Gen
USH2A
usherin
- HGNC 12601↗(åpnes i ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000042781↗(åpnes i ny fane)
- NCBI Gene 7399↗(åpnes i ny fane)
Sammendrag
- Cytogenetisk plassering
- 1q41
- Koordinater
- Kromosom 1: 215 622 891–216 423 448 (GRCh38)
- Eksoner
- 72 eksoner over 800,6 kb
- Protein
- 5 202 aminosyrer
- Arvelighet
- Autosomal recessiv
- Også kjent som
- USHRN, RP39
- Tidligere symboler
- USH2
- MANE Select-transkripsjon
- ENST00000307340.8NM_206933.4
- Lokustype
- gene with protein product
ReferansegenomGRCh38hg38
Posisjoner på gen- og variantsidene følger dette valget i denne nettleseren.
Les USH2A og resten av genomet ditt med én test.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker
Få mitt Genome TestKuraterte rapporter som er relevante for dette genet
Usher-syndrom
- Autosomal recessiv
En gruppe recessive tilstander (type 1 til 4) som gir sensorineuralt hørselstap, progressiv retinitis pigmentosa og, hos noen typer, balanseproblemer. De er knyttet til gener som USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 og ARSG.
- ClinGen vurderer koblingen som definitiv
- 5 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Hva kunnskapen endrer
En tidlig diagnose hjelper med beslutninger om tidspunkt for cochleaimplantat, øyekontroller og kvalifisering til studier med retinal behandling, og er relevant for bærerscreening.
Bredere grupperinger
Retinitis pigmentosa
Ett av 77 gener knyttet til den
En gruppe arvelige netthinnedystrofier med progressivt tap av stavceller og deretter tappceller, som gir nattblindhet og gradvis tap av perifert syn.
- 2 GenCC-innsendere vurderer den som definitiv eller sterk
Arv
- Autosomal recessiv
- Det kreves en endret kopi fra hver forelder. Med én er du bærer og vanligvis uten sykdom. Når begge foreldrene er bærere, har hvert barn en sjanse på én av fire til å arve to.
Slik er USH2A bygget opp
- Kodende sekvens
- Utranslatert region
- Intron
- Transkripsjonsretning
- Kjente sykdomsfremkallende posisjoner
- Områder som korte avlesninger sliter med
- Varianter med egen side
Eksoner i genets MANE Select-transkripsjon (utgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referansegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSCs GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheten fra Ensembl-utgave 116, på GRCh38.
Eksonene utgjør 18,9 kb av genets 800,6 kb, og 15 609 av disse basene koder for proteinet.
Slik leser en genetisk test USH2A
1 263
posisjoner i USH2A der ClinVar klassifiserer en endring som patogen eller sannsynligvis patogen
Ingen av dem faller i et område som korte avlesninger sliter med.
En helgenomsekvensering dekker alle 800,6 kb av USH2A, inkludert introner, og ikke bare de 18,9 kb med eksoner.
Varianter med egen side (20)
De USH2A-variantene med egen side her, med flest stjerner for vurdering først. Hver side beskriver ClinVars offentlige opplysninger om varianten, aldri et resultat.
| Variant | HGVS c. | Ekson eller intron | Posisjon (GRCh38) | ClinVar-klassifisering | Vurderingsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A4740D | c.14219C>A | Ekson 65 | 215 650 716 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| c.5857+2T>C | Intron 29 | 216 072 887 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.8559-2A>G | Intron 42 | 215 877 882 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.8682-9A>G | Intron 43 | 215 867 179 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| c.12295-3T>A | Intron 62 | 215 675 619 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel | |
| C319Y | c.956G>A | Ekson 6 | 216 325 492 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| C620F | c.1859G>T | Ekson 11 | 216 289 392 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| C694Y | c.2081G>A | Ekson 12 | 216 250 989 | Sannsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| C759F | c.2276G>T | Ekson 13 | 216 247 118 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
| C1447Qfs*29 | c.4338_4339del | Ekson 20 | 216 190 279 | Patogen | ★★★★3 stjerner av 4 gjennomgått av ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme tilstandene
- CLRN1clarin 1Deler 2 tilstander
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Deler 1 tilstand
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V1Deler 1 tilstand
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Deler 1 tilstand
- AHRaryl hydrocarbon receptorDeler 1 tilstand
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Deler 1 tilstand
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinDeler 1 tilstand
- ARL3ARF like GTPase 3Deler 1 tilstand
- ARL6ARF like GTPase 6Deler 1 tilstand
- ARSGarylsulfatase GDeler 1 tilstand
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Deler 1 tilstand
- BEST1bestrophin 1Deler 1 tilstand
Egenskaper knyttet til USH2A
The Human Phenotype Ontology lister disse som kjennetegn ved de sjeldne tilstandene USH2A kan forårsake. Hver egenskaps side viser de andre genene som er knyttet til den.
Abnormality of the eye
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blind spot
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Light eye color
- Optic atrophy
Vis 27 egenskaper til
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Rod-cone dystrophy
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Visual loss
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Close sighted
- Clouding of the lens of the eye
- Cystoid macular edema
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Limited peripheral vision
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Photopsia
- Reduced contrast sensitivity
- Partial loss of field of vision
Eksterne lenker
Genposter
Transkripsjon
Protein
Hvor dette kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og plassering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets eksoner og kodingssekvens.
- GenCC og ClinGen, utgitt 2026-10-16: hvilke tilstander genet er knyttet til, og hvor sterkt.
- ACMGs liste over sekundære funn, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifiseringene: kjente sykdomsfremkallende posisjoner, og regionene som korte avlesninger har vanskelig for å dekke.
- The Human Phenotype Ontology, versjon 2026-09-01: egenskapene knyttet til genet. Les mer på hpo.jax.org.
- Datautgave 2026.10.16-c6eea6bf.
Siter denne siden
Dante Labs. (u.d.). USH2A-genet: usherin. Hentet 17. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/no/genes/ush2a
Dante Labs. USH2A-genet: usherin [Internett]. [sitert 17. oktober 2026]. Tilgjengelig fra: https://dantelabs.com/no/genes/ush2a
Én test. En livstid med svar.
Fra 449 $Gratis frakt · Resultater på 6–8 uker