Gène
HNF1A
HNF1 homeobox A
- HGNC 11621↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000135100↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 6927↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 12q24.31
- Coordonnées
- Chromosome 12 : 120 978 543–121 002 512 (GRCh38)
- Exons
- 10 exons sur 24 kb
- Protéine
- 631 acides aminés
- Aussi appelé
- HNF1, LFB1, HNF1α
- Symboles précédents
- MODY3, TCF1
- Transcrit MANE Select
- ENST00000257555.11NM_000545.8
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
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Diabète sucré
Trouble métabolique caractérisé par une glycémie anormalement élevée, résultant d'une diminution de la production d'insuline ou d'une résistance/désensibilisation à l'insuline.
- ClinGen juge le lien définitif
- 4 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
- Dans la liste ACMG des résultats secondaires
▶Actionnabilité
Teplizumab (Tzield) pour le DT1 présymptomatique de stade 2 (approuvé par la FDA en 2022) ; insulinothérapie substitutive dès le début clinique du DT1 ; dépistage des auto-anticorps TrialNet pour les proches à haut risque ; systèmes de délivrance d'insuline en boucle fermée
Diabète de type MODY (Maturity-Onset Diabetes of the Young)
- Autosomique dominant
Le diabète de type MODY (maturity-onset diabetes of the young) est une forme rare, familiale, cliniquement et génétiquement hétérogène de diabète, caractérisée par un début précoce (généralement entre 10 et 45 ans), le maintien d'une production endogène d'insuline, l'absence d'auto-immunité contre les cellules bêta pancréatiques, l'absence d'obésité et d'insulinorésistance, ainsi que par des manifestations extra-pancréatiques dans certains sous-types.
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
- Dans la liste ACMG des résultats secondaires
▶Actionnabilité
MODY-GCK : aucun traitement nécessaire ; MODY-HNF1A/HNF4A : sulfamides hypoglycémiants à faible dose ; MODY-HNF1B : insuline + surveillance rénale ; DT2 polygénique : modification des habitudes de vie, metformine, agonistes du GLP-1, inhibiteurs du SGLT2 selon le profil des comorbidités
Structure de HNF1A
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
- Variants avec une page
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 3,4 kb sur les 24 kb du gène ; 1 896 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de HNF1A
246
positions dans HNF1A où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se trouve dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome complet couvre les 24 kb de HNF1A dans leur totalité, introns compris, et pas seulement les 3,4 kb d'exons.
Variants avec une page (245)
Les variants HNF1A disposant d'une page ici, ceux avec le plus d'étoiles de révision en premier. Chaque page décrit le dossier public de ClinVar sur le variant, jamais un résultat.
| Variant | HGVS c. | Exon ou intron | Position (GRCh38) | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|---|---|
| A15Gfs*15 | c.42_51delinsTG | Exon 1 | 120 978 810 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| A116T | c.346G>A | Exon 2 | 120 988 852 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| A116V | c.347C>T | Exon 2 | 120 988 853 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| A209E | c.626C>A | Exon 3 | 120 993 619 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| A209Sfs*11 | c.620dup | Exon 3 | 120 993 609 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| A239T | c.715G>A | Exon 4 | 120 994 165 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| A276D | c.827C>A | Exon 4 | 120 994 277 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| A276G | c.827C>G | Exon 4 | 120 994 277 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| A406V | c.1217C>T | Exon 6 | 120 996 650 | Probablement pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| A501T | c.1501G>A | Exon 7 | 120 997 665 | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
ClinVar pathogenic variants (322)
The HNF1A variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogène 148
- Pathogène/probablement pathogène 1
- Probablement pathogène 173
| Variant | Conditions | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|
| NG_011731.2:g.4741A>C | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.1A>G (p.Met1Val) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.1A>T (p.Met1Leu) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.2T>C (p.Met1Thr) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.4del (p.Val2fs) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.17G>A (p.Ser6Asn) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.19C>T (p.Gln7Ter) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.25C>T (p.Gln9Ter) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.42_51delinsTG (p.Ala15fs) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.58G>C (p.Gly20Arg) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.58G>A (p.Gly20Arg) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.68_69del (p.Lys23fs) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.71_72del (p.Glu24fs) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.94G>T (p.Glu32Ter) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.121G>T (p.Glu41Ter) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.130del (p.Leu44fs) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.129_130delinsA (p.Leu44fs) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.142del (p.Glu48fs) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.164_168del (p.Gly55fs) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.160C>T (p.Arg54Ter) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.185del (p.Asn62fs) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.196dup (p.Glu66fs) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.319C>A (p.Leu107Ile) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.319C>G (p.Leu107Val) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
| NM_000545.8(HNF1A):c.320T>G (p.Leu107Arg) | monogenic diabetes | Pathogène | ★★★★3 étoiles sur 4 examiné par un groupe d'experts |
See all 322 with every other HNF1A variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Gènes liés aux mêmes affections
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- NEUROD1neuronal differentiation 1Partage 2 affections
- PDX1pancreatic and duodenal homeobox 1Partage 2 affections
- AKT2AKT serine/threonine kinase 2Partage 1 affection
Traits associés à HNF1A
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que HNF1A peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Laboratory abnormality
- Decreased circulating 1,5 anhydroglucitol concentration
- Decreased circulating free fatty acid level
- Elevated circulating C-peptide concentration
- Hyperinsulinemic hypoglycemia
- Low blood sugar in newborn
- Abnormal circulating C-peptide concentration
- Abnormal oral glucose tolerance
- Glucose in urine
Afficher 17 traits supplémentaires
- Glucose intolerance
- High blood sugar
- Hyperinsulinemia
- Hypoglycemic seizures
- Hypoketotic hypoglycemia
- Low blood sugar after a meal
- Low blood sugar when fasting
- Maturity-onset diabetes of the young
- Insulin resistant diabetes
- Ketotic hypoglycemia
- Transient neonatal diabetes mellitus
- Body fails to respond to insulin
- Diabetes mellitus
- Diabetic ketoacidosis
- Ketoacidosis
- Noninsulin-dependent diabetes
- Type 1 diabetes
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-19 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.19-9814e911.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène HNF1A : HNF1 homeobox A. Consulté le 19 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/hnf1a
Dante Labs. Gène HNF1A : HNF1 homeobox A [Internet]. [consulté le 19 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/hnf1a
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