Gen
ELOVL4
ELOVL fatty acid elongase 4
- HGNC 14415↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000118402↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 6785↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 6q14.1
- Koordinater
- Kromosom 6: 79 914 814–79 947 553 (GRCh38)
- Eksoner
- 6 eksoner over 32,7 kb
- Protein
- 314 aminosyrer
- Også kjent som
- CT118
- Tidligere symboler
- STGD2, STGD3, SCA34
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000369816.5NM_022726.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/elovl4.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes ELOVL4 og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Autosomale dominante cerebellare ataksier (SCA og DRPLA)
- Autosomal dominant cerebellar ataksiAutosomal dominant
En gruppe dominant arvelige ataksier, inkludert SCA1, SCA2, SCA3 (Machado-Joseph sykdom), SCA6, SCA7, SCA17, SCA27B og DRPLA, forårsaket av repeterte ekspansjoner eller punktvarianter i gener som ATXN1, ATXN2, ATXN3, CACNA1A, ATXN7, TBP, ATN1 og FGF14.
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Genetisk veiledning og presymptomatisk testing for slektninger, fysioterapi og symptombehandling; enkelte former, som SCA27B, kan respondere på spesifikk medisinering.
Stargardts sykdom
- ELOVL4-relatert makulopatiAutosomal dominant
En dominant Stargardt-lignende makuladystrofi forårsaket av endringer i ELOVL4.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 4 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
En arvelig makuladystrofi, oftest relatert til ABCA4, med opphopning av lipofuscin og gradvis tap av sentralsynet.
- 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Bredere grupperinger
Arvelige nevrodegenerative sykdommer
- KIF5A-relatert nevrodegenerativ sykdomAutosomal dominant
Ett av 372 gener knyttet til den
Forårsaket av endringer i én kopi av KIF5A, som koder for et motorprotein med en halevedel som binder last. Ulike typer endringer fører til ulike tilstander: hereditær spastisk paraplegi type 10, en aksonal form av Charcot-Marie-Tooths sykdom og amyotrofisk lateralsklerose (ALS).
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Behandlingen er symptomatisk og avhenger av sykdomsbildet, og omfatter fysioterapi, legemidler mot spastisitet og tverrfaglig ALS-oppfølging. Hvert barn av en berørt person har 1 av 2 sjanse for å arve endringen; genetisk veiledning hjelper familier å forstå dette.
Slik er ELOVL4 bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 3 kb av genets 32,7 kb, og 945 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av ELOVL4
5Lett
Hvor vanskelig ELOVL4 er å sekvensere med korte leser, av 100
0 · Lett100 · Vanskelig
Nesten alle eksonene til ELOVL4 ligger der korte leser kan kartlegges uten problemer.
Det som kommer i tillegg: andelen av eksonene til ELOVL4 i hver type vanskelig område
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, slik at en variant der kan mangle eller være feil. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 100.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- Delt med chrYDe pseudoautosomale områdene og det X-transponerte området, der chrX og chrY har samme eller nesten samme sekvens, slik at en lesing fra den ene kan plasseres på den andre. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 60.0 %
- ReferansedekningHull i referanseassemblyen i nærheten, der det ikke finnes sekvens for leser å justere mot. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 50.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 30.5,1 %
- GC-innholdVinduer med under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Alene ville et gen som helt ligger i denne typen område fått en poengsum på 20.16 %
En Dante Labs-poengsum basert på egen forskning, bygget på NISTs Genome in a Bottle-kart over vanskelig sekvenserbare områder.Slik beregnes poengsummenHver søyle er andelen av eksonbasene til ELOVL4 i den typen vanskelig område. Hver enkelt type kan gjøre et gen vanskelig alene, og hver ekstra type legger til mindre: 0 når ingen base er i noen, 100 når alle baser er der leser ikke kan plasseres entydig.
9
posisjoner i ELOVL4 der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynlig patogen
Ingen av dem ligger i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helgenomsekvensering dekker alle 32,7 kb av ELOVL4, inkludert introner, ikke bare de 3 kb med eksoner.
ClinVar pathogenic variants (9)
The ELOVL4 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogen 3
- Patogen/sannsynligvis patogen 2
- Sannsynligvis patogen 4
| Variant | Conditions | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|
| NM_022726.4(ELOVL4):c.698C>T (p.Thr233Met) (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia type 34 | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_022726.4(ELOVL4):c.512T>C (p.Ile171Thr) (opens in a new tab) | Stargardt disease 3 and 2 others | Patogen/sannsynligvis patogen | ★★★★2 stjerner av 4 kriterier oppgitt, flere innsendere, ingen konflikter |
| NM_022726.4(ELOVL4):c.670-1G>A (opens in a new tab) | congenital ichthyosis-intellectual disability-spastic quadriplegia syndrome | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_022726.4(ELOVL4):c.504G>C (p.Leu168Phe) (opens in a new tab) | Stargardt disease 3 and 2 others | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_022726.4(ELOVL4):c.215del (p.Pro72fs) (opens in a new tab) | congenital ichthyosis-intellectual disability-spastic quadriplegia syndrome | Patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_022726.4(ELOVL4):c.810C>G (p.Tyr270Ter) (opens in a new tab) | Stargardt disease 3 | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_022726.4(ELOVL4):c.670-24_690delinsACTATTTAATCTGTTTAGTTGTTTACTATTCAGACA (opens in a new tab) | Stargardt disease 3 | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_022726.4(ELOVL4):c.541+5G>A (opens in a new tab) | spinocerebellar ataxia type 34 | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
| NM_022726.4(ELOVL4):c.419del (p.Leu140fs) (opens in a new tab) | Stargardt disease 3 and 2 others | Sannsynligvis patogen | ★★★★1 stjerne av 4 kriterier oppgitt, én innsender |
Gener knyttet til de samme tilstandene
- AFG3L2AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 2Deler 2 tilstander
- ATN1atrophin 1Deler 2 tilstander
- ATP1A3ATPase Na+/K+ transporting subunit alpha 3Deler 2 tilstander
- ATXN1ataxin 1Deler 2 tilstander
- ATXN10ataxin 10Deler 2 tilstander
- ATXN2ataxin 2Deler 2 tilstander
- ATXN3ataxin 3Deler 2 tilstander
- ATXN7ataxin 7Deler 2 tilstander
- BEAN1brain expressed associated with NEDD4 1Deler 2 tilstander
- CACNA1Acalcium voltage-gated channel subunit alpha1 ADeler 2 tilstander
- CACNA1Gcalcium voltage-gated channel subunit alpha1 GDeler 2 tilstander
- CAMTA1calmodulin binding transcription activator 1Deler 2 tilstander
Egenskaper knyttet til ELOVL4
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene ELOVL4 kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the eye
- Decreased clarity of vision
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal choroid morphology
- Abnormal color vision
- Abnormal foveal morphology
- Abnormal macular pigmentation
- Abnormality of visual evoked potentials
- Blind spot located at fixation point
Vis 18 egenskaper til
- Difficulties with night vision
- Macular degeneration
- Paroxysmal involuntary eye movements
- Retinal pigment epithelial atrophy
- Retinal pigment epithelial mottling
- Retinal thinning
- Aplasia/Hypoplasia of the macula
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Impaired smooth pursuit
- Photopsia
- Severe near sightedness
- Yellow/white macular lesion
- Cross-eyed
- Macular atrophy
- Macular dystrophy
- Macular flecks
- Supranuclear gaze palsy
- Visual impairment
Abnormality of the nervous system
- Difficulty articulating speech
- IQ less than 20
- Limb ataxia
- Profound global developmental delay
- Abnormal gait
- Abnormal speech pattern
- Decreased reflex response
- Difficulty performing quick and alternating movements
Vis 17 egenskaper til
- Progressive cerebellar ataxia
- Abnormality of movement
- Brain degeneration
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Degeneration of cerebellum
- Delayed CNS myelination
- Generalized myoclonic seizure
- Inability to coordinate movements when walking
- Peripheral axonal neuropathy
- Absent/underdeveloped central nervous system tissue
- Intention tremor
- Muscle twitch
- Abnormal pyramidal sign
- Ataxia
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Increased reflexes
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-19: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.19-9814e911.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). ELOVL4-genet: ELOVL fatty acid elongase 4. Hentet 19. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/elovl4
Dante Labs. ELOVL4-genet: ELOVL fatty acid elongase 4 [Internett]. [sitert 19. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/elovl4
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker