Genas
USH2A
usherin
- HGNC 12601↗(atsidaro naujame skirtuke)
- Ensembl genas ENSG00000042781↗(atsidaro naujame skirtuke)
- NCBI Gene 7399↗(atsidaro naujame skirtuke)
Santrauka
- Citogenetinė vieta
- 1q41
- Koordinatės
- Chromosoma 1: 215 622 891–216 423 448 (GRCh38)
- Eksonai
- 72 eksonų per 800,6 kb
- Baltymas
- 5 202 aminorūgščių
- Paveldėjimas
- Autosominis recesyvinis
- Taip pat žinomas kaip
- USHRN, RP39
- Ankstesni simboliai
- USH2
- MANE Select transkriptas
- ENST00000307340.8NM_206933.4
- Lokuso tipas
- gene with protein product
Atskaitos genomasGRCh38hg38
Pozicijos genų ir variantų puslapiuose rodomos pagal šį pasirinkimą šioje naršyklėje.
Perskaitykite USH2A ir likusį savo genomą su vienu tyrimu.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites
Įsigyti savo Genome TestKuruotos ataskaitos, susijusios su šiuo genu
Ušerio sindromas
- Autosominis recesyvinis
Recesyvinių ligų grupė (1–4 tipai), sukelianti neurosensorinį klausos netekimą, progresuojantį pigmentinį retinitą ir kai kuriais tipais – pusiausvyros sutrikimus. Susijusi su tokiais genais kaip USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 ir ARSG.
- ClinGen šį ryšį įvertina kaip apibrėžtas
- 5 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Ką duoda žinojimas
Ankstyva diagnozė padeda priimti sprendimus dėl kochlearinių implantų laiko, akių stebėjimo ir tinkamumo dalyvauti tinklainės terapijos tyrimuose, be to, ji svarbi nešiotojų patikrai.
Platesnės grupės
Retinitis pigmentosa
Vienas iš 77 su juo susijusių genų
Paveldimų tinklainės distrofijų grupė, kuriai būdingas progresuojantis lazdelių, o vėliau kolbelių fotoreceptorių netekimas, sukeliantis naktinį aklumą ir palaipsnį periferinio regėjimo praradimą.
- 2 GenCC vertintojų įvertina jį kaip apibrėžtą arba stiprų
Paveldėjimas
- Autosominis recesyvinis
- Reikia pakitusio egzemplioriaus iš kiekvieno iš tėvų. Turint vieną, esate nešiotojas ir paprastai neturite požymių; kai abu tėvai yra nešiotojai, kiekvienas vaikas su vienos iš keturių tikimybe paveldės du.
Kaip išdėstytas USH2A
- Koduojanti seka
- Netransliuojama sritis
- Intronas
- Transkripcijos kryptis
- Žinomos su liga susijusios vietos
- Ruožai, kuriuos trumpi skaitiniai sunkiai aptinka
- Variantai su puslapiu
Geno MANE Select transkripto eksonai (išleidimas v1.5), pagal NCBI ir EMBL-EBI, GRCh38 atskaitos genome.
Chromosomų juostos pagal UCSC GRCh38 ideogramą (2022-10-29).
Netoliese esantys genai iš Ensembl leidimo 116, GRCh38.
Eksonai sudaro 18,9 kb iš 800,6 kb geno; 15 609 šių bazių koduoja baltymą.
Kaip genomo tyrimas nuskaito USH2A
1 263
USH2A geno pozicijų, kuriose ClinVar pakitimą klasifikuoja kaip patogeninį arba tikriausiai patogeninį
Nė viena iš jų nepatenka į sritį, kurią trumpi skaitiniai sunkiai aptinka.
Viso genomo sekvenavimas apima visus 800,6 kb USH2A geno, įskaitant intronus, o ne tik 18,9 kb eksonų.
Variantų su puslapiais (20)
Čia pateikiami USH2A variantai su puslapiais, pirma – su daugiausia apžvalgos žvaigždučių. Kiekviename puslapyje aprašomas viešas ClinVar įrašas apie variantą, niekada ne rezultatas.
| Variantas | HGVS c. | Eksonas ar intronas | Pozicija (GRCh38) | ClinVar klasifikacija | Apžvalgos būsena |
|---|---|---|---|---|---|
| A4740D | c.14219C>A | Eksonas 65 | 215 650 716 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| c.5857+2T>C | Intronas 29 | 216 072 887 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.8559-2A>G | Intronas 42 | 215 877 882 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.8682-9A>G | Intronas 43 | 215 867 179 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| c.12295-3T>A | Intronas 62 | 215 675 619 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė | |
| C319Y | c.956G>A | Eksonas 6 | 216 325 492 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| C620F | c.1859G>T | Eksonas 11 | 216 289 392 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| C694Y | c.2081G>A | Eksonas 12 | 216 250 989 | Tikriausiai patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| C759F | c.2276G>T | Eksonas 13 | 216 247 118 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
| C1447Qfs*29 | c.4338_4339del | Eksonas 20 | 216 190 279 | Patogeninis | ★★★★3 žvaigždučių iš 4 peržiūrėjo ekspertų grupė |
Genai, susieti su tomis pačiomis būklėmis
- CLRN1clarin 1Turi 2 bendrų būklių
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Turi 1 bendrą būklę
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V1Turi 1 bendrą būklę
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Turi 1 bendrą būklę
- AHRaryl hydrocarbon receptorTuri 1 bendrą būklę
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Turi 1 bendrą būklę
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinTuri 1 bendrą būklę
- ARL3ARF like GTPase 3Turi 1 bendrą būklę
- ARL6ARF like GTPase 6Turi 1 bendrą būklę
- ARSGarylsulfatase GTuri 1 bendrą būklę
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Turi 1 bendrą būklę
- BEST1bestrophin 1Turi 1 bendrą būklę
Savybės, susijusios su USH2A
Žmogaus fenotipų ontologija šias savybes nurodo kaip retų ligų, kurias gali sukelti USH2A, požymius. Kiekvienos savybės puslapyje nurodyti kiti su ja susiję genai.
Abnormality of the eye
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blind spot
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Light eye color
- Optic atrophy
Rodyti dar 27 savybių
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Rod-cone dystrophy
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Visual loss
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Close sighted
- Clouding of the lens of the eye
- Cystoid macular edema
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Limited peripheral vision
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Photopsia
- Reduced contrast sensitivity
- Partial loss of field of vision
Išorinės nuorodos
Geno įrašai
Transkriptas
Baltymas
Iš kur tai
- HGNC: geno simbolis, pavadinimas, kiti simboliai ir vieta.
- MANE Select v1.5, iš NCBI ir EMBL-EBI: transkriptas, jo eksonai ir koduojanti seka.
- GenCC ir ClinGen, išleista 2026-10-16: kokioms būklėms genas susijęs ir kaip stipriai.
- ACMG antrinių radinių sąrašas, SF v3.2.
- ClinVar ir GIAB stratifikacijos: žinomos ligas sukeliančios vietos ir sritys, kurias trumpieji skaitiniai sunkiai nustato.
- Žmogaus fenotipų ontologija, versija 2026-09-01: su genu susijusios savybės. Daugiau informacijos rasite hpo.jax.org.
- Duomenų išleidimas 2026.10.16-c6eea6bf.
Cituoti šį puslapį
Dante Labs. (be datos). USH2A genas: usherin. Pasiekta 2026 m. spalio 17 d., iš https://dantelabs.com/lt/genes/ush2a
Dante Labs. USH2A genas: usherin [Internetas]. [cituota 2026 m. spalio 17 d.]. Prieinama: https://dantelabs.com/lt/genes/ush2a
Vienas testas. Atsakymai visam gyvenimui.
Nuo 449 $Nemokamas pristatymas · Rezultatai per 6–8 savaites