Gen
STAT5B
signal transducer and activator of transcription 5B
- HGNC 11367↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000173757↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 6777↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 17q21.2
- Souřadnice
- Chromozom 17: 42 199 177–42 276 391 (GRCh38)
- Exony
- 19 exonů na 77,2 kb
- Protein
- 787 aminokyselin
- Transkript MANE Select
- ENST00000293328.8NM_012448.4
- Typ lokusu
- Kódující proteiny
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Tato stránka jako data
Chcete-li ji číst jako JSON, připojte k adrese stránky .json nebo požádejte o application/json.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/stat5b.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$namePřečtěte si STAT5B i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Growth Hormone Insensitivity & IGF-1 Axis Disorders
- Growth hormone insensitivity syndrome
Short stature with normal or high growth hormone but low IGF-1, including Laron syndrome (GHR), IGF1, IGFALS and IGF1R defects, and STAT5B deficiency with immune dysregulation.
- ClinGen hodnotí souvislost jako definitivní
- 5 hodnotitelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
▶Akcionabilita
Recombinant IGF-1 (mecasermin) can improve growth in some forms; STAT5B deficiency also needs immune and lung follow-up.
Jak je STAT5B uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
- Úseky, které krátká čtení obtížně zachycují
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 5,1 kb z 77,2 kb genu; 2 364 těchto bází kódují protein.
Sekvenování STAT5B
23
pozic v STAT5B, kde ClinVar zařazuje změnu jako patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Z nich 3 (13 %) spadají do oblastí, které krátká čtení obtížně zpracovávají.
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (3 míst)
Celý genom pokrývá všech 77,2 kb genu STAT5B včetně intronů, nejen 5,1 kb exonů.
ClinVar pathogenic variants (24)
The STAT5B variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogenní 19
- Pravděpodobně patogenní 5
| Varianta | Conditions | Klasifikace ClinVar | Stav hodnocení |
|---|---|---|---|
| NM_012448.4(STAT5B):c.424_427del (p.Leu142fs) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★2 hvězdiček z 4 Kritéria uvedena, více předkladatelů, bez konfliktů |
| NM_012448.4(STAT5B):c.2065G>T (p.Glu689Ter) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1906C>T (p.Gln636Ter) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1892G>A (p.Trp631Ter) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1749del (p.Lys583fs) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1718G>A (p.Trp573Ter) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1500_1501dup (p.Lys501fs) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1213_1229del (p.Tyr405fs) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1183G>T (p.Glu395Ter) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1102dup (p.Gln368fs) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1102del (p.Gln368fs) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1009C>T (p.Gln337Ter) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.415C>T (p.Gln139Ter) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.303C>A (p.Cys101Ter) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.245del (p.Leu82fs) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.240_241del (p.Leu82fs) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.121C>T (p.Gln41Ter) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.89_90dup (p.Arg31fs) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.16C>T (p.Gln6Ter) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1906+1G>A (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1896G>T (p.Lys632Asn) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity syndrome with immune dysregulation 2, autosomal dominant | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1776-21_1786dup (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.1681-2A>G (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
| NM_012448.4(STAT5B):c.621G>C (p.Lys207Asn) (opens in a new tab) | growth hormone insensitivity with immune dysregulation 1, autosomal recessive | Pravděpodobně patogenní | ★★★★1 hvězdička z 4 Kritéria uvedena, jediný předkladatel |
Geny spojené se stejnými onemocněními
Rysy spojené s STAT5B
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit STAT5B. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud to pochází
- HGNC: symbol genu, jeho název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5 od NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-17: se kterými stavy je gen spojen a jak silně.
- Seznam ACMG pro sekundární nálezy, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zvládají.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.17-8666dff2.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen STAT5B: signal transducer and activator of transcription 5B. Staženo 18. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/stat5b
Dante Labs. Gen STAT5B: signal transducer and activator of transcription 5B [Internet]. [citováno 18. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/stat5b
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů