Gen
CAPN3
calpain 3
- HGNC 1480↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de Ensembl ENSG00000092529↗(se abre en una pestaña nueva)
- Gen de NCBI 825↗(se abre en una pestaña nueva)
Resumen
- Localización citogenética
- 15q15.1
- Coordenadas
- Cromosoma 15: 42.359.501–42.412.317 (GRCh38)
- Exones
- 24 exones en 52,8 kb
- Proteína
- 821 aminoácidos
- También conocido como
- CANP3, p94, nCL-1
- Símbolos anteriores
- LGMD2, LGMD2A
- Transcrito MANE Select
- ENST00000397163.8NM_000070.3
- Tipo de locus
- gene with protein product
- Muy alta
- Alta
- Baja
- Muy baja
Genoma de referenciaGRCh38hg38
Las posiciones en las páginas de genes y variantes siguen esta elección, en este navegador.
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Distrofia muscular de cinturas
La distrofia muscular de cinturas comprende un conjunto de numerosos subtipos con diferentes patrones de herencia (cuya validez diagnóstica también varía). Se recomienda a las personas portadoras de variantes relacionadas con esta afección que consulten a un especialista musculoesquelético para obtener un diagnóstico definitivo.
- ClinGen califica la relación como definitiva
- 4 remitentes de GenCC la califican como definitiva o fuerte
Estructura de CAPN3
- Secuencia codificante
- Región no traducida
- Intrón
- Sentido de la transcripción
- Sitios conocidos que causan enfermedad
- Regiones que las lecturas cortas tienen dificultad para leer
- Variantes con una página
Exones del transcrito MANE Select del gen (versión v1.5), de NCBI y EMBL-EBI, sobre el genoma de referencia GRCh38.
Bandas cromosómicas del ideograma GRCh38 de UCSC (2022-10-29).
Genes cercanos de Ensembl, versión 116, en GRCh38.
Los exones suman 3,3 kb de los 52,8 kb del gen; 2466 de esas bases codifican la proteína.
Cómo lee una prueba genómica el gen CAPN3
452
posiciones en CAPN3 donde ClinVar clasifica un cambio como patogénico o probablemente patogénico
Ninguna de ellas cae en una región que las lecturas cortas tienen dificultad para leer.
Un genoma completo cubre los 52,8 kb de CAPN3, incluidos los intrones, y no solo los 3,3 kb de exones.
Variantes con una página (80)
Las variantes de CAPN3 con una página aquí, primero las de más estrellas de revisión. Cada página describe el registro público de ClinVar sobre la variante, nunca un resultado.
| Variante | HGVS c. | Exón o intrón | Posición (GRCh38) | Clasificación en ClinVar | Estado de revisión |
|---|---|---|---|---|---|
| A702V | c.2105C>T | Exón 19 | 42.409.985 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| A798E | c.2393C>A | Exón 23 | 42.411.299 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
| c.499-1G>A | Intrón 3 | 42.387.752 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.1115+5G>C | Intrón 8 | 42.394.346 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.1194-2A>G | Intrón 9 | 42.399.490 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.1194-2del | Intrón 9 | 42.399.489 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.1194-9A>G | Intrón 9 | 42.399.483 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.1524G>A | Exón 11 | 42.401.810 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.1746-20C>G | Intrón 13 | 42.403.721 | Patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos | |
| c.1782G>A | Exón 14 | 42.403.777 | Probablemente patogénica | ★★★★3 estrellas de 4 revisada por un panel de expertos |
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- DYSFdysferlinComparte 1 afección
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- FKTNfukutinComparte 1 afección
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Rasgos asociados a CAPN3
La Human Phenotype Ontology recoge estos rasgos como características de las enfermedades raras que CAPN3 puede causar. La página de cada rasgo enumera los demás genes asociados a él.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Muscle eosinophilia
- Generalized muscle weakness
- Flexed joint that cannot be straightened
- Hamstring contractures
- Muscular dystrophy
- Prominent swayback
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced spine movement
Mostrar 10 rasgos más
Enlaces externos
Registros del gen
Transcrito
Proteína
Origen de estos datos
- HGNC: el símbolo del gen, su nombre, otros símbolos y su ubicación.
- MANE Select v1.5, de NCBI y EMBL-EBI: el transcrito, sus exones y la secuencia codificante.
- GenCC y ClinGen, publicados en 2026-10-16: a qué afecciones está vinculado el gen y con qué grado de solidez.
- La lista ACMG de hallazgos secundarios, SF v3.2.
- ClinVar y las estratificaciones de GIAB: sitios conocidos que causan enfermedad, y las regiones que las lecturas cortas encuentran difíciles.
- Human Phenotype Ontology, versión 2026-09-01: los rasgos asociados al gen. Más información en hpo.jax.org.
- Versión de datos 2026.10.16-c6eea6bf.
Citar esta página
Dante Labs. (s. f.). Gen CAPN3: calpain 3. Consultado el 16 de octubre de 2026, en https://dantelabs.com/es/genes/capn3
Dante Labs. Gen CAPN3: calpain 3 [Internet]. [citado 16 de octubre de 2026]. Disponible en: https://dantelabs.com/es/genes/capn3
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