Gen
APTX
aprataxin
- HGNC 15984↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000137074↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 54840↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 9p21.1
- Współrzędne
- Chromosom 9: 32 972 616–33 001 628 (GRCh38)
- Eksony
- 8 eksonów na odcinku 29 kb
- Białko
- 342 aminokwasów
- Znany również jako
- FLJ20157, AOA, AOA1, EAOH, EOAHA
- Poprzednie symbole
- AXA1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000379817.7NM_001195248.2
- Typ locus
- Protein-coding
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Ta strona jako dane
Aby odczytać ją jako JSON, dodaj .json na końcu adresu strony lub zażądaj application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/aptx.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOdczytaj APTX oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Choroba naprawy DNA
- Autosomalne recesywne
Choroba, której podłożem jest zaburzenie mechanizmów naprawy DNA.
- 4 podmiotów w GenCC ocenia je jako definitywne lub silne
Budowa genu APTX
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 2 kb z 29 kb genu; 1029 z tych zasad kodują białko.
Sekwencjonowanie APTX
17
pozycje w genie APTX, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, w którym krótkie odczyty mają trudności.
Sekwencjonowanie całego genomu obejmuje wszystkie 29 kb genu APTX, łącznie z intronami, a nie tylko 2 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- BRCA1BRCA1 DNA repair associatedWspólne schorzenie: 1
- BRCA2BRCA2 DNA repair associatedWspólne schorzenie: 1
- BRIP1BRCA1 interacting DNA helicase 1Wspólne schorzenie: 1
- COA7cytochrome c oxidase assembly factor 7Wspólne schorzenie: 1
- DCLRE1CDNA cross-link repair 1CWspólne schorzenie: 1
- DDB2damage specific DNA binding protein 2Wspólne schorzenie: 1
- ERCC1ERCC excision repair 1, endonuclease non-catalytic subunitWspólne schorzenie: 1
- ERCC2ERCC excision repair 2, TFIIH core complex helicase subunitWspólne schorzenie: 1
- ERCC3ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunitWspólne schorzenie: 1
- ERCC4ERCC excision repair 4, endonuclease catalytic subunitWspólne schorzenie: 1
- ERCC5ERCC excision repair 5, endonucleaseWspólne schorzenie: 1
- ERCC6ERCC excision repair 6, chromatin remodeling factorWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem APTX
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać APTX. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the nervous system
- Ataxia
- Degeneration of cerebellum
- Diffuse cerebral atrophy
- Global developmental delay
- Impaired distal vibration sensation
- Jerking
- Loss of ability to walk
- Repeated seizures without recovery between them
Pokaż jeszcze 28 cech
- Right hemiplegia
- Tremor
- Abnormal gait
- Abnormality of the nervous system
- Absent reflexes
- Decreased sensation in extremities
- Peripheral neuropathy
- Chorea
- Dystonia
- Impaired executive functioning
- Mental deterioration
- Axonal degeneration
- Balance impairment
- Cognitive impairment
- Decreased number of large peripheral myelinated nerve fibers
- Decreased reflex response
- Dementia
- Difficulty articulating speech
- Encephalopathy
- Epilepsy
- Explosive speech
- Inability to coordinate movements when walking
- Instability or lack of coordination of central trunk muscles
- Intellectual disability
- Limb ataxia
- Motor delay
- Peripheral axonal degeneration
- Specific learning disability
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-17: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.17-8666dff2.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen APTX: aprataxin. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/aptx
Dante Labs. Gen APTX: aprataxin [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/aptx
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni