Gen
USH2A
usherin
- HGNC 12601↗(åbnes i en ny fane)
- Ensembl-gen ENSG00000042781↗(åbnes i en ny fane)
- NCBI Gene 7399↗(åbnes i en ny fane)
Oversigt
- Cytogenetisk placering
- 1q41
- Koordinater
- Kromosom 1: 215.622.891–216.423.448 (GRCh38)
- Exoner
- 72 exoner fordelt over 800,6 kb
- Protein
- 5.202 aminosyrer
- Arvelighed
- Autosomal recessiv
- Også kendt som
- USHRN, RP39
- Tidligere symboler
- USH2
- MANE Select-transkript
- ENST00000307340.8NM_206933.4
- Lokustype
- gene with protein product
ReferencegenomGRCh38hg38
Positioner på gen- og variantsider følger dette valg i denne browser.
Læs USH2A og resten af dit genom med én test.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger
Bestil min Genome TestKurerede rapporter relevant for dette gen
Usher-syndrom
- Autosomal recessiv
En gruppe recessive tilstande (type 1 til 4), der forårsager sensorineuralt høretab, progressiv retinitis pigmentosa og, hos nogle typer, balanceproblemer. De er knyttet til gener som USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 og ARSG.
- ClinGen vurderer forbindelsen som definitivt
- 5 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Hvad viden ændrer
En tidlig diagnose hjælper med beslutninger om tidspunktet for cochleaimplantater, øjenkontroller og berettigelse til forsøg med retinal behandling, og er relevant for bærertestning.
Bredere grupperinger
Retinitis pigmentosa
Et af 77 gener, der er knyttet til det
En gruppe arvelige retinale dystrofier med progressivt tab af stave og derefter tappe i fotoreceptorerne, som giver nattblindhed og gradvist tab af perifert syn.
- 2 GenCC-indsendere vurderer den som definitiv eller stærk
Arvegang
- Autosomal recessiv
- Det kræver en ændret kopi fra hver forælder. Med én er man bærer og som regel upåvirket; når begge forældre er bærere, har hvert barn en chance på en ud af fire for at arve to.
Sådan er USH2A opbygget
- Kodende sekvens
- Utranslateret region
- Intron
- Transkriptionsretning
- Kendte sygdomsfremkaldende steder
- Regioner, som korte læsninger har svært ved
- Varianter med en side
Eksoner i genets MANE Select-transkript (udgave v1.5), fra NCBI og EMBL-EBI, på referencegenomet GRCh38.
Kromosombånd fra UCSC's GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Gener i nærheden fra Ensembl-udgivelse 116, på GRCh38.
Eksoner udgør 18,9 kb af genets 800,6 kb; 15.609 af disse baser koder for proteinet.
Sådan læser en genomtest USH2A
1.263
positioner i USH2A, hvor ClinVar klassificerer en ændring som patogen eller sandsynligvis patogen
Ingen af dem ligger i en region, som korte læsninger har svært ved.
En helgenomsanalyse dækker alle 800,6 kb af USH2A, inklusive introner, og ikke kun de 18,9 kb eksoner.
Varianter med en side (20)
Her vises de USH2A-varianter med en side, med de flest anmeldelsesstjerner først. Hver side beskriver ClinVars offentlige registrering af varianten, aldrig et resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassifikation | Gennemgangsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A4740D | c.14219C>A | Exon 65 | 215.650.716 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| c.5857+2T>C | Intron 29 | 216.072.887 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.8559-2A>G | Intron 42 | 215.877.882 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.8682-9A>G | Intron 43 | 215.867.179 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| c.12295-3T>A | Intron 62 | 215.675.619 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel | |
| C319Y | c.956G>A | Exon 6 | 216.325.492 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| C620F | c.1859G>T | Exon 11 | 216.289.392 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| C694Y | c.2081G>A | Exon 12 | 216.250.989 | Sandsynligvis patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| C759F | c.2276G>T | Exon 13 | 216.247.118 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
| C1447Qfs*29 | c.4338_4339del | Exon 20 | 216.190.279 | Patogen | ★★★★3 stjerner ud af 4 Gennemgået af ekspertpanel |
Gener knyttet til de samme sygdomme
- CLRN1clarin 1Deler 2 sygdomme
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Deler 1 sygdom
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V1Deler 1 sygdom
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Deler 1 sygdom
- AHRaryl hydrocarbon receptorDeler 1 sygdom
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Deler 1 sygdom
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinDeler 1 sygdom
- ARL3ARF like GTPase 3Deler 1 sygdom
- ARL6ARF like GTPase 6Deler 1 sygdom
- ARSGarylsulfatase GDeler 1 sygdom
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Deler 1 sygdom
- BEST1bestrophin 1Deler 1 sygdom
Træk knyttet til USH2A
Human Phenotype Ontology angiver disse som kendetegn ved de sjældne tilstande, USH2A kan forårsage. Hvert træks side viser de andre gener, der er knyttet til det.
Abnormality of the eye
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blind spot
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Light eye color
- Optic atrophy
Vis 27 træk mere
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Rod-cone dystrophy
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Visual loss
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Close sighted
- Clouding of the lens of the eye
- Cystoid macular edema
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Limited peripheral vision
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Photopsia
- Reduced contrast sensitivity
- Partial loss of field of vision
Eksterne links
Genposter
Transkript
Protein
Hvor oplysningerne kommer fra
- HGNC: genets symbol, navn, andre symboler og placering.
- MANE Select v1.5, fra NCBI og EMBL-EBI: transkriptet, dets exoner og kodende sekvens.
- GenCC og ClinGen, udgivet 2026-10-16: hvilke sygdomme genet er knyttet til, og hvor stærkt.
- ACMG-listen over sekundære fund, SF v3.2.
- ClinVar og GIAB-stratifikationerne: kendte sygdomsfremkaldende positioner og de regioner, som korte læsninger har svært ved at aflæse.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: de træk, der er knyttet til genet. Læs mere på hpo.jax.org.
- Dataudgivelse 2026.10.16-c6eea6bf.
Citér denne side
Dante Labs. (u.d.). USH2A-genet: usherin. Hentet 16. oktober 2026, fra https://dantelabs.com/da/genes/ush2a
Dante Labs. USH2A-genet: usherin [Internet]. [citeret 16. oktober 2026]. Tilgængelig fra: https://dantelabs.com/da/genes/ush2a
Én test. Svar for hele livet.
Fra 449 $Gratis forsendelse · Resultater på 6–8 uger