Gen
COL9A1
collagen type IX alpha 1 chain
- HGNC 2217↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000112280↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 1297↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 6q13
- Coördinaten
- Chromosoom 6: 70.216.126–70.303.084 (GRCh38)
- Exons
- 38 exons over 87 kb
- Eiwit
- 921 aminozuren
- MANE Select-transcript
- ENST00000357250.11NM_001851.6
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Lees COL9A1 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Epifysaire en spondyloepifysaire dysplasieën
- Multipele epifysaire dysplasie
Een groep aandoeningen die de uiteinden van de lange botten aantasten, met gewrichtspijn en stijfheid en vroegtijdige artrose als gevolg. Ze worden veroorzaakt door genen waaronder COMP, MATN3, COL9A1, COL9A2, COL9A3 en SLC26A2.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
Vitreoretinopathie
- Vitreoretinale Degeneratie
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van COL9A1
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3,7 kb van de 87 kb van het gen; 2.766 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest COL9A1 leest
11
posities in COL9A1 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 87 kb van COL9A1, inclusief introns, en niet alleen de 3,7 kb aan exonen.
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainDeelt 2 aandoeningen
- COL9A3collagen type IX alpha 3 chainDeelt 2 aandoeningen
- BEST1bestrophin 1Deelt 1 aandoening
- CAPN5calpain 5Deelt 1 aandoening
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COL18A1collagen type XVIII alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COMPcartilage oligomeric matrix proteinDeelt 1 aandoening
- CTNNB1catenin beta 1Deelt 1 aandoening
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Deelt 1 aandoening
- FZD4frizzled class receptor 4Deelt 1 aandoening
- KCNJ13potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan COL9A1
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die COL9A1 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of limbs
- Knock knees
- Coxa vara
- Dropped arches
- Flat end part of innermost thighbone
- Irregular end part of innermost thighbone
- Irregular thighbone end part
- Limb undergrowth
- Reduced arm span
Toon 16 kenmerken meer
- Short neck of thighbone
- Shortened long bone of hand
- Abnormal kneecap
- Abnormal radial epiphysis morphology
- Abnormality of end part of the elbow bone
- Abnormality of the ankle
- Abnormality of the end part of the foot bone
- Abnormality of the knee
- Bilateral coxa valga
- Broad femoral neck
- Fragmentation of end part of the long bone of hand
- Outward bow-leggedness
- Radially deviated wrists
- Ulnar deviated club hands
- Flat end part of outermost thighbone
- Irregular outermost thighbone end part
Abnormality of the eye
- Astigmatism
- Chorioretinal atrophy
- Close sighted
- Clouding of the lens of the eye
- Degenerative vitreoretinopathy
- Rhegmatogenous retinal detachment
- Severe near sightedness
- Abnormal vitreous humor morphology
Toon 3 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). COL9A1-gen: collagen type IX alpha 1 chain. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/col9a1
Dante Labs. COL9A1-gen: collagen type IX alpha 1 chain [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/col9a1
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken