Genas
HNF1A
HNF1 homeobox A
- HGNC 11621↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000135100↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 6927↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 12q24.31
- Koordinatės
- Chromosoma 12: 120 978 543–121 002 512 (GRCh38)
- Eksonai
- 10 eksonų per 24 kb
- Baltymas
- 631 aminorūgštis
- Taip pat žinomas kaip
- HNF1, LFB1, HNF1α
- Ankstesni simboliai
- MODY3, TCF1
- MANE Select transkriptas
- ENST00000257555.11NM_000545.8
- Lokuso tipas
- Baltymus koduojantys
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Ši puslapis kaip duomenys
Norėdami perskaityti jį kaip JSON, pridėkite .json prie puslapio adreso arba nurodykite application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/hnf1a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePerskaitykite HNF1A ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Diabetes mellitus
- Diabetas (Diabetes mellitus)
Metabolinis sutrikimas, kuriam būdingas nenormaliai aukštas gliukozės kiekis kraujyje dėl sumažėjusios insulino gamybos arba insulino atsparumo / jautrumo sumažėjimo.
- ClinGen vertina ryšį kaip definityvų
- 4 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
- Įtrauktas į ACMG antrinių radinių sąrašą
▶Veiksmingumas
Teplizumabas (Tzield) 2 stadijos prasimptominiam 1 tipo diabetui (FDA patvirtintas 2022 m.); insulino pakaitinis gydymas, kai atsiranda klinikinių 1 tipo diabeto požymių; TrialNet autoantikūnų tyrimas didelės rizikos giminaičiams; uždaros grandinės insulino tiekimo sistemos
Subrandos jaunų suaugusiųjų diabetas (MODY)
- Autosominis dominantinis
MODY (subrandos jaunų suaugusiųjų diabetas) yra reta, paveldima, klinikiniu ir genetiniu požiūriu nevienalytė diabeto forma, pasireiškianti jaunam amžiui (paprastai 10–45 metų), išlaikoma endogeninė insulino gamyba, nėra kasos beta ląstelių autoimuniteto, nėra nutukimo ir insulino atsparumo, o kai kuriais pogrupiais – ir kasai nepriklausomų pasireiškimų.
- 3 GenCC pateikėjų vertina jį kaip definityvų arba stiprų
- Įtrauktas į ACMG antrinių radinių sąrašą
▶Veiksmingumas
GCK-MODY: gydyti nereikia; HNF1A/HNF4A-MODY: mažomis dozėmis sulfonilkarbamidai; HNF1B-MODY: insulinas ir inkstų stebėjimas; poligeninis 2 tipo diabetas: gyvensenos keitimas, metforminas, GLP-1 agonistai, SGLT2 inhibitoriai pagal kartu esančių ligų profilį
Kaip išdėstytas HNF1A
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 3,4 kb iš 24 kb geno; 1 896 šių bazių koduoja baltymą.
HNF1A sekvenavimas
246
pozicijų gene HNF1A, kuriose ClinVar pakitimą priskiria patogeniniam arba tikriausiai patogeniniam
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpieji skaitiniai sunkiai aptinka.
Visas genomas apima visus 24 kb geno HNF1A, įskaitant intronus, o ne tik 3,4 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (245)
Čia pateikiami HNF1A variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A15Gfs*15 | c.42_51delinsTG | Eksonas 1 | 120 978 810 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A116T | c.346G>A | Eksonas 2 | 120 988 852 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A116V | c.347C>T | Eksonas 2 | 120 988 853 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A209E | c.626C>A | Eksonas 3 | 120 993 619 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A209Sfs*11 | c.620dup | Eksonas 3 | 120 993 609 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A239T | c.715G>A | Eksonas 4 | 120 994 165 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A276D | c.827C>A | Eksonas 4 | 120 994 277 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A276G | c.827C>G | Eksonas 4 | 120 994 277 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A406V | c.1217C>T | Eksonas 6 | 120 996 650 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A501T | c.1501G>A | Eksonas 7 | 120 997 665 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
ClinVar pathogenic variants (322)
The HNF1A variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogeninis 148
- Patogeninis / tikriausiai patogeninis 1
- Tikriausiai patogeninis 173
| Variantas | Conditions | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|
| NG_011731.2:g.4741A>C | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.1A>G (p.Met1Val) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.1A>T (p.Met1Leu) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.2T>C (p.Met1Thr) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.4del (p.Val2fs) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.17G>A (p.Ser6Asn) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.19C>T (p.Gln7Ter) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.25C>T (p.Gln9Ter) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.42_51delinsTG (p.Ala15fs) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.58G>C (p.Gly20Arg) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.58G>A (p.Gly20Arg) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.68_69del (p.Lys23fs) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.71_72del (p.Glu24fs) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.94G>T (p.Glu32Ter) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.121G>T (p.Glu41Ter) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.130del (p.Leu44fs) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.129_130delinsA (p.Leu44fs) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.142del (p.Glu48fs) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.164_168del (p.Gly55fs) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.160C>T (p.Arg54Ter) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.185del (p.Asn62fs) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.196dup (p.Glu66fs) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.319C>A (p.Leu107Ile) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.319C>G (p.Leu107Val) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| NM_000545.8(HNF1A):c.320T>G (p.Leu107Arg) | monogenic diabetes | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
See all 322 with every other HNF1A variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ABCC8ATP binding cassette subfamily C member 8Turi 2 bendrų būklių
- APPL1adaptor protein, phosphotyrosine interacting with PH domain and leucine zipper 1Turi 2 bendrų būklių
- CELcarboxyl ester lipaseTuri 2 bendrų būklių
- GCKglucokinaseTuri 2 bendrų būklių
- HNF1BHNF1 homeobox BTuri 2 bendrų būklių
- HNF4Ahepatocyte nuclear factor 4 alphaTuri 2 bendrų būklių
- INSinsulinTuri 2 bendrų būklių
- KCNJ11potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 11Turi 2 bendrų būklių
- KLF11KLF transcription factor 11Turi 2 bendrų būklių
- NEUROD1neuronal differentiation 1Turi 2 bendrų būklių
- PDX1pancreatic and duodenal homeobox 1Turi 2 bendrų būklių
- AKT2AKT serine/threonine kinase 2Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su HNF1A
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti HNF1A, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Laboratory abnormality
- Decreased circulating 1,5 anhydroglucitol concentration
- Decreased circulating free fatty acid level
- Elevated circulating C-peptide concentration
- Hyperinsulinemic hypoglycemia
- Low blood sugar in newborn
- Abnormal circulating C-peptide concentration
- Abnormal oral glucose tolerance
- Glucose in urine
Rodyti dar 17 savybių
- Glucose intolerance
- High blood sugar
- Hyperinsulinemia
- Hypoglycemic seizures
- Hypoketotic hypoglycemia
- Low blood sugar after a meal
- Low blood sugar when fasting
- Maturity-onset diabetes of the young
- Insulin resistant diabetes
- Ketotic hypoglycemia
- Transient neonatal diabetes mellitus
- Body fails to respond to insulin
- Diabetes mellitus
- Diabetic ketoacidosis
- Ketoacidosis
- Noninsulin-dependent diabetes
- Type 1 diabetes
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai paimta
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo egzonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-18: su kokiomis ligomis genas siejamas ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir regionai, kuriuos trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.18-8b139e39.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). HNF1A genas: HNF1 homeobox A. Pasiekta 2026 m. spalio 19 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/hnf1a
Dante Labs. HNF1A genas: HNF1 homeobox A [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 19 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/hnf1a
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites