Geeni
PITX2
paired like homeodomain 2
- HGNC 9005↗(avautuu uuteen välilehteen)
- Ensembl-geeni ENSG00000164093↗(avautuu uuteen välilehteen)
- NCBI Gene 5308↗(avautuu uuteen välilehteen)
Yhteenveto
- Sytogeneettinen sijainti
- 4q25
- Koordinaatit
- Kromosomi 4: 110 617 423–110 623 077 (GRCh38)
- Eksonit
- 3 eksonia 5,7 kb:n alueella
- Proteiini
- 324 aminohappoa
- Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Tunnetaan myös nimellä
- IGDS, RS, Brx1, Otlx2, ARP1
- Aiemmat symbolit
- IRID2, IHG2, RIEG, RIEG1, RGS
- MANE Select -transkripti
- ENST00000644743.1NM_000325.6
- Lokustyyppi
- gene with protein product
- Erittäin korkea
- Varma
- Matala
- Erittäin matala
ViitegenomiGRCh38hg38
Geenien ja varianttien sivujen sijainnit noudattavat tätä valintaa tässä selaimessa.
Lue PITX2 ja muu genomisi yhdellä testillä.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa
Tilaa Genome TestTähän geeniin liittyvä kuratoitu raportti
Etusilmän kehityshäiriöt, Axenfeldin–Riegerin oireyhtymä ja aniridia
- Axenfeldin–Riegerin oireyhtymäAutosomaalinen dominantti
Dominantisti periytyvä sairaus, jonka aiheuttavat muutokset geeneissä PITX2 tai FOXC1. Se vaikuttaa iiriksen ja vedenpoistokulman rakenteeseen ja joskus hampaisiin, kasvoihin sekä napaan.
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Koko elämän kestävää glaukooman seurantaa suositellaan, sillä noin puolella sairastuneista kehittyy glaukooma.
- Etusilmän kehityshäiriöt
Silmän etuosan kehityshäiriöiden ryhmä, johon kuuluu myös Petersin anomalia. Sen aiheuttavat muutokset geeneissä, kuten FOXC1, PITX3, FOXE3, CYP1B1 ja CPAMD8.
- ClinGen luokittelee yhteyden: varma
- 3 GenCC-arvioijaa arvioi sen varmaksi tai vahvaksi
Mitä tieto muuttaa
Glaukoomaan sairastumisen elinikäinen riski on korkea, joten säännöllinen silmänpaineen seuranta on suositeltavaa.
Periytyminen
- Autosomaalinen dominantti
- Yksi muuttunut kopio kummalta vanhemmalta tahansa riittää. Vanhempi, jolla on yksi, siirtää sen kullekin lapselleen todennäköisyydellä yksi kahdesta.
PITX2-geenin rakenne
- Koodaava jakso
- Translatoimaton alue
- Intron
- Transkription suunta
- Tunnetut tautia aiheuttavat kohdat
Geenin MANE Select -transkriptin eksonit (julkaisu v1.5), lähteinä NCBI ja EMBL-EBI, GRCh38-referenssigenomissa.
Kromosomivyöhykkeet UCSC:n GRCh38-ideogrammista (2022-10-29).
Lähellä olevat geenit Ensembl-julkaisusta 116, GRCh38-kokoonpanossa.
Eksonit muodostavat 2,3 kb geenin 5,7 kb:stä; 975 näistä emäksistä koodaa proteiinia.
Miten genomitesti lukee geeniä PITX2
52
PITX2-geenin kohtaa, joissa ClinVar luokittelee muutoksen patogeeniseksi tai todennäköisesti patogeeniseksi
Mikään niistä ei osu alueelle, jota lyhyet lukemat löytävät vaikeasti.
Kokogenomi kattaa kaikki 5,7 kb geenistä PITX2, intronit mukaan lukien, ei pelkästään 2,3 kb eksoneja.
Samoihin sairauksiin liittyvät geenit
- FOXC1forkhead box C1Yhteisiä sairauksia: 2
- CPAMD8C3 and PZP like alpha-2-macroglobulin domain containing 8Yhteinen sairaus: 1
- FOXE3forkhead box E3Yhteinen sairaus: 1
- ITPR1inositol 1,4,5-trisphosphate receptor type 1Yhteinen sairaus: 1
- PAX6paired box 6Yhteinen sairaus: 1
- PITX3paired like homeodomain 3Yhteinen sairaus: 1
- PXDNperoxidasinYhteinen sairaus: 1
Geeniin PITX2 liittyvät piirteet
Human Phenotype Ontology luettelee nämä piirteinä harvinaisista sairauksista, joita PITX2 voi aiheuttaa. Kunkin piirteen sivulla luetellaan muut siihen liittyvät geenit.
Abnormality of the eye
- Displaced pupil
- Peters anomaly
- Posterior embryotoxon
- Underdeveloped iris
- Abnormal anterior chamber morphology
- Absent/small iris
- Anterior synechiae of the anterior chamber
- Central opacification of the cornea
Näytä 20 piirrettä lisää
- Glaucoma
- Hypoplastic iris stroma
- Light eye color
- Opacification of the corneal stroma
- Subcapsular cataract
- Thinning of Descemet membrane
- Developmental glaucoma
- Wide-set eyes
- Cross-eyed
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Abnormal cornea morphology
- Abnormal corneal limbus morphology
- Abnormally prominent line of Schwalbe
- Absent iris
- Cornea of eye less than 10mm in diameter
- Corneal astigmatism
- Enlarged cornea
- Lazy eye
- Multiple pupils
- Rieger anomaly
Ulkoiset linkit
Geenitietueet
Transkripti
Proteiini
Mistä tieto on peräisin
- HGNC: geenin symboli, nimi, muut symbolit ja sijainti.
- MANE Select v1.5, NCBI:ltä ja EMBL-EBI:ltä: transkripti, sen eksonit ja koodaava sekvenssi.
- GenCC ja ClinGen, julkaisu 2026-10-16: mihin sairauksiin geeni liittyy ja kuinka vahvasti.
- ACMG:n toissijaisten löydösten luettelo, SF v3.2.
- ClinVar ja GIAB-stratifikaatiot: tunnetut tautia aiheuttavat kohdat sekä alueet, joiden lukeminen lyhyillä luennoilla on vaikeaa.
- Human Phenotype Ontology, versio 2026-09-01: geeniin liittyvät piirteet. Lue lisää osoitteesta hpo.jax.org.
- Datajulkaisu 2026.10.16-c6eea6bf.
Viittaa tähän sivuun
Dante Labs. (n.d.). PITX2-geeni: paired like homeodomain 2. Haettu 17. lokakuuta 2026, osoitteesta https://dantelabs.com/fi/genes/pitx2
Dante Labs. PITX2-geeni: paired like homeodomain 2 [Internet]. [viitattu 17. lokakuuta 2026]. Saatavilla: https://dantelabs.com/fi/genes/pitx2
Yksi testi. Vastauksia koko elämäksi.
Alkaen 449 $Ilmainen toimitus · Tulokset 6–8 viikossa