Gen
CAPN3
calpain 3
- HGNC 1480↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000092529↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 825↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 15q15.1
- Coördinaten
- Chromosoom 15: 42.359.501–42.412.317 (GRCh38)
- Exons
- 24 exons over 52,8 kb
- Eiwit
- 821 aminozuren
- Ook bekend als
- CANP3, p94, nCL-1
- Eerdere symbolen
- LGMD2, LGMD2A
- MANE Select-transcript
- ENST00000397163.8NM_000070.3
- Type locus
- gene with protein product
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
ReferentiegenoomGRCh38hg38
Posities op gen- en variantpagina's volgen deze keuze, in deze browser.
Lees CAPN3 en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerd rapport over dit gen
Gordelspierdystrofie
Gordelspierdystrofie wordt gedefinieerd als een verzameling van talrijke subtypen met verschillende overervingspatronen (waarbij ook de mate waarin een diagnose met zekerheid kan worden gesteld, varieert). Dragers van varianten die verband houden met deze aandoening dienen advies in te winnen bij een specialist in de spier- en skeletaandoeningen voor een definitieve diagnose.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
Opbouw van CAPN3
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
- Varianten met een pagina
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 3,3 kb van de 52,8 kb van het gen; 2.466 van die basen coderen voor het eiwit.
Hoe een genoomtest CAPN3 leest
452
posities in CAPN3 waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
Geen daarvan valt in een gebied dat korte reads moeilijk vinden.
Een volledig genoom dekt alle 52,8 kb van CAPN3, inclusief introns, en niet alleen de 3,3 kb aan exonen.
Varianten met een pagina (80)
De CAPN3-varianten met een pagina hier, eerst die met de meeste reviewsterren. Elke pagina beschrijft het openbare ClinVar-dossier van de variant, nooit een uitslag.
| Variant | HGVS c. | Exon of intron | Positie (GRCh38) | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A702V | c.2105C>T | Exon 19 | 42.409.985 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| A798E | c.2393C>A | Exon 23 | 42.411.299 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
| c.499-1G>A | Intron 3 | 42.387.752 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.1115+5G>C | Intron 8 | 42.394.346 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.1194-2A>G | Intron 9 | 42.399.490 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.1194-2del | Intron 9 | 42.399.489 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.1194-9A>G | Intron 9 | 42.399.483 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.1524G>A | Exon 11 | 42.401.810 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.1746-20C>G | Intron 13 | 42.403.721 | Pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel | |
| c.1782G>A | Exon 14 | 42.403.777 | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★3 sterren van de 4 beoordeeld door expertpanel |
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- ANO5anoctamin 5Deelt 1 aandoening
- COL6A1collagen type VI alpha 1 chainDeelt 1 aandoening
- COL6A2collagen type VI alpha 2 chainDeelt 1 aandoening
- COL6A3collagen type VI alpha 3 chainDeelt 1 aandoening
- DAG1dystroglycan 1Deelt 1 aandoening
- DNAJB6DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B6Deelt 1 aandoening
- DYSFdysferlinDeelt 1 aandoening
- FKRPfukutin related proteinDeelt 1 aandoening
- FKTNfukutinDeelt 1 aandoening
- GMPPBGDP-mannose pyrophosphorylase BDeelt 1 aandoening
- HMGCR3-hydroxy-3-methylglutaryl-CoA reductaseDeelt 1 aandoening
- HNRNPDLheterogeneous nuclear ribonucleoprotein D likeDeelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan CAPN3
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die CAPN3 kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the musculoskeletal system
- Muscle eosinophilia
- Generalized muscle weakness
- Flexed joint that cannot be straightened
- Hamstring contractures
- Muscular dystrophy
- Prominent swayback
- Proximal neurogenic muscle weakness
- Reduced spine movement
Toon 10 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool van het gen, de naam, andere symbolen en de locatie.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht 2026-10-16: aan welke aandoeningen het gen is gekoppeld, en hoe sterk dat verband is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende plaatsen en de regio's waar korte reads moeite mee hebben.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.16-c6eea6bf.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). CAPN3-gen: calpain 3. Geraadpleegd op 17 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/capn3
Dante Labs. CAPN3-gen: calpain 3 [Internet]. [geraadpleegd 17 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/capn3
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken