Gen
CAPN3
calpain 3
- HGNC 1480↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- Ensembl-Gen ENSG00000092529↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
- NCBI Gene 825↗(öffnet sich in einem neuen Tab)
Zusammenfassung
- Zytogenetische Lage
- 15q15.1
- Koordinaten
- Chromosom 15: 42.359.501–42.412.317 (GRCh38)
- Exons
- 24 Exons über 52,8 kb
- Protein
- 821 Aminosäuren
- Auch bekannt als
- CANP3, p94, nCL-1
- Frühere Symbole
- LGMD2, LGMD2A
- MANE-Select-Transkript
- ENST00000397163.8NM_000070.3
- Locus-Typ
- gene with protein product
- Sehr hoch
- Zuversichtlich
- Niedrig
- Sehr niedrig
ReferenzgenomGRCh38hg38
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Gliedergürtel-Muskeldystrophie
Die Gliedergürtel-Muskeldystrophie umfasst eine Reihe verschiedener Subtypen mit unterschiedlichen Vererbungsmustern (wobei auch die diagnostische Aussagekraft variiert). Personen, bei denen mit der Erkrankung assoziierte Varianten festgestellt wurden, sollten sich für eine gesicherte Diagnose an eine Fachärztin oder einen Facharzt für Muskel- und Skeletterkrankungen wenden.
- ClinGen stuft die Verbindung als eindeutig ein
- 4 GenCC-Einreicher bewerten ihn als eindeutig oder stark
Aufbau von CAPN3
- Kodierende Sequenz
- Nicht translatierte Region
- Intron
- Transkriptionsrichtung
- Bekannte krankheitsverursachende Stellen
- Abschnitte, die Short Reads schwer erfassen
- Varianten mit Seite
Exons des MANE-Select-Transkripts des Gens (Version v1.5) von NCBI und EMBL-EBI, bezogen auf das Referenzgenom GRCh38.
Chromosomenbanden aus dem UCSC-Ideogramm GRCh38 (2022-10-29).
Benachbarte Gene aus Ensembl-Version 116 auf GRCh38.
Exons machen 3,3 kb der 52,8 kb des Gens aus; 2.466 dieser Basen kodieren für das Protein.
So liest ein Gentest CAPN3
452
Positionen in CAPN3, an denen ClinVar eine Veränderung als pathogen oder wahrscheinlich pathogen einstuft
Keine davon liegt in einem Bereich, den Short Reads schwer erfassen.
Ein Ganzgenom-Test erfasst alle 52,8 kb von CAPN3, einschließlich der Introns, und nicht nur die 3,3 kb Exons.
Varianten mit Seite (80)
Die CAPN3-Varianten mit Seite hier, zuerst die mit den meisten Review-Sternen. Jede Seite beschreibt den öffentlichen Eintrag von ClinVar zur Variante, niemals ein Ergebnis.
| Variante | HGVS c. | Exon oder Intron | Position (GRCh38) | ClinVar-Klassifikation | Überprüfungsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A702V | c.2105C>T | Exon 19 | 42.409.985 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| A798E | c.2393C>A | Exon 23 | 42.411.299 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
| c.499-1G>A | Intron 3 | 42.387.752 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.1115+5G>C | Intron 8 | 42.394.346 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.1194-2A>G | Intron 9 | 42.399.490 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.1194-2del | Intron 9 | 42.399.489 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.1194-9A>G | Intron 9 | 42.399.483 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.1524G>A | Exon 11 | 42.401.810 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.1746-20C>G | Intron 13 | 42.403.721 | Pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft | |
| c.1782G>A | Exon 14 | 42.403.777 | Wahrscheinlich pathogen | ★★★★3 Sterne von 4 Von Expertengremium geprüft |
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Mit CAPN3 verknüpfte Merkmale
Die Human Phenotype Ontology führt diese als Merkmale der seltenen Erkrankungen auf, die CAPN3 verursachen kann. Auf der Seite jedes Merkmals sind die anderen Gene aufgeführt, die damit in Verbindung stehen.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Muscle eosinophilia
- Generalized muscle weakness
- Flexed joint that cannot be straightened
- Hamstring contractures
- Muscular dystrophy
- Prominent swayback
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced spine movement
10 weitere Merkmale anzeigen
Externe Links
Gendatensätze
Transkript
Protein
Woher diese Angaben stammen
- HGNC: das Symbol des Gens, sein Name, weitere Symbole und seine Lage.
- MANE Select v1.5, von NCBI und EMBL-EBI: das Transkript, seine Exons und die kodierende Sequenz.
- GenCC und ClinGen, veröffentlicht 2026-10-16: welche Erkrankungen mit dem Gen in Verbindung stehen und wie stark dieser Zusammenhang ist.
- Die ACMG-Liste sekundärer Befunde, SF v3.2.
- ClinVar und die GIAB-Stratifizierungen: bekannte krankheitsverursachende Stellen sowie Regionen, die Kurzlesesequenzierung schwer erfassen kann.
- Human Phenotype Ontology, Version 2026-09-01: die mit dem Gen verknüpften Merkmale. Weitere Informationen unter hpo.jax.org.
- Datenversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Diese Seite zitieren
Dante Labs. (o. J.). CAPN3-Gen: calpain 3. Abgerufen am 16. Oktober 2026, von https://dantelabs.com/de/genes/capn3
Dante Labs. CAPN3-Gen: calpain 3 [Internet]. [zitiert am 16. Oktober 2026]. Verfügbar unter: https://dantelabs.com/de/genes/capn3
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