Gén
USH2A
usherin
- HGNC 12601↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000042781↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 7399↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 1q41
- Koordináták
- 1. kromoszóma: 215 622 891–216 423 448 (GRCh38)
- Exonok
- 72 exon, összesen 800,6 kb
- Fehérje
- 5202 aminosav
- Öröklődés
- Autoszomális recesszív
- Más néven ismert
- USHRN, RP39
- Korábbi jelölések
- USH2
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000307340.8NM_206933.4
- Lokusz típusa
- gene with protein product
Referencia genomGRCh38hg38
A gén- és variánsoldalakon a pozíciók ennek a választásnak megfelelően jelennek meg, ebben a böngészőben.
Olvassa el a USH2A-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Usher Syndrome
- Autoszomális recesszív
A group of recessive conditions (types 1 to 4) causing sensorineural hearing loss, progressive retinitis pigmentosa and, in some types, balance problems, linked to genes such as USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 and ARSG.
- A ClinGen szerint a kapcsolat besorolása: definitív
- 5 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Mit változtat az ismeret
An early diagnosis helps with decisions about the timing of cochlear implants, eye monitoring and eligibility for retinal therapy trials, and is relevant to carrier screening.
Átfogóbb csoportosítások
Retinitis Pigmentosa
A 77 hozzá kapcsolódó gén egyike
A group of inherited retinal dystrophies with progressive loss of rod and then cone photoreceptors, causing night blindness and gradual loss of peripheral vision.
- 2 GenCC-beküldő definitívnek vagy erősnek minősíti
Öröklődési mód
- Autoszomális recesszív
- Mindkét szülőtől egy-egy megváltozott másolat szükséges. Egy megváltozott másolattal hordozó lesz, és általában nem érintett; ha mindkét szülő hordozó, minden gyermeknek 25%-os eséllyel öröklődik mindkét másolat.
A USH2A felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
- Oldallal rendelkező variánsok
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 800,6 kb-jából 18,9 kb-ot tesznek ki; ezek közül 15 609 bázis kódolja a fehérjét.
Hogyan olvassa a genomteszt a(z) USH2A gént
1263
pozíció a(z) USH2A génben, ahol a ClinVar a változást kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti
Ezek közül egyik sem esik olyan régióba, amelyet a rövid olvasatok nehezen értelmeznek.
A teljes genom a USH2A gén mind a 800,6 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 18,9 kb exonját.
Oldallal rendelkező variánsok (20)
Az itt található, oldallal rendelkező USH2A variánsok, a legtöbb csillaggal rendelkezők először. Minden oldal a variáns ClinVar nyilvános adatbázisbeli bejegyzését írja le, sosem egy eredményt.
| Variáns | HGVS c. | Exon vagy intron | Pozíció (GRCh38) | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|---|---|
| A4740D | c.14219C>A | 65. exon | 215 650 716 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| c.5857+2T>C | 29. intron | 216 072 887 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.8559-2A>G | 42. intron | 215 877 882 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.8682-9A>G | 43. intron | 215 867 179 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| c.12295-3T>A | 62. intron | 215 675 619 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte | |
| C319Y | c.956G>A | 6. exon | 216 325 492 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| C620F | c.1859G>T | 11. exon | 216 289 392 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| C694Y | c.2081G>A | 12. exon | 216 250 989 | Valószínűleg patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| C759F | c.2276G>T | 13. exon | 216 247 118 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
| C1447Qfs*29 | c.4338_4339del | 20. exon | 216 190 279 | Patogén | ★★★★3 csillag a 4-ből szakértői testület értékelte |
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- CLRN1clarin 12 betegséget oszt meg
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 41 betegséget oszt meg
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V11 betegséget oszt meg
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 51 betegséget oszt meg
- AHRaryl hydrocarbon receptor1 betegséget oszt meg
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 181 betegséget oszt meg
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding protein1 betegséget oszt meg
- ARL3ARF like GTPase 31 betegséget oszt meg
- ARL6ARF like GTPase 61 betegséget oszt meg
- ARSGarylsulfatase G1 betegséget oszt meg
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 21 betegséget oszt meg
- BEST1bestrophin 11 betegséget oszt meg
A(z) USH2A génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) USH2A gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the eye
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blind spot
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Light eye color
- Optic atrophy
Még 27 tulajdonság megjelenítése
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Rod-cone dystrophy
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Visual loss
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Close sighted
- Clouding of the lens of the eye
- Cystoid macular edema
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Limited peripheral vision
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Photopsia
- Reduced contrast sensitivity
- Partial loss of field of vision
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Honnan származnak az adatok
- HGNC: a gén szimbóluma, neve, egyéb szimbólumai és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI-tól és az EMBL-EBI-tól: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-16 kiadás: mely betegségekkel kapcsolódik a gén, és milyen erősen.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-rétegződések: ismert, betegséget okozó helyek, valamint azok a régiók, amelyeket a rövid leolvasások nehezen térképeznek fel.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.16-c6eea6bf.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). USH2A gén: usherin. Lekérve: 2026. október 17., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/ush2a
Dante Labs. USH2A gén: usherin [Internet]. [idézve: 2026. október 17.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/ush2a
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt