Gen
COL9A3
collagen type IX alpha 3 chain
- HGNC 2219↗(otwiera się w nowej karcie)
- Gen Ensembl ENSG00000092758↗(otwiera się w nowej karcie)
- NCBI Gene 1299↗(otwiera się w nowej karcie)
Podsumowanie
- Lokalizacja cytogenetyczna
- 20q13.33
- Współrzędne
- Chromosom 20: 62 817 050–62 841 159 (GRCh38)
- Eksony
- 32 eksonów na odcinku 24,1 kb
- Białko
- 684 aminokwasów
- Znany również jako
- IDD, MED, EDM3, FLJ90759, DJ885L7.4.1
- Transkrypt MANE Select
- ENST00000649368.1NM_001853.4
- Typ locus
- gene with protein product
- Bardzo wysoka
- Pewna
- Niska
- Bardzo niska
Odczytaj COL9A3 oraz resztę swojego genomu dzięki jednemu badaniu.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni
Zamawiam Genome TestWyselekcjonowane raporty dotyczące tego genu
Dysplazje nasadowe i spondyloepifizarne
- Wielonasadowa dysplazja nasadowa
Grupa schorzeń dotyczących końców długich kości, powodujących bóle i sztywność stawów oraz wczesną chorobę zwyrodnieniową stawów, wywoływanych przez geny m.in. COMP, MATN3, COL9A1, COL9A2, COL9A3 i SLC26A2.
- 2 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Witreoretinopatia
- Witreoretinalna degeneracja
- ClinGen ocenia związek jako: definitywne
- 5 podmiotów GenCC ocenia go jako definitywny lub silny
Budowa genu COL9A3
- Sekwencja kodująca
- Region nieulegający translacji
- Intron
- Kierunek transkrypcji
- Znane miejsca powodujące choroby
- Odcinki, z którymi krótkie odczyty mają trudność
Eksony transkryptu MANE Select genu (wydanie v1.5) z NCBI i EMBL-EBI, na referencyjnym genomie GRCh38.
Prążki chromosomowe z ideogramu UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Pobliskie geny z wydania Ensembl 116, na GRCh38.
Eksony stanowią 2,5 kb z 24,1 kb genu; 2055 z tych zasad kodują białko.
Jak test genomu odczytuje COL9A3
16
pozycje w COL9A3, w których ClinVar klasyfikuje zmianę jako patogenną lub prawdopodobnie patogenną
Żadne z nich nie przypada na region, który krótkie odczyty trudno odczytać.
Pełne sekwencjonowanie genomu obejmuje wszystkie 24,1 kb genu COL9A3, łącznie z intronami, a nie tylko 2,5 kb eksonów.
Geny powiązane z tymi samymi schorzeniami
- COL9A1collagen type IX alpha 1 chainWspólnych schorzeń: 2
- COL9A2collagen type IX alpha 2 chainWspólnych schorzeń: 2
- BEST1bestrophin 1Wspólne schorzenie: 1
- CAPN5calpain 5Wspólne schorzenie: 1
- COL11A1collagen type XI alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL18A1collagen type XVIII alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COL2A1collagen type II alpha 1 chainWspólne schorzenie: 1
- COMPcartilage oligomeric matrix proteinWspólne schorzenie: 1
- CTNNB1catenin beta 1Wspólne schorzenie: 1
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Wspólne schorzenie: 1
- FZD4frizzled class receptor 4Wspólne schorzenie: 1
- KCNJ13potassium inwardly rectifying channel subfamily J member 13Wspólne schorzenie: 1
Cechy powiązane z genem COL9A3
Human Phenotype Ontology wymienia te cechy jako objawy rzadkich schorzeń, które może wywoływać COL9A3. Na stronie każdej cechy znajdują się inne geny z nią powiązane.
Abnormality of limbs
- Dropped arches
- Internal tibial torsion
- Pes valgus
- Limb undergrowth
- Limited knee straightening
- Reduced arm span
- Abnormal kneecap
- Abnormal radial epiphysis morphology
Pokaż jeszcze 15 cech
- Abnormality of end part of the elbow bone
- Abnormality of the ankle
- Abnormality of the end part of the foot bone
- Abnormality of the knee
- Bilateral coxa valga
- Broad femoral neck
- Coxa vara
- Fragmentation of end part of the long bone of hand
- Knock knees
- Limited elbow extension
- Outward bow-leggedness
- Radially deviated wrists
- Ulnar deviated club hands
- Abnormality of the hip joint
- Shortened long bone of hand
Abnormality of the eye
- Astigmatism
- Severe near sightedness
- Abnormal vitreous humor morphology
- Close sighted
- Clouding of the lens of the eye
- Drooping upper eyelid
- Moderate myopia
- Vitreoretinopathy
Pokaż jeszcze 2 cech
Linki zewnętrzne
Rekordy genów
Transkrypt
Białko
Skąd pochodzą te dane
- HGNC: symbol genu, jego nazwa, inne symbole i położenie.
- MANE Select v1.5, z NCBI i EMBL-EBI: transkrypt, jego eksony i sekwencja kodująca.
- GenCC i ClinGen, wydanie 2026-10-16: z jakimi schorzeniami gen jest powiązany i jak silne jest to powiązanie.
- Lista ACMG dotycząca wtórnych wyników, SF v3.2.
- ClinVar i stratyfikacje GIAB: znane miejsca powodujące choroby oraz regiony, które krótkie odczyty trudno odczytać.
- Human Phenotype Ontology, wersja 2026-09-01: cechy powiązane z genem. Więcej informacji znajdą Państwo na hpo.jax.org.
- Wydanie danych 2026.10.16-c6eea6bf.
Cytuj tę stronę
Dante Labs. (b.d.). Gen COL9A3: collagen type IX alpha 3 chain. Pobrano 17 października 2026, z https://dantelabs.com/pl/genes/col9a3
Dante Labs. Gen COL9A3: collagen type IX alpha 3 chain [Internet]. [cytowano 17 października 2026]. Dostępne w: https://dantelabs.com/pl/genes/col9a3
Jeden test. Odpowiedzi na całe życie.
Od 449 $Bezpłatna wysyłka · Wyniki w ciągu 6–8 tygodni