Gen
USH2A
usherin
- HGNC 12601↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000042781↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 7399↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 1q41
- Souřadnice
- Chromozom 1: 215 622 891–216 423 448 (GRCh38)
- Exony
- 72 exonů na 800,6 kb
- Protein
- 5 202 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Další názvy
- USHRN, RP39
- Předchozí symboly
- USH2
- Transkript MANE Select
- ENST00000307340.8NM_206933.4
- Typ lokusu
- gene with protein product
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si USH2A i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorované reporty související s tímto genem
Usher Syndrome
- Autozomálně recesivní
A group of recessive conditions (types 1 to 4) causing sensorineural hearing loss, progressive retinitis pigmentosa and, in some types, balance problems, linked to genes such as USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 and ARSG.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 5 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
An early diagnosis helps with decisions about the timing of cochlear implants, eye monitoring and eligibility for retinal therapy trials, and is relevant to carrier screening.
Širší skupiny
Retinitis Pigmentosa
Jeden z 77 genů spojených s touto vazbou
A group of inherited retinal dystrophies with progressive loss of rod and then cone photoreceptors, causing night blindness and gradual loss of peripheral vision.
- 2 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Dědičnost
- Autozomálně recesivní
- Je potřeba změněná kopie od každého z rodičů. S jednou kopií jste nositelem a obvykle nejste postiženi; pokud jsou oba rodiče nositeli, má každé dítě pravděpodobnost jedna ku čtyřem, že zdědí dvě.
Jak je USH2A uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
- Varianty se stránkou
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 18,9 kb z 800,6 kb genu; 15 609 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte USH2A
1 263
pozic v genu USH2A, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 800,6 kb genu USH2A, včetně intronů, nikoli jen 18,9 kb exonů.
Varianty se stránkou (20)
Varianty genu USH2A se stránkou zde, nejdříve ty s nejvyšším počtem hvězdiček hodnocení. Každá stránka popisuje veřejný záznam ClinVar o variantě, nikoli výsledek.
| Varianta | HGVS c. | Exon nebo intron | Pozice (GRCh38) | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|---|---|
| A4740D | c.14219C>A | Exon 65 | 215 650 716 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| c.5857+2T>C | Intron 29 | 216 072 887 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.8559-2A>G | Intron 42 | 215 877 882 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.8682-9A>G | Intron 43 | 215 867 179 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| c.12295-3T>A | Intron 62 | 215 675 619 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem | |
| C319Y | c.956G>A | Exon 6 | 216 325 492 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| C620F | c.1859G>T | Exon 11 | 216 289 392 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| C694Y | c.2081G>A | Exon 12 | 216 250 989 | Pravděpodobně patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| C759F | c.2276G>T | Exon 13 | 216 247 118 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
| C1447Qfs*29 | c.4338_4339del | Exon 20 | 216 190 279 | Patogenní | ★★★★3 hvězdiček z 4 Posouzeno odborným panelem |
Geny spojené se stejnými onemocněními
- CLRN1clarin 1Sdílí 2 onemocnění
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Sdílí 1 onemocnění
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V1Sdílí 1 onemocnění
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Sdílí 1 onemocnění
- AHRaryl hydrocarbon receptorSdílí 1 onemocnění
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Sdílí 1 onemocnění
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinSdílí 1 onemocnění
- ARL3ARF like GTPase 3Sdílí 1 onemocnění
- ARL6ARF like GTPase 6Sdílí 1 onemocnění
- ARSGarylsulfatase GSdílí 1 onemocnění
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Sdílí 1 onemocnění
- BEST1bestrophin 1Sdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s USH2A
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit USH2A. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the eye
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blind spot
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Light eye color
- Optic atrophy
Zobrazit ještě 27 rysů
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Rod-cone dystrophy
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Visual loss
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Close sighted
- Clouding of the lens of the eye
- Cystoid macular edema
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Limited peripheral vision
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Photopsia
- Reduced contrast sensitivity
- Partial loss of field of vision
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen USH2A: usherin. Staženo 17. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/ush2a
Dante Labs. Gen USH2A: usherin [Internet]. [citováno 17. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/ush2a
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů