Gen
CAPN3
calpain 3
- HGNC 1480↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000092529↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 825↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 15q15.1
- Współrzędne
- Chromosom 15: 42 359 501–42 412 317 (GRCh38)
- Eksony
- 24 eksonów na odcinku 52,8 kb
- Białko
- 821 aminokwasów
- Znany również jako
- CANP3, p94, nCL-1
- Poprzednie symbole
- LGMD2, LGMD2A
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000397163.8NM_000070.3
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Genom referencyjnyGRCh38hg38
Pozycje na stronach genów i wariantów zależą od tego wyboru, w tej przeglądarce.
Odczytaj CAPN3 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowany raport dotyczący tego genu
Dystrofia mięśniowa kończynowo-obręczowa
Dystrofia mięśniowa kończynowo-obręczowa jest określeniem obejmującym liczne podtypy o różnych wzorcach dziedziczenia (a także różnej wystarczalności diagnostycznej). Osoby, u których wykryto warianty związane z tym schorzeniem, powinny zasięgnąć porady specjalisty chorób mięśniowo-szkieletowych w celu postawienia ostatecznej diagnozy.
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 4 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Budowa genu CAPN3
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
- Warianty z podstroną
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 3,3 kb z 52,8 kb genu; 2466 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje CAPN3
452
pozycje w CAPN3, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 52,8 kb genu CAPN3, łącznie z intronami, a nie tylko 3,3 kb eksonów.
Warianty z podstroną (80)
Warianty CAPN3 z podstronami tutaj, najpierw te z największą liczbą gwiazdek recenzji. Każda podstrona opisuje publiczny zapis ClinVar dotyczący wariantu, a nie wynik.
| Wariant | HGVS c. | Ekson lub intron | Pozycja (GRCh38) | Klasyfikacja ClinVar | Status recenzji |
|---|---|---|---|---|---|
| A702V | c.2105C>T | Ekson 19 | 42 409 985 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| A798E | c.2393C>A | Ekson 23 | 42 411 299 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
| c.499-1G>A | Intron 3 | 42 387 752 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1115+5G>C | Intron 8 | 42 394 346 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1194-2A>G | Intron 9 | 42 399 490 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1194-2del | Intron 9 | 42 399 489 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1194-9A>G | Intron 9 | 42 399 483 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1524G>A | Ekson 11 | 42 401 810 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1746-20C>G | Intron 13 | 42 403 721 | Patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów | |
| c.1782G>A | Ekson 14 | 42 403 777 | Prawdopodobnie patogenny | ★★★★3 gwiazdek z 4 zweryfikowane przez panel ekspertów |
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- ANO5anoctamin 5Wspólne schorzenie: 1
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainWspólne schorzenie: 1
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainWspólne schorzenie: 1
- DAG1dystroglycan 1Wspólne schorzenie: 1
- DNAJB6DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6Wspólne schorzenie: 1
- DYSFdysferlinWspólne schorzenie: 1
- FKRPfukutin related proteinWspólne schorzenie: 1
- FKTNfukutinWspólne schorzenie: 1
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BWspólne schorzenie: 1
- HMGCR3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductaseWspólne schorzenie: 1
- HNRNPDLheterogeneous nuclear ribonucleoprotein D likeWspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem CAPN3
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać CAPN3. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Muscle eosinophilia
- Generalized muscle weakness
- Flexed joint that cannot be straightened
- Hamstring contractures
- Muscular dystrophy
- Prominent swayback
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced spine movement
Pokaż jeszcze 10 cech
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen CAPN3: calpain 3. Pobrano 16 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/capn3
Dante Labs. Gen CAPN3: calpain 3 [Internet]. [cytowano 16 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/capn3
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni