Gen
COL6A2
collagen type VI alpha 2 chain
- HGNC 2212↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000142173↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 1292↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 21q22.3
- Koordinater
- Kromosom 21: 46.098.112–46.132.848 (GRCh38)
- Exoner
- 28 exoner fordelt over 34,7 kb
- Protein
- 1.019 aminosyrer
- MANE Select-transkript
- ENST00000300527.9NM_001849.4
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs COL6A2 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Medfødte muskeldystrofier
- Kollagen VI-relateret myopati
Et spektrum af muskelsygdomme forårsaget af varianter i COL6A1, COL6A2 eller COL6A3, fra svær medfødt Ullrich-muskeldystrofi til mildere Bethlem-myopati, med svaghed og ledkontrakturer.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
- Medfødt muskeldystrofi
En gruppe muskeldystrofier med debut ved fødslen eller i spædbarnsalderen, herunder dystroglykanopatier (såsom former relateret til FKRP, FKTN og POMT1/2).
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Gördelmuskeldystrofi (Limb-Girdle Muscular Dystrophy)
Gördelmuskeldystrofi (Limb-Girdle Muscular Dystrophy) defineres som en samling af en lang række undertyper med forskellige arvemønstre (og med varierende grad af diagnostisk sikkerhed). Bærere af varianter, der er relateret til sygdommen, bør søge vejledning hos en specialist i muskel- og skeletsygdomme for at få en endelig diagnose.
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Sådan er COL6A2 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 3,4 kb af genets 34,7 kb; 3.060 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest COL6A2
183
positioner i COL6A2, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
2 af dem (1,1 %) ligger i regioner, som korte læsninger har svært ved.
- Low mappability (2 steder)Regions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely.
En helgenomsanalyse dækker alle 34,7 kb af COL6A2, inklusive introner, og ikke kun de 3,4 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainDeler 3 sygdomme
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainDeler 3 sygdomme
- DAG1dystroglycan 1Deler 2 sygdomme
- FKRPfukutin related proteinDeler 2 sygdomme
- FKTNfukutinDeler 2 sygdomme
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BDeler 2 sygdomme
- LAMA2laminin subunit alpha 2Deler 2 sygdomme
- POMGNT1protein O-linked mannose N-acetylglucosaminyltransferase 1 (beta 1,2-)Deler 2 sygdomme
- SNUPNsnurportin 1Deler 2 sygdomme
- ANO5anoctamin 5Deler 1 sygdom
- B3GALNT2beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2Deler 1 sygdom
- B4GAT1beta-1,4-glucuronyltransferase 1Deler 1 sygdom
Træk knyttet til COL6A2
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, COL6A2 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Abnormality of skeletal muscle fiber size
- Centrally nucleated skeletal muscle fibers
- Elbow contracture
- Increased endomysial connective tissue
- Increased variability in muscle fiber diameter
- Low muscle tone
- Muscle degeneration
- Muscle fiber necrosis
Vis 30 træk mere
- Muscle fiber splitting
- Muscle weakness
- Neck flexion weakness
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced muscle collagen VI
- Shoulder contracture
- Abnormal muscle fiber morphology
- EMG: myopathic abnormalities
- Flexed joint that cannot be straightened
- Generalized muscle weakness
- Hunched back
- Increased wrist mobility
- Muscular dystrophy
- Progressive proximal muscle weakness
- Reduced spine movement
- Diffuse skeletal muscle wasting
- Frequent falls
- Generalized decreased muscle tone
- Multiple joint contractures
- Neck muscle weakness
- Scoliosis
- Weak diaphragm
- Weakness of outermost muscles
- Axial muscle weakness
- Double-Jointed
- Excessive inward curvature of lower spine
- Gowers sign
- Reduced maximal expiratory pressure
- Rimmed vacuoles
- Thoracolumbar scoliosis
Abnormality of limbs
- Ankle contracture
- Hip contracture
- Increased mobility in finger joint
- Shortening of the achilles tendon
- Increased laxity of fingers
- Knee contracture
- Ankle flexion contracture
- Elbow flexion contracture
Vis 15 træk mere
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). COL6A2-genet: collagen type VI alpha 2 chain. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/col6a2
Dante Labs. COL6A2-genet: collagen type VI alpha 2 chain [Internet]. [citeret 17. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/col6a2
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger