Gen
COL6A2
collagen type VI alpha 2 chain
- HGNC 2212↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000142173↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 1292↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 21q22.3
- Coördinaten
- Chromosoom 21: 46.098.112–46.132.848 (GRCh38)
- Exons
- 28 exons over 34,7 kb
- Eiwit
- 1.019 aminozuren
- MANE Select-transcript
- ENST00000300527.9NM_001849.4
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees COL6A2 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Congenitale spierdystrofieën
- Collageen VI-gerelateerde myopathie
Een spectrum van spieraandoeningen veroorzaakt door varianten in COL6A1, COL6A2 of COL6A3, variërend van ernstige congenitale spierdystrofie van Ullrich tot mildere myopathie van Bethlem, met zwakte en gewrichtscontracturen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
- Congenitale spierdystrofie
Een groep spierdystrofieën die bij de geboorte of in de zuigelingenperiode beginnen, waaronder dystroglycanopathieën (zoals vormen die verband houden met FKRP, FKTN en POMT1/2).
- 3 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Gordelspierdystrofie
Gordelspierdystrofie wordt gedefinieerd als een verzameling van talrijke subtypen met verschillende overervingspatronen (waarbij ook de mate waarin een diagnose met zekerheid kan worden gesteld, varieert). Dragers van varianten die verband houden met deze aandoening dienen advies in te winnen bij een specialist in de spier- en skeletaandoeningen voor een definitieve diagnose.
- 2 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van COL6A2
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3,4 kb van de 34,7 kb van het gen; 3.060 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest COL6A2 leest
183
posities in COL6A2 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
2 daarvan (1,1%) vallen in gebieden die korte reads moeilijk vinden.
- Low mappability (2 posities)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
Een volledig genoom dekt alle 34,7 kb van COL6A2, inclusief introns, en niet alleen de 3,4 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainDeelt 3 aandoeningen
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainDeelt 3 aandoeningen
- DAG1dystroglycan 1Deelt 2 aandoeningen
- FKRPfukutin related proteinDeelt 2 aandoeningen
- FKTNfukutinDeelt 2 aandoeningen
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BDeelt 2 aandoeningen
- LAMA2laminin subunit alpha 2Deelt 2 aandoeningen
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Deelt 2 aandoeningen
- SNUPNsnurportin 1Deelt 2 aandoeningen
- ANO5anoctamin 5Deelt 1 aandoening
- B3GALNT2beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2Deelt 1 aandoening
- B4GAT1beta-1,4-glucuronyltransferase 1Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan COL6A2
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die COL6A2 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormality of skeletal muscle fiber size
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Elbow contracture
- Increased endomysial connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Low muscle tone
- Muscle degeneration
- Muscle fiber necrosis
Toon 30 kenmerken meer
- Muscle fiber splitting
- Muscle weakness
- Neck flexion weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced muscle collagen VI
- Shoulder contracture
- Abnormal muscle fiber morphology
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized muscle weakness
- Hunched back
- Increased wrist mobility
- Muscular dystrophy
- Progressive proximal muscle weakness
- Reduced spine movement
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Frequent falls
- Generalized decreased muscle tone
- Multiple joint contractures
- Neck muscle weakness
- Scoliosis
- Weak diaphragm
- Weakness of outermost muscles
- Axial muscle weakness
- Double-Jointed
- Excessive inward curvature of lower spine
- Gowers sign
- Reduced maximal expiratory pressure
- Rimmed vacuoles
- Thoracolumbar scoliosis
Abnormality of limbs
- Ankle contracture
- Hip contracture
- Increased mobility in finger joint
- Shortening of the achilles tendon
- Increased laxity of fingers
- Knee contracture
- Ankle flexion contracture
- Elbow flexion contracture
Toon 15 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). COL6A2-gen: collagen type VI alpha 2 chain. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/col6a2
Dante Labs. COL6A2-gen: collagen type VI alpha 2 chain [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/col6a2
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken