Genas
CAPN3
calpain 3
- HGNC 1480↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000092529↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 825↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 15q15.1
- Koordinatės
- Chromosoma 15: 42 359 501–42 412 317 (GRCh38)
- Eksonai
- 24 eksonų per 52,8 kb
- Baltymas
- 821 aminorūgštis
- Taip pat žinomas kaip
- CANP3, p94, nCL-1
- Ankstesni simboliai
- LGMD2, LGMD2A
- MANE Select transkriptas
- ENST00000397163.8NM_000070.3
- Lokuso tipas
- gene with protein product
- Labai aukštas
- Patikimas
- Žemas
- Labai žemas
Perskaitykite CAPN3 ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruota ataskaita, susijusi su šiuo genu
Dvipusė juostinė raumenų distrofija
Dvipusė juostinė raumenų distrofija apibrėžiama kaip daugybė potipių, turinčių skirtingus paveldėjimo būdus (be to, diagnozės pakankamumas taip pat skiriasi). Jūs, jei esate šių su liga susijusių variantų nešiotojas, dėl galutinės diagnozės turėtumėte kreiptis konsultacijos į raumenų ir kaulų sistemos specialistą.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 4 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Kaip išdėstytas CAPN3
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 3,3 kb iš 52,8 kb geno; 2 466 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito CAPN3
452
CAPN3 geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 52,8 kb CAPN3 geno, įskaitant intronus, o ne tik 3,3 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (80)
Čia pateikiami CAPN3 variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A702V | c.2105C>T | Eksonas 19 | 42 409 985 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| A798E | c.2393C>A | Eksonas 23 | 42 411 299 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| c.499-1G>A | Intronas 3 | 42 387 752 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.1115+5G>C | Intronas 8 | 42 394 346 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.1194-2A>G | Intronas 9 | 42 399 490 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.1194-2del | Intronas 9 | 42 399 489 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.1194-9A>G | Intronas 9 | 42 399 483 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.1524G>A | Eksonas 11 | 42 401 810 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.1746-20C>G | Intronas 13 | 42 403 721 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.1782G>A | Eksonas 14 | 42 403 777 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- ANO5anoctamin 5Turi 1 bendrą būklę
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainTuri 1 bendrą būklę
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainTuri 1 bendrą būklę
- DAG1dystroglycan 1Turi 1 bendrą būklę
- DNAJB6DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6Turi 1 bendrą būklę
- DYSFdysferlinTuri 1 bendrą būklę
- FKRPfukutin related proteinTuri 1 bendrą būklę
- FKTNfukutinTuri 1 bendrą būklę
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BTuri 1 bendrą būklę
- HMGCR3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductaseTuri 1 bendrą būklę
- HNRNPDLheterogeneous nuclear ribonucleoprotein D likeTuri 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su CAPN3
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti CAPN3, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Muscle eosinophilia
- Generalized muscle weakness
- Flexed joint that cannot be straightened
- Hamstring contractures
- Muscular dystrophy
- Prominent swayback
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced spine movement
Rodyti dar 10 savybių
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). CAPN3 genas: calpain 3. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/capn3
Dante Labs. CAPN3 genas: calpain 3 [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/capn3
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites