Gen
USH2A
usherin
- HGNC 12601↗(öppnas i en ny flik)
- Ensembl-gen ENSG00000042781↗(öppnas i en ny flik)
- NCBI Gene 7399↗(öppnas i en ny flik)
Sammanfattning
- Cytogenetisk position
- 1q41
- Koordinater
- Kromosom 1: 215 622 891–216 423 448 (GRCh38)
- Exoner
- 72 exoner på 800,6 kb
- Protein
- 5 202 aminosyror
- Arvsgång
- Autosomalt recessiv
- Även känd som
- USHRN, RP39
- Tidigare symboler
- USH2
- MANE Select-transkript
- ENST00000307340.8NM_206933.4
- Lokustyp
- gene with protein product
ReferensgenomGRCh38hg38
Positioner på gen- och variantsidorna följer det här valet, i den här webbläsaren.
Läs USH2A, och resten av ditt genom, med ett test.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor
Beställ mitt Genome TestKuraterade rapporter som är relevanta för denna gen
Ushers syndrom
- Autosomalt recessiv
En grupp recessiva sjukdomar (typ 1 till 4) som orsakar sensorineural hörselnedsättning, progressiv retinitis pigmentosa och, hos vissa typer, balansproblem. Sjukdomarna är kopplade till gener som USH2A, MYO7A, CDH23, PCDH15, USH1C, USH1G, ADGRV1, WHRN, CLRN1 och ARSG.
- ClinGen bedömer kopplingen som definitiv
- 5 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Vad kunskapen förändrar
En tidig diagnos hjälper till vid beslut om tidpunkten för cochleaimplantat, ögonkontroller och behörighet för försök med retinal terapi, och är relevant vid bärarscreening.
Bredare grupperingar
Retinitis pigmentosa
En av 77 gener kopplade till den
En grupp ärftliga retinala dystrofier med progressiv förlust av först stavar och sedan tappar (fotoreceptorer), vilket orsakar nattblindhet och gradvis förlust av perifer syn.
- 2 GenCC-bedömare klassar den som definitiv eller stark
Nedärvning
- Autosomalt recessiv
- Det krävs en förändrad kopia från vardera föräldern. Med en är du bärare och oftast opåverkad. När båda föräldrarna är bärare har varje barn en chans på en av fyra att ärva två.
Så är USH2A uppbyggd
- Kodande sekvens
- Otranslaterad region
- Intron
- Transkriptionsriktning
- Kända sjukdomsorsakande ställen
- Sträckor som korta läsningar har svårt för
- Varianter med egen sida
Exoner i genens MANE Select-transkript (version v1.5), från NCBI och EMBL-EBI, på referensgenomet GRCh38.
Kromosombanden från UCSC:s GRCh38-ideogram (2022-10-29).
Närliggande gener från Ensembl-version 116, på GRCh38.
Exoner utgör 18,9 kb av genens 800,6 kb, och 15 609 av dessa baser kodar för proteinet.
Så läser ett genomtest USH2A
1 263
positioner i USH2A där ClinVar klassar en förändring som patogen eller sannolikt patogen
Inget av dem ligger i ett område som korta läsningar har svårt för.
En helgenomsanalys täcker alla 800,6 kb av USH2A, med introner inräknade, inte bara de 18,9 kb exoner.
Varianter med egen sida (20)
De USH2A-varianter som har en egen sida här, med flest recensionsstjärnor först. Varje sida beskriver ClinVars offentliga register över varianten, aldrig ett resultat.
| Variant | HGVS c. | Exon eller intron | Position (GRCh38) | ClinVar-klassificering | Granskningsstatus |
|---|---|---|---|---|---|
| A4740D | c.14219C>A | Exon 65 | 215 650 716 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| c.5857+2T>C | Intron 29 | 216 072 887 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.8559-2A>G | Intron 42 | 215 877 882 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.8682-9A>G | Intron 43 | 215 867 179 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| c.12295-3T>A | Intron 62 | 215 675 619 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel | |
| C319Y | c.956G>A | Exon 6 | 216 325 492 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| C620F | c.1859G>T | Exon 11 | 216 289 392 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| C694Y | c.2081G>A | Exon 12 | 216 250 989 | Sannolikt patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| C759F | c.2276G>T | Exon 13 | 216 247 118 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
| C1447Qfs*29 | c.4338_4339del | Exon 20 | 216 190 279 | Patogen | ★★★★3 stjärnor av 4 granskad av expertpanel |
Gener kopplade till samma tillstånd
- CLRN1clarin 1Delar 2 tillstånd
- ABCA4ATP binding cassette subfamily A member 4Delar 1 tillstånd
- ADGRV1adhesion G protein-coupled receptor V1Delar 1 tillstånd
- AGBL5AGBL carboxypeptidase 5Delar 1 tillstånd
- AHRaryl hydrocarbon receptorDelar 1 tillstånd
- ARHGEF18Rho/Rac guanine nucleotide exchange factor 18Delar 1 tillstånd
- ARL2BPARF like GTPase 2 binding proteinDelar 1 tillstånd
- ARL3ARF like GTPase 3Delar 1 tillstånd
- ARL6ARF like GTPase 6Delar 1 tillstånd
- ARSGarylsulfatase GDelar 1 tillstånd
- BBS2Bardet-Biedl syndrome 2Delar 1 tillstånd
- BEST1bestrophin 1Delar 1 tillstånd
Egenskaper kopplade till USH2A
Human Phenotype Ontology listar dessa som kännetecken för de sällsynta tillstånd som USH2A kan orsaka. Varje egenskaps sida visar de andra gener som är kopplade till den.
Abnormality of the eye
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal retinal pigmentation
- Blind spot
- Blindness
- Extreme sensitivity of the eyes to light
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Light eye color
- Optic atrophy
Visa ytterligare 27 egenskaper
- Progressive night blindness
- Retina degeneration
- Rod-cone dystrophy
- Spicular pigmentation of the retina
- Visual impairment
- Visual loss
- Abnormal central response of multifocal electroretinogram
- Abnormal full-field electroretinogram
- Bulging cornea
- Close sighted
- Clouding of the lens of the eye
- Cystoid macular edema
- Decreased clarity of vision
- Difficulties with night vision
- Eye muscle paralysis
- Glaucoma
- Limited peripheral vision
- Loss of peripheral vision
- Optic disc drusen
- Optic disc pallor
- Photoreceptor outer segment loss on macular OCT
- Posterior subcapsular cataract
- Retinal atrophy
- Abnormal color vision
- Photopsia
- Reduced contrast sensitivity
- Partial loss of field of vision
Externa länkar
Genposter
Transkript
Protein
Varifrån detta kommer
- HGNC: genens symbol, namn, andra symboler och position.
- MANE Select v1.5, från NCBI och EMBL-EBI: transkriptet, dess exoner och kodande sekvens.
- GenCC och ClinGen, släppt 2026-10-16: vilka tillstånd genen är kopplad till och hur starkt kopplingen är.
- ACMG:s lista över sekundära fynd, SF v3.2.
- ClinVar och GIAB-stratifieringarna: kända sjukdomsorsakande positioner och de regioner där korta läsningar har svårt.
- Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01: egenskaperna som är kopplade till genen. Läs mer på hpo.jax.org.
- Dataversion 2026.10.16-c6eea6bf.
Citera den här sidan
Dante Labs. (u.å.). USH2A-genen: usherin. Hämtad 17 oktober 2026, från https://dantelabs.com/sv/genes/ush2a
Dante Labs. USH2A-genen: usherin [Internet]. [citerad 17 oktober 2026]. Tillgänglig på: https://dantelabs.com/sv/genes/ush2a
Ett test. Ett helt liv av svar.
Från 449 $Fri frakt · Resultat inom 6–8 veckor