Gen
SMARCB1
SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit B1
- HGNC 11103↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000099956↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 6598↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 22q11.23
- Koordinater
- Kromosom 22: 23.786.966–23.838.009 (GRCh38)
- Exoner
- 9 exoner fordelt over 51 kb
- Protein
- 385 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal dominant
- Også kendt som
- BAF47, Ini1, INI-1, Snr1, hSNFS, Sfh1p, RDT, PPP1R144, SNF5
- Tidligere symboler
- SNF5L1
- MANE Select-transkript
- ENST00000644036.2NM_003073.5
- Lokustype
- gene with protein product
- Meget høj
- Sikker
- Lav
- Meget lav
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs SMARCB1 og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Neurofibromatose
- Autosomal dominant
Et arveligt neoplastisk syndrom, hvor svulster vokser i nervesystemet. Der anerkendes typisk 3 hovedtyper, men der findes også andre former med usikker ætiologi.
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Genotype-fænotype-korrelation, MEK-hæmmerbehandling af ikke-opererbare plexiforme neurofibromer, tumorovervågning, kaskadetestning
Rhabdoidtumor og SWI/SNF-tumorpredisposition
- Familiær rhabdoidtumorAutosomal dominant
SMARCB1- eller SMARCA4-relateret predisposition til atypiske teratoide/rhabdoide tumorer i hjernen og rhabdoidtumorer i nyren og blødt væv i den tidlige barndom; SMARCA4 forårsager desuden småcellet karcinom i ovariet.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
Billeddiagnostik af hjerne og abdomen i den tidlige barndom; slægtninge kan tilbydes test.
Bredere grupperinger
Intellektuel funktionsnedsættelse
Et af 233 gener, der er knyttet til det
- 3 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Arvegang
- Autosomal dominant
- Én ændret kopi, fra enten far eller mor, er nok. En forælder med én ændret kopi overfører den til hvert barn med en chance på en ud af to.
Sådan er SMARCB1 opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 5,2 kb af genets 51 kb; 1.158 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest SMARCB1
68
positioner i SMARCB1, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 51 kb af SMARCB1, inklusive introner, og ikke kun de 5,2 kb eksoner.
Gener knyttet til de samme sygdomme
- SMARCA4SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit ATPase 4Deler 2 sygdomme
- ACSL4acyl-CoA synthetase long chain family member 4Deler 1 sygdom
- ADKadenosine kinaseDeler 1 sygdom
- ADNPactivity dependent neuroprotector homeoboxDeler 1 sygdom
- AFF2ALF transcription elongation factor 2Deler 1 sygdom
- AHDC1AT-hook DNA binding motif containing 1Deler 1 sygdom
- ALKBH8alkB homolog 8, tRNA methyltransferaseDeler 1 sygdom
- ANK3ankyrin 3Deler 1 sygdom
- ANKRD11ankyrin repeat domain 11Deler 1 sygdom
- AP1S2adaptor related protein complex 1 subunit sigma 2Deler 1 sygdom
- AP2M1adaptor related protein complex 2 subunit mu 1Deler 1 sygdom
- ARHGEF9Cdc42 guanine nucleotide exchange factor 9Deler 1 sygdom
Træk knyttet til SMARCB1
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, SMARCB1 kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the nervous system
- Abnormal corpus callosum morphology
- Global developmental delay
- Schwannoma
- Intracranial meningioma
- Irritability
- Lack of feeling, emotion, interest
- Malignant neoplasm of the central nervous system
- Abnormal brain FDG positron emission tomography
Vis 46 træk mere
- Ataxia
- Behavioral abnormality
- Disturbances of consciousness
- Epilepsy
- Focal T2 hypointense thalamic lesion
- Headache
- Intellectual disability, severe
- IQ between 34 and 49
- Migraine
- Paralysis or weakness of one side of body
- Seizure affecting one half of brain
- Small cerebellum
- Spinal cord tumor
- Too much cerebrospinal fluid in the brain
- Abnormal central motor function
- Abnormal central sensory function
- Abnormal gait
- Abnormality of the cerebellum
- Absent speech development
- Agenesis of corpus callosum
- Aggressive behavior
- Autism spectrum disorder
- Cerebral palsy
- Cognitive impairment
- Cranial nerve paralysis
- Memory impairment
- More active than typical
- Oral aversion
- Pins and needles feeling
- Rise in pressure inside skull
- Simplified gyral pattern
- Spinal meningioma
- Trigeminal neuralgia
- Weakness of one side of body
- Abnormal speech pattern
- Brain stem compression
- Can't control feelings
- Excessive daytime sleepiness
- Muscle twitch
- Noncancerous growth of membranes covering brain
- Numbness
- Spasms on one side of the face
- Transient global amnesia
- Choroid plexus carcinoma
- Intellectual disability
- Medulloblastoma
Abnormality of head or neck
- Coarse facial features
- Delayed eruption of permanent teeth
- Full lips
- High palate
- Long eyelashes
- Sparse scalp hair
- Thick eyebrow
- Wide mouth
Vis 24 træk mere
- Wide nose
- Full lower lip
- Prominent eyelashes
- Abnormal facial shape
- Abnormally large tongue
- Abnormally small head
- Big calvaria
- Broad nasal tip
- Broad philtrum
- Cleft palate
- Delayed eruption of teeth
- Depressed nasal bridge
- Long philtrum
- Low frontal hairline
- Nasal tip, upturned
- Recurrent colds
- Short nose
- Thick nasal alae
- Thin red part of the upper lip
- Wide nasal base
- Abnormality of the sense of smell
- Bell's palsy
- Dandy-Walker malformation
- Neoplasm of the tongue
Abnormality of the endocrine system
- Decreased circulating ACTH concentration
- Decreased circulating follicle stimulating hormone concentration
- Decreased circulating luteinizing hormone level
- Decreased serum estradiol
- Decreased serum testosterone level
- Hypogonadotropic hypogonadism
- Increased circulating prolactin concentration
- Low blood cortisol level
Vis 9 træk mere
- Low thyroid gland function due to abnormal pituitary gland
- Secondary growth hormone deficiency
- Abnormal hypothalamus physiology
- Enlarged pituitary gland
- Hypothalamic hypothyroidism
- Neoplasm of the anterior pituitary
- Reduced circulating prolactin concentration
- Neoplasm of the posterior pituitary
- Papillary thyroid carcinoma
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). SMARCB1-genet: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit B1. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/smarcb1
Dante Labs. SMARCB1-genet: SWI/SNF related BAF chromatin remodeling complex subunit B1 [Internet]. [citeret 16. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/smarcb1
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger