Gen
PITX2
paired like homeodomain 2
- HGNC 9005↗(otevře se na nové kartě)
- Gen v Ensembl ENSG00000164093↗(otevře se na nové kartě)
- NCBI Gene 5308↗(otevře se na nové kartě)
Shrnutí
- Cytogenetická poloha
- 4q25
- Souřadnice
- Chromozom 4: 110 617 423–110 623 077 (GRCh38)
- Exony
- 3 exonů na 5,7 kb
- Protein
- 324 aminokyselin
- Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Další názvy
- IGDS, RS, Brx1, Otlx2, ARP1
- Předchozí symboly
- IRID2, IHG2, RIEG, RIEG1, RGS
- Transkript MANE Select
- ENST00000644743.1NM_000325.6
- Typ lokusu
- gene with protein product
- Velmi vysoká
- Jistá
- Nízká
- Velmi nízká
Referenční genomGRCh38hg38
Pozice na stránkách genů a variant se řídí touto volbou v tomto prohlížeči.
Přečtěte si PITX2 i zbytek svého genomu jediným testem.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů
Objednejte si Genome TestKurátorovaný report související s tímto genem
Anterior Segment Dysgenesis, Axenfeld-Rieger Syndrome & Aniridia
- Axenfeld-Rieger SyndromeAutozomálně dominantní
A dominant condition caused by changes in PITX2 or FOXC1, affecting the iris and drainage angle and sometimes the teeth, face and navel.
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
Lifelong glaucoma surveillance is recommended, as about half of affected people develop glaucoma.
- Anterior Segment Dysgenesis
A group of developmental conditions of the front of the eye, including Peters anomaly, caused by changes in genes such as FOXC1, PITX3, FOXE3, CYP1B1 and CPAMD8.
- Hodnocení ClinGen pro tuto vazbu: definitivní
- 3 zadavatelů GenCC ji hodnotí jako definitivní nebo silnou
Co přináší znalost
There is a high lifetime risk of glaucoma, so regular eye-pressure monitoring is recommended.
Dědičnost
- Autozomálně dominantní
- Stačí jedna změněná kopie od kteréhokoli z rodičů. Rodič, který ji má, ji předá každému dítěti s pravděpodobností jedna ku dvěma.
Jak je PITX2 uspořádán
- Kódující sekvence
- Netranslatovaná oblast
- Intron
- Směr transkripce
- Známá místa způsobující onemocnění
Exony transkriptu MANE Select genu (verze v1.5) z databází NCBI a EMBL-EBI, na referenčním genomu GRCh38.
Pásy chromozomů z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Okolní geny z Ensembl, verze 116, na GRCh38.
Exony tvoří 2,3 kb z 5,7 kb genu; 975 těchto bází kódují protein.
Jak genetický test čte PITX2
52
pozic v genu PITX2, které ClinVar řadí mezi patogenní nebo pravděpodobně patogenní
Žádné z nich neleží v oblasti, kterou krátká čtení obtížně zachycují.
Celý genom pokrývá všech 5,7 kb genu PITX2, včetně intronů, nikoli jen 2,3 kb exonů.
Geny spojené se stejnými onemocněními
- FOXC1forkhead box C1Sdílí 2 onemocnění
- CPAMD8C3 and PZP like alpha-2-macroglobulin domain containing 8Sdílí 1 onemocnění
- FOXE3forkhead box E3Sdílí 1 onemocnění
- ITPR1inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1Sdílí 1 onemocnění
- PAX6paired box 6Sdílí 1 onemocnění
- PITX3paired like homeodomain 3Sdílí 1 onemocnění
- PXDNperoxidasinSdílí 1 onemocnění
Rysy spojené s PITX2
Human Phenotype Ontology uvádí tyto rysy jako příznaky vzácných onemocnění, která může způsobit PITX2. Na stránce každého rysu najdete další geny, které jsou s ním spojené.
Abnormality of the eye
- Displaced pupil
- Peters anomaly
- Posterior embryotoxon
- Underdeveloped iris
- Abnormal anterior chamber morphology
- Absent/small iris
- Anterior synechiae of the anterior chamber
- Central opacification of the cornea
Zobrazit ještě 20 rysů
- Glaucoma
- Hypoplastic iris stroma
- Light eye color
- Opacification of the corneal stroma
- Subcapsular cataract
- Thinning of Descemet membrane
- Developmental glaucoma
- Wide-set eyes
- Cross-eyed
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal cornea morphology
- Abnormal corneal limbus morphology
- Abnormally prominent line of Schwalbe
- Absent iris
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Corneal astigmatism
- Enlarged cornea
- Lazy eye
- Multiple pupils
- Rieger anomaly
Externí odkazy
Záznamy o genu
Transkript
Protein
Odkud údaje pocházejí
- HGNC: symbol genu, název, další symboly a umístění.
- MANE Select v1.5, z NCBI a EMBL-EBI: transkript, jeho exony a kódující sekvence.
- GenCC a ClinGen, vydání 2026-10-16: s jakými onemocněními je gen spojen a jak silná je tato souvislost.
- Seznam sekundárních nálezů ACMG, SF v3.2.
- ClinVar a stratifikace GIAB: známá místa způsobující onemocnění a oblasti, které krátká čtení obtížně zachycují.
- Human Phenotype Ontology, verze 2026-09-01: rysy spojené s tímto genem. Více informací najdete na hpo.jax.org.
- Vydání dat 2026.10.16-c6eea6bf.
Citovat tuto stránku
Dante Labs. (b.d.). Gen PITX2: paired like homeodomain 2. Staženo 16. října 2026, z https://dantelabs.com/cs/genes/pitx2
Dante Labs. Gen PITX2: paired like homeodomain 2 [Internet]. [citováno 16. října 2026]. Dostupné z: https://dantelabs.com/cs/genes/pitx2
Jeden test. Odpovědi na celý život.
Od 449 $Doprava zdarma · Výsledky za 6–8 týdnů