Geen
SLC35C1
solute carrier family 35 member C1
- HGNC 20197↗(avaneb uuel vahelehel)
- Ensembli geen ENSG00000181830↗(avaneb uuel vahelehel)
- NCBI Gene 55343↗(avaneb uuel vahelehel)
Kokkuvõte
- Tsütogeneetiline asukoht
- 11p11.2
- Koordinaadid
- Kromosoom 11: 45 805 149–45 813 016 (GRCh38)
- Eksonid
- 2 eksonit, ulatus 7,9 kb
- Valk
- 364 aminohapet
- Pärilikkus
- Autosoomne retsessiivne
- Tuntud ka kui
- FUCT1, FLJ11320
- MANE Select transkript
- ENST00000314134.4NM_018389.5
- Lookuse tüüp
- gene with protein product
- Väga kõrge
- Kindel
- Madal
- Väga madal
This page as data
Add .json to the page's address, or ask for application/json, to read it as JSON.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/slc35c1.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLoe SLC35C1 ja kogu oma genoom ühe testiga.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast
Telli oma Genome TestSelle geeniga seotud kureeritud aruanded
Glükosüleerimise kaasasündinud häired
- SLC35C1-CDG (leukotsüütide adhesiooni puudulikkus, II tüüp)Autosoomne retsessiivne
Glükosüleerimise kaasasündinud häire, mida põhjustavad fukoosi transporteri geeni SLC35C1 variandid; sellega kaasnevad korduvad infektsioonid, väga kõrge valgeliblede arv ning kasvu ja arengu viivitus.
- ClinGen hindab seost tasemel tugev
- 5 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Tegevusvõimalikkus
Suukaudsed fukoosilisandid võivad mõnel inimesel vähendada infektsioone.
- Glükosüleerimise kaasasündinud häired (CDG)
Üks 98 sellega seotud geenist
Suur rühm pärilikke haigusi, mille puhul suhkruahelad (glükaanid) ei moodustu ega kinnitu valkudele ja lipiididele õigesti; need mõjutavad sageli aju, maksa, vere hüübimist, kasvu ja paljusid teisi elundisüsteeme. Enamik neist on autosomaalselt retsessiivse pärilikkusega, kuid osa on X-seotud või autosomaalselt dominantse pärilikkusega.
- ClinGen hindab seost tasemel tugev
- 5 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Leukotsüütide adhesioonidefekt
- Autosoomne retsessiivne
Valgete vererakkude kleepumisvõime defekt, mis on põhjustatud muutustest kummagi koopia geenis ITGB2, SLC35C1 või FERMT3.
- ClinGen hindab seost tasemel tugev
- 5 GenCC esitajat hindavad seda kindlaks või tugevaks
Tegevusvõimalikkus
Raskeid vorme ravitakse tüvirakkude siirdamisega; 2. tüübi puhul võib abi olla suukaudsest fukoosist, infektsioonide ennetamiseks aitavad antibiootikumiline profülaktika ja hambaravi.
Pärandumine
- Autosoomne retsessiivne
- Selleks on vaja muudetud koopiat kummastki vanemast. Ühe koopia korral oled kandja ja tavaliselt ei avaldu see sinul haigusena; kui mõlemad vanemad on kandjad, on igal lapsel neljast ühe võimalus pärida kaks koopiat.
Kuidas SLC35C1 on üles ehitatud
- Kodeeriv järjestus
- Transleerimata piirkond
- Intron
- Transkriptsiooni suund
- Teadaolevad haigust põhjustavad kohad
- Lõigud, mida lühikeste lugemite meetod raskesti tuvastab
Geeni MANE Select transkripti eksonid (versioon v1.5), allikad NCBI ja EMBL-EBI, referentsgenoomi GRCh38 alusel.
Kromosoomi ribad UCSC GRCh38 ideogrammilt (2022-10-29).
Lähedased geenid Ensembli versioonist 116, GRCh38 järgi.
Eksonid moodustavad geenist 3,4 kb kogupikkusega 7,9 kb; neist 1095 alust kodeerivad valku.
Sekveneerimine: SLC35C1
8
SLC35C1 positsioonid, kus ClinVar liigitab muutuse patogeenseks või tõenäoliselt patogeenseks
Neist ükski ei asu piirkonnas, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
Terve genoom katab kogu SLC35C1 geeni 7,9 kb ulatuses, sealhulgas intronid, mitte ainult 3,4 kb eksoneid.
Samade haigustega seotud geenid
- A4GALTalpha 1,4-galactosyltransferase (P1PK blood group)Jagab 1 haigust
- ALG1ALG1 chitobiosyldiphosphodolichol beta-mannosyltransferaseJagab 1 haigust
- ALG11ALG11 alpha-1,2-mannosyltransferaseJagab 1 haigust
- ALG12ALG12 alpha-1,6-mannosyltransferaseJagab 1 haigust
- ALG13ALG13 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitJagab 1 haigust
- ALG14ALG14 UDP-N-acetylglucosaminyltransferase subunitJagab 1 haigust
- ALG2ALG2 alpha-1,3/1,6-mannosyltransferaseJagab 1 haigust
- ALG3ALG3 alpha-1,3- mannosyltransferaseJagab 1 haigust
- ALG6ALG6 alpha-1,3-glucosyltransferaseJagab 1 haigust
- ALG8ALG8 alpha-1,3-glucosyltransferaseJagab 1 haigust
- ALG9ALG9 alpha-1,2-mannosyltransferaseJagab 1 haigust
- ATP6AP1ATPase H+ transporting accessory protein 1Jagab 1 haigust
Geeniga SLC35C1 seotud tunnused
Human Phenotype Ontology loetleb need tunnustena harvaesinevatele haigustele, mida SLC35C1 võib põhjustada. Iga tunnuse lehel on loetletud teised selle tunnusega seotud geenid.
Abnormality of the nervous system
- Autism spectrum disorder
- Delayed speech and language development
- Global developmental delay
- Intellectual disability, severe
- Anxiety
- Autism
- Degeneration of cerebrum
- Difficulty sleeping
Näita veel 10 tunnust
Välised lingid
Geenikirjed
Transkript
Valk
Kust see pärineb
- HGNC: geeni sümbol, nimi, muud sümbolid ja asukoht.
- MANE Select v1.5, NCBI ja EMBL-EBI andmetel: transkript, selle eksonid ja kodeeriv järjestus.
- GenCC ja ClinGen, väljaanne 2026-10-16: milliste haigustega geen on seotud ja kui tugevalt.
- ACMG sekundaarsete leidude loend, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-i stratifikatsioonid: teadaolevad haigusi põhjustavad kohad ning piirkonnad, mida lühikesed lugemid raskesti tuvastavad.
- Human Phenotype Ontology, väljaanne 2026-09-01: geeniga seotud tunnused. Lisateavet leiate aadressilt hpo.jax.org.
- Andmeväljaanne 2026.10.16-c6eea6bf.
Viita sellele lehele
Dante Labs. (n.d.). SLC35C1 geen: solute carrier family 35 member C1. Vaadatud 17. oktoober 2026, allikas: https://dantelabs.com/et/genes/slc35c1
Dante Labs. SLC35C1 geen: solute carrier family 35 member C1 [Internet]. [viidatud 17. oktoober 2026]. Saadaval: https://dantelabs.com/et/genes/slc35c1
Üks test. Vastused kogu eluks.
Alates 449 $Tasuta kohaletoimetamine · Tulemused 6–8 nädala pärast