Geeni
APP
amyloid beta precursor protein
- HGNC 620↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000142192↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 351↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 21q21.3
- Koordinaatit
- Kromosomi 21: 25 880 550–26 170 770 (GRCh38)
- Eksonit
- 18 eksonia 290,2 kb:n alueella
- Proteiini
- 770 aminohappoa
- Tunnetaan myös nimellä
- alpha-sAPP
- Aiemmat symbolit
- AD1
- MANE Select -transkripti
- ENST00000346798.8NM_000484.4
- Lokustyyppi
- Proteiinia koodaava
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
Tämä sivu datana
Lisää sivun osoitteen perään .json tai pyydä application/json-muotoa, niin saat sivun JSON-muodossa.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/app.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLue APP ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyviä kuratoituja raportteja
Alzheimerin tauti
- 2 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tehostettu seulonta, kognitiivinen aktiivisuus, sydän- ja verisuoniterveyden optimointi, amyloidia vastaan kohdistuvat hoidot (lekanemabi), osallistumiskelpoisuus ennaltaehkäisytutkimuksiin
Aivojen amyloidiangiopatia
- Autosomaalinen dominantti
Perinnöllinen aivoverenvuoto amyloidoosin vuoksi (HCHWA) on joukko harvinaisia suvussa esiintyviä keskushermoston sairauksia, joille on ominaista amyloidin kertyminen aivojen verisuoniin. Tämä johtaa verenvuotoon tai ei-verenvuotoon liittyviin aivoinfarkteihin, paikallisiin neurologisiin oireisiin sekä etenevään kognitiiviseen heikkenemiseen, joka lopulta johtaa dementiaan.
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
Perinnöllinen amyloidoosi
- Autosomaalinen dominantti
Perinnöllinen amyloidoosi tarkoittaa joukkoa periytyviä sairauksia, jotka muodostavat yhden amyloidoosin alatyypin. Perinnöllisessä amyloidoosissa elimistön useisiin elimiin kertyy epänormaalia amyloidi-nimistä proteiinia sinne, missä sitä ei pitäisi olla. Tämä häiritsee elinkudosten rakennetta ja toimintaa. Perinnöllisessä amyloidoosissa amyloidikertymiä esiintyy useimmin sydämen, munuaisten ja hermoston kudoksissa. Perinnöllisen amyloidoosin oireet voivat alkaa jo lapsuudessa, mutta useimmilla ihmisillä oireita ei ilmene ennen aikuisikää. Perinnöllisiä amyloidoosimuotoja on monia, ja ne liittyvät eri geenimutaatioihin ja epänormaaleihin proteiineihin. Yleisin perinnöllisen amyloidoosin muoto on transtyretiiniamyloidoosi (ATTR). Siinä amyloidikertymät koostuvat useimmiten maksassa muodostuvasta transtyretiiniproteiinista. Muita perinnöllisen amyloidoosin esimerkkejä ovat muun muassa apolipoproteiini AI -amyloidoosi (A ApoAI), gelsoliiniamyloidoosi (A Gel), lysotsyymiamyloidoosi (A Lys), kystatiini C -amyloidoosi (A Cys), fibrinogeenin Aα-ketjun amyloidoosi (A Fib) ja apolipoproteiini AII -amyloidoosi (A ApoAII).
- ClinGen arvioi yhteyden näytön perusteella: varma
- 3 GenCC-arvioijaa pitää sitä varmana tai vahvana
▶Toimenpidettävyys
Tafamidis (kineettinen stabilisaattori), patisiraani (RNAi), vutisiraani (RNAi), inotersen (antisense), maksansiirto
APP-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
- Alueet, joita lyhyillä lukemilla on vaikea lukea
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 3,6 kb geenin 290,2 kb:stä; 2 313 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Sekvensointi: APP
1Matala
Kuinka vaikea APP on sekvensoida lyhyillä lukemilla, asteikolla 0–100Jokainen palkki kuvaa sen osuutta APP-geenin eksonien emäksistä kyseisessä vaikeassa alueessa. Pisteet painottavat alueita sen mukaan, kuinka paljon kukin vaikeuttaa lyhyiden lukemien variantinkutsua: 0, kun mikään emäs ei kuulu mihinkään vaikeaan alueeseen, ja 100, kun jokainen emäs kuuluu kaikkiin niistä.
- KartoitettavuusAlueet, joilla 100 tai 250 emäsparin lukemia ei voi sijoittaa yksiselitteisesti, joten kutsu siellä voi puuttua tai olla virheellinen. Paino 35 %.0 %
- HomologiaSegmentaaliset duplikaatit: kopiot muualla genomissa, kuten paraloogit ja pseudogeenit, vähintään 90 %:n identtisyydellä. Paino 30 %.0 %
- ToistotTandeemitoistot ja saman emäksen toistuvat jaksot, joilla lukemat luistavat ja joita ne eivät välttämättä kata. Paino 15 %.5,5 %
- GC-pitoisuusIkkunat, joissa G- ja C-emästen osuus on alle 25 % tai yli 65 %, ja joita kirjastonvalmistus kattaa ohuesti. Paino 10 %.5,8 %
- Referenssin peittävyysLähellä olevan referenssikokoonpanon aukot, joissa ei ole sekvenssiä, johon lukemat voisivat kohdistua. Paino 10 %.0 %
16
kohtaa APP-geenissä, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Yksikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Koko genomin sekvensointi kattaa kaikki 290,2 kb APP-geenistä, intronit mukaan lukien, eikä vain 3,6 kb eksoneista.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- CST3cystatin CYhteisiä sairauksia: 2
- ITM2Bintegral membrane protein 2BYhteisiä sairauksia: 2
- APOA1apolipoprotein A1Yhteinen sairaus: 1
- APOA4apolipoprotein A4Yhteinen sairaus: 1
- APOEapolipoprotein EYhteinen sairaus: 1
- B2Mbeta-2-microglobulinYhteinen sairaus: 1
- FGAfibrinogen alpha chainYhteinen sairaus: 1
- GPNMBglycoprotein nmbYhteinen sairaus: 1
- GSNgelsolinYhteinen sairaus: 1
- LYZlysozymeYhteinen sairaus: 1
- OSMRoncostatin M receptorYhteinen sairaus: 1
- PSEN1presenilin 1Yhteinen sairaus: 1
Geeniin APP liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita APP voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal gait
- Abnormal social behavior
- Agitation
- Behavioral abnormality
- Coma
- Confusion
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Dementia
Näytä 26 piirrettä lisää
- Epilepsy
- Febrile seizure (within the age range of 3 months to 6 years)
- Global developmental delay
- Hallucinations
- Headache
- Intellectual disability
- Jerking
- Language impairment
- Memory impairment
- Mental deterioration
- Migraine
- Neurodevelopmental abnormality
- Neurofibrillary tangles
- Parkinsonism
- Pins and needles feeling
- Somatic sensory dysfunction
- Disinhibition
- Abnormality of mental function
- Apraxia
- Ataxia
- Difficulty finding words
- Dysgraphia
- Finger agnosia
- Trouble remembering words
- Alzheimer disease
- Long-tract sign
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tiedot ovat peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkriptio, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-17: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut sairauksia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joita lyhyet lukemat pitävät vaikeina.
- Genome in a Bottle -genomistratifikaatiot NIST:ltä: sekvensoinnin vaikeuspisteet.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Tietojulkaisu 2026.10.18-e609d43e.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). APP-geeni: amyloid beta precursor protein. Haettu 18. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/app
Dante Labs. APP-geeni: amyloid beta precursor protein [Internet]. [viitattu 18. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/app
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa