczu.
- ClinGen ocenia powiązanie jako definitywne
- 7 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
▶Możliwość podjęcia działania
Leczenie przeciwzapalne i blokujące interleukinę-1 zmniejsza liczbę napadów oraz długoterminowe ryzyko amyloidozy nerek.
Budowa genu TNFRSF1A
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 2,2 kb z 13,3 kb genu; 1368 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie TNFRSF1A
4Niski
Jak trudno sekwencjonować TNFRSF1A krótkimi odczytami, w skali 0–100Każdy słupek to udział zasad eksonowych TNFRSF1A w danym rodzaju trudnego regionu. Wynik waży je zgodnie z tym, ile każda z nich kosztuje w wywołaniu wariantów z krótkich odczytów: 0, gdy żadna zasada nie znajduje się w takim regionie, 100, gdy każda zasada znajduje się we wszystkich takich regionach.
- MapowalnośćFragmenty, w których odczytów o długości 100 lub 250 pz nie da się jednoznacznie umieścić, więc wywołanie wariantu w tych miejscach może być brakujące lub błędne. Waga 35%.0%
- HomologiaDuplikacje segmentalne: kopie w innych miejscach genomu, takie jak paralogi i pseudogeny, o identyczności 90% lub więcej. Waga 30%.0%
- PowtórzeniaPowtórzenia tandemowe i serie jednego zasadu, na których odczyty się ślizgają i których mogą nie obejmować. Waga 15%.8,1%
- Zawartość GCOkna o zawartości G i C poniżej 25% lub powyżej 65%, które słabo pokrywa przygotowanie biblioteki. Waga 10%.27%
- Pokrycie referencyjneLuki w pobliskim składzie referencyjnym, w których nie ma sekwencji, do której mogłyby się dopasować odczyty. Waga 10%.0%
20
pozycje w TNFRSF1A, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadna z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odnajdują.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 13,3 kb TNFRSF1A, łącznie z intronami, a nie tylko 2,2 kb eksonów.
Cechy powiązane z genem TNFRSF1A
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać TNFRSF1A. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the digestive system
- Abdominal pain
- Diarrhea
- Constipation
- Intestinal obstruction
- Vomiting
- Chronic constipation
- Chronic diarrhea
- Enlarged liver
Pokaż jeszcze 1 cechę
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd to pochodzi
- HGNC: symbol genu, nazwa, inne symbole i lokalizacja.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silnie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Stratyfikacje genomu Genome in a Bottle z NIST: wynik trudności sekwencjonowania.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen TNFRSF1A: TNF receptor superfamily member 1A. Pobrano 18 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/tnfrsf1a
Dante Labs. Gen TNFRSF1A: TNF receptor superfamily member 1A [Internet]. [cytowano 18 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/tnfrsf1a
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni