Gen
APP
amyloid beta precursor protein
- HGNC 620↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000142192↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 351↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 21q21.3
- Koordinater
- Kromosom 21: 25 880 550–26 170 770 (GRCh38)
- Eksoner
- 18 eksoner over 290,2 kb
- Protein
- 770 aminosyrer
- Også kjent som
- alpha-sAPP
- Tidligere symboler
- AD1
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000346798.8NM_000484.4
- Lokustype
- Proteinkodende
- Svært høy
- Sikker
- Lav
- Svært lav
Denne siden som data
Legg til .json etter adressen til siden, eller be om application/json, for å lese den som JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/app.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLes APP og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Alzheimers sykdom
- 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Utvidet screening, kognitiv stimulering, optimalisering av hjerte- og karhelse, anti-amyloide terapier (lecanemab), kvalifisering til forebyggende studier
Cerebral amyloid angiopati
- Autosomal dominant
Arvelig cerebral hemoragi med amyloidose (HCHWA) beskriver en gruppe sjeldne familiære sykdommer i sentralnervesystemet som kjennetegnes av amyloidavleiring i hjernens blodkar. Dette fører til hemoragiske og ikke-hemoragiske slag, fokale nevrologiske utfall og progredierende kognitiv svekkelse som til slutt fører til demens.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hereditær amyloidose
- Autosomal dominant
Hereditær amyloidose er en gruppe arvelige tilstander som utgjør en av undertypene av amyloidose. Hereditær amyloidose kjennetegnes av avleiring av et unormalt protein kalt amyloid i flere organer i kroppen, der det ikke skal være, og dette fører til forstyrrelser i vevsstrukturen og organfunksjonen. Ved hereditær amyloidose forekommer amyloidavleiringene oftest i vev i hjertet, nyrene og nervesystemet. Selv om symptomer på hereditær amyloidose kan vise seg i barndommen, har de fleste ikke symptomer før i voksen alder. Det finnes mange typer hereditær amyloidose, knyttet til ulike genmutasjoner og unormale proteiner. Den vanligste typen er transthyretin-amyloidose (ATTR), en tilstand der amyloidavleiringene oftest består av proteinet transthyretin, som dannes i leveren. Andre eksempler på hereditær amyloidose omfatter, men er ikke begrenset til, apolipoprotein AI-amyloidose (A ApoAI), gelsolin-amyloidose (A Gel), lysozym-amyloidose (A Lys), cystatin C-amyloidose (A Cys), fibrinogen Aα-kjede-amyloidose (A Fib) og apolipoprotein AII-amyloidose (A ApoAII).
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 3 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
▶Handlingsnytte
Tafamidis (kinetisk stabilisator), patisiran (RNAi), vutrisiran (RNAi), inotersen (antisens), levertransplantasjon
Slik er APP bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 3,6 kb av genets 290,2 kb, og 2 313 av disse basene koder for proteinet.
Sekvensering av APP
1Lav
Hvor vanskelig APP er å sekvensere med korte leser, av 100Hver stolpe er andelen av APPs eksonbaser i den typen vanskelige regioner. Poengsummen vekter dem etter hvor mye hver enkelt koster for et kortlest-kall: 0 når ingen base er i noen, 100 når hver base er i alle.
- KartleggbarhetStrekninger der 100 eller 250 bp lange leser ikke kan plasseres entydig, så et kall der kan mangle eller være feil. Vekt 35 %.0 %
- HomologiSegmentelle duplikasjoner: kopier andre steder i genomet, som paraloger og pseudogener, med 90 % identitet eller mer. Vekt 30 %.0 %
- RepetisjonerTandemrepetisjoner og serier av én base, som leser glir på og kanskje ikke spenner over. Vekt 15 %.5,5 %
- GC-innholdVinduer under 25 % eller over 65 % G og C, som biblioteksforberedelsen dekker tynt. Vekt 10 %.5,8 %
- ReferansedekningHull i referansesammenstillingen i nærheten, der det ikke finnes noen sekvens som leser kan justeres mot. Vekt 10 %.0 %
16
posisjoner i APP der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte leser har vanskelig for å lese.
Et helt genom dekker alle 290,2 kb av APP, inkludert introner, og ikke bare de 3,6 kb med eksoner.
Gener knyttet til de samme tilstandene
- CST3cystatin CDeler 2 tilstander
- ITM2Bintegral membrane protein 2BDeler 2 tilstander
- APOA1apolipoprotein A1Deler 1 tilstand
- APOA4apolipoprotein A4Deler 1 tilstand
- APOEapolipoprotein EDeler 1 tilstand
- B2Mbeta-2-microglobulinDeler 1 tilstand
- FGAfibrinogen alpha chainDeler 1 tilstand
- GPNMBglycoprotein nmbDeler 1 tilstand
- GSNgelsolinDeler 1 tilstand
- LYZlysozymeDeler 1 tilstand
- OSMRoncostatin M receptorDeler 1 tilstand
- PSEN1presenilin 1Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til APP
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene APP kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Abnormal social behavior
- Agitation
- Behavioral abnormality
- Coma
- Confusion
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Dementia
Vis 26 egenskaper til
- Epilepsy
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Global developmental delay
- Hallucinations
- Headache
- Intellectual disability
- Jerking
- Language impairment
- Memory impairment
- Mental deterioration
- Migraine
- Neurodevelopmental abnormality
- Neurofibrillary tangles
- Parkinsonism
- Pins and needles feeling
- Somatic sensory dysfunction
- Disinhibition
- Abnormality of mental function
- Apraxia
- Ataxia
- Difficulty finding words
- Dysgraphia
- Finger agnosia
- Trouble remembering words
- Alzheimer disease
- Long-tract sign
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Her kommer dette fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, eksonene og den kodende sekvensen.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-17: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende steder, og regionene som korte leser finner vanskelige.
- Genome in a Bottle-stratifiseringene for genom, fra NIST: poengsummen for sekvenseringsvanskelighet.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.17-8666dff2.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). APP-genet: amyloid beta precursor protein. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/app
Dante Labs. APP-genet: amyloid beta precursor protein [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/app
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker