Gen
TUBA1A
tubulin alpha 1a
- HGNC 20766↗(opent in een nieuw tabblad)
- Ensembl-gen ENSG00000167552↗(opent in een nieuw tabblad)
- NCBI Gene 7846↗(opent in een nieuw tabblad)
Samenvatting
- Cytogenetische locatie
- 12q13.12
- Coördinaten
- Chromosoom 12: 49.184.795–49.189.080 (GRCh38)
- Exons
- 4 exons over 4,3 kb
- Eiwit
- 451 aminozuren
- Ook bekend als
- TUBA3, B-ALPHA-1, FLJ25113
- MANE Select-transcript
- ENST00000301071.12NM_006009.4
- Type locus
- Eiwitcoderend
- Zeer hoog
- Betrouwbaar
- Laag
- Zeer laag
Deze pagina als gegevens
Voeg .json toe aan het adres van de pagina, of vraag application/json aan, om haar als JSON te lezen.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/tuba1a.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameLees TUBA1A en de rest van uw genoom met één test.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken
Mijn Genome Test bestellenGecureerde rapporten over dit gen
Complexe corticale dysplasie en frontoparietale polymicrogyrie
- Complexe corticale dysplasie met andere hersenmissvormingen
Wordt veroorzaakt door veranderingen in genen voor microtubuli, de inwendige steunstructuur van de cel, die zenuwcellen naar hun plaats in de zich ontwikkelende hersenen leiden. Hierbij horen TUBB2B en KIF26A; veranderingen in KIF26A treffen beide kopieën en zijn recessief.
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
Zorg omvat behandeling van epileptische aanvallen, ontwikkelings-, fysiotherapeutische en onderwijsondersteuning, en controle van voeding en oogbewegingen. Erfelijkheidsadvies helpt het herhalingsrisico te verduidelijken; bij KIF26A is draagerstesting voor familieleden beschikbaar.
Aangeboren craniale dysinnervatiestoornissen
- Congenitale fibrose van de extraoculaire spieren
Een groep aandoeningen, veroorzaakt door veranderingen in genen zoals KIF21A, TUBB3 en PHOX2A, waarbij de oogbewegingen beperkt zijn en de oogleden vaak vanaf de geboorte hangen.
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
Een genetische diagnose verklaart de aandoening, kan helpen bij het plannen van operaties aan de oogspieren en ooglid en geeft inzicht in het herhalingsrisico.
Lissencefalie-spectrumstoornissen
Veroorzaakt door veranderingen in genen die bepalen hoe zenuwcellen zich in de zich ontwikkelende hersenen op hun plaats begeven. Dit rapport omvat DCX op het X-chromosoom en APC2 (recessief).
- 4 GenCC-indieners beoordelen het als definitief of sterk
▶Actionability
De zorg richt zich op de behandeling van epileptische aanvallen, voeding, fysiotherapie en ontwikkelingsondersteuning. Erfelijkheidsadvies hangt af van het gen: dominante veranderingen ontstaan vaak de novo, DCX kan worden overgeërfd van een draagster-moeder, en recessieve vormen worden doorgegeven door twee draagster-ouders.
Tubulinopathieën
- Tubulinopathie (TUBA1A, TUBB2A)Autosomaal dominant
Veroorzaakt door een verandering in één kopie van een tubulinegen zoals TUBA1A of TUBB2A, die bouwstenen coderen van microtubuli die nodig zijn voor de migratie van zenuwcellen. Veranderingen ontstaan meestal de novo en veranderen het eiwit, in plaats van het weg te laten vallen.
- ClinGen beoordeelt het verband als definitief
- 1 GenCC-indiener beoordeelt het als definitief of sterk
▶Actionability
Behandeling van epileptische aanvallen, fysiotherapie, voeding en ontwikkelingsondersteuning onder begeleiding van een neuroloog. De meeste gevallen ontstaan de novo, daarom geeft erfelijkheidsadvies en onderzoek bij de ouders inzicht in het herhalingsrisico.
Opbouw van TUBA1A
- Coderende sequentie
- Niet-vertaald gebied
- Intron
- Richting van transcriptie
- Bekende ziekteveroorzakende posities
- Gebieden die korte reads moeilijk vinden
Exonen van het MANE Select-transcript van het gen (release v1.5), afkomstig van NCBI en EMBL-EBI, op het GRCh38-referentiegenoom.
Chromosoombanden uit het ideogram van UCSC's GRCh38 (2022-10-29).
Genen in de buurt uit Ensembl-release 116, op GRCh38.
Exonen vormen 1,7 kb van de 4,3 kb van het gen; 1.356 van die basen coderen voor het eiwit.
Sequencing van TUBA1A
79Moeilijk
Hoe moeilijk TUBA1A is te sequencen met korte reads, op een schaal van 100
0 · Makkelijk100 · Moeilijk
Een groot deel van TUBA1A ligt op plaatsen waar korte reads een wijziging kunnen missen of verkeerd kunnen plaatsen.
Wat dit verergert: het aandeel van de exonen van TUBA1A in elk type moeilijke regio
- MapbaarheidStukken waar reads van 100 of 250 bp niet op één unieke plaats kunnen worden geplaatst, waardoor een call daar ontbrekend of onjuist kan zijn. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 100 krijgen.52%
- HomologieSegmentale duplicaties: kopieën elders in het genoom, zoals paralogen en pseudogenen, met 90% identiteit of meer. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 60 krijgen.92%
- Gedeeld met chrYDe pseudoautosomale regio's en de X-getransponeerde regio, waar chrX en chrY dezelfde of bijna dezelfde sequentie bevatten, zodat een read van de ene op de andere kan worden geplaatst. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 60 krijgen.0%
- ReferentiedekkingHiaten in de nabijgelegen referentie-assemblage, waar geen sequentie is waarop reads kunnen worden uitgelijnd. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 50 krijgen.0%
- HerhalingenTandemherhalingen en reeksen van één base, waarop reads kunnen verschuiven en die ze mogelijk niet overspannen. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 30 krijgen.0%
- GC-gehalteVensters met minder dan 25% of meer dan 65% G en C, die bij de bibliotheekvoorbereiding slechts dun worden gedekt. Op zichzelf zou een gen dat volledig in dit type regio ligt een score van 20 krijgen.3,4%
Een Dante Labs-score op basis van ons eigen onderzoek, gebouwd op de Genome in a Bottle-kaarten van NIST met moeilijk te sequencen regio's.Zo wordt er gescoordElke balk is het aandeel van de exonbasen van TUBA1A in dat type moeilijke regio. Elk type kan op zichzelf een gen moeilijk maken, en elk extra type voegt steeds minder toe: 0 wanneer geen enkele base in een moeilijke regio ligt, 100 wanneer elke base ligt waar reads niet op één unieke plaats kunnen worden geplaatst.
155
posities in TUBA1A waar ClinVar een wijziging als pathogeen of waarschijnlijk pathogeen classificeert
154 ervan (99%) vallen in regio's die korte reads moeilijk vinden.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (89 locaties)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (154 locaties)
Een heel genoom dekt alle 4,3 kb van TUBA1A, inclusief de introns, en niet alleen de 1,7 kb aan exonen.
ClinVar pathogenic variants (173)
The TUBA1A variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Pathogeen 70
- Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen 14
- Waarschijnlijk pathogeen 89
| Variant | Conditions | ClinVar-classificatie | Reviewstatus |
|---|---|---|---|
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1265G>A (p.Arg422His) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1169G>A (p.Arg390His) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.986A>G (p.Asn329Ser) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.790C>T (p.Arg264Cys) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.518C>T (p.Pro173Leu) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 2 others | Pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1264C>T (p.Arg422Cys) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1225G>A (p.Val409Ile) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1204C>T (p.Arg402Cys) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1169G>C (p.Arg390Pro) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1168C>T (p.Arg390Cys) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1105G>A (p.Ala369Thr) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.958C>T (p.Arg320Cys) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.791G>A (p.Arg264His) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.641G>A (p.Arg214His) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.379G>A (p.Asp127Asn) (opens in a new tab) | tubulinopathy | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.352G>A (p.Val118Met) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.302A>G (p.Asn101Ser) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.190C>T (p.Arg64Trp) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.5G>A (p.Arg2His) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 2 others | Pathogeen/waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.521C>T (p.Ala174Val) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 2 others | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.367C>T (p.Arg123Cys) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation and 1 other | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.3+3del (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation | Waarschijnlijk pathogeen | ★★★★2 sterren van de 4 criteria opgegeven, meerdere indieners, geen conflicten |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1307G>A (p.Gly436Asp) (opens in a new tab) | tubulinopathy | Pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1306G>C (p.Gly436Arg) (opens in a new tab) | tubulinopathy | Pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
| NM_006009.4(TUBA1A):c.1288_1302del (p.Lys430_Glu434del) (opens in a new tab) | lissencephaly due to TUBA1A mutation | Pathogeen | ★★★★1 ster van de 4 criteria opgegeven, één indiener |
See all 173 with every other TUBA1A variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Genen die aan dezelfde aandoeningen zijn gekoppeld
- TUBB3tubulin beta 3 class IIIDeelt 3 aandoeningen
- APC2APC regulator of Wnt signaling pathway 2Deelt 2 aandoeningen
- CTNNA2catenin alpha 2Deelt 2 aandoeningen
- TUBBtubulin beta class IDeelt 2 aandoeningen
- TUBB2Atubulin beta 2A class IIaDeelt 2 aandoeningen
- TUBG1tubulin gamma 1Deelt 2 aandoeningen
- ACTBactin betaDeelt 1 aandoening
- ACTG1actin gamma 1Deelt 1 aandoening
- ADGRG1adhesion G protein-coupled receptor G1Deelt 1 aandoening
- ARXaristaless related homeoboxDeelt 1 aandoening
- CAMSAP1calmodulin regulated spectrin associated protein 1Deelt 1 aandoening
- CDK5cyclin dependent kinase 5Deelt 1 aandoening
Kenmerken gekoppeld aan TUBA1A
De Human Phenotype Ontology vermeldt deze als kenmerken van de zeldzame aandoeningen die TUBA1A kan veroorzaken. Op de pagina van elk kenmerk staan de andere genen die ermee verband houden.
Abnormality of the nervous system
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Global developmental delay
- Ventriculomegaly
- Abnormal corpus callosum morphology
- Abnormal shape of brainstem
- Abnormal thalamus morphology
- Abnormality of the internal capsule
- Akinesia
Toon 36 kenmerken meer
- Decreased muscle movement
- Dysgenesis of the basal ganglia
- Dysgyria
- Excessive daytime sleepiness
- Hypoplasia of the pons
- Abnormal morphology of the olfactory bulb
- Agenesis of corpus callosum
- Agyria
- Attention deficit
- Dilated fourth ventricle
- Dysgenesis of the hippocampus
- Epilepsy
- Fewer and broader ridges in brain
- Fewer or absent grooves in brain
- Grand mal seizures
- Hypoplastic anterior limbs of the internal capsule
- Small brainstem
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Aplasia of the olfactory bulb
- Ataxia
- Brief seizures with staring spells
- Delayed motor skills
- Dysplastic corpus callosum
- Generalized tonic seizure
- Infantile spasms
- Intellectual disability
- More grooves in brain
- Partial agenesis of the corpus callosum
- Perisylvian polymicrogyria
- Periventricular laminar heterotopia
- Seizure affecting one half of brain
- Small hippocampus
- Startle-induced seizure
- Gray matter heterotopia
- Intellectual disability, severe
- Motor delay
Abnormality of the eye
- Abnormal best corrected visual acuity test
- Abnormality of ocular abduction
- Absent Bell phenomenon
- Cross-eyed
- Drooping upper eyelid
- Impaired ocular adduction
- Limited vertical extraocular movement
- Outward facing eye ball
Toon 19 kenmerken meer
- Slow pupillary light response
- Abnormal electroretinogram
- Abnormal involuntary eye movements
- Abnormal visual field test
- Abnormality of refraction
- Compensatory chin elevation
- Constricted pupils
- Irregular pupil
- Lazy eye
- Nonprogressive restrictive external ophthalmoplegia
- Oculomotor apraxia
- Wide-set eyes
- Asymmetric pupil sizes
- Clouding of the lens of the eye
- Drooping of both upper eyelids
- Involuntary, rapid, rhythmic eye movements
- Inward turning cross eyed
- Marcus Gunn jaw winking synkinesis
- Optic nerve hypoplasia
Abnormality of head or neck
- Abnormally small head
- Congenital fibrosis of extraocular muscles
- Levator palpebrae superioris atrophy
- Little lower jaw
- Cleft palate
- Cystic hygroma
- Depressed nasal bridge
- Small retruded chin
Toon 4 kenmerken meer
Externe links
Genrecords
Transcript
Eiwit
Waar dit vandaan komt
- HGNC: het symbool, de naam, andere symbolen en de locatie van het gen.
- MANE Select v1.5, van NCBI en EMBL-EBI: het transcript, de exonen en de coderende sequentie.
- GenCC en ClinGen, uitgebracht in 2026-10-19: welke aandoeningen aan het gen zijn gekoppeld en hoe sterk die koppeling is.
- De ACMG-lijst met secundaire bevindingen, SF v3.2.
- ClinVar en de GIAB-stratificaties: bekende ziekteveroorzakende posities en de regio's die short reads moeilijk vinden.
- De genoomstratificaties van Genome in a Bottle, van NIST: de score voor de moeilijkheid van sequencing.
- De Human Phenotype Ontology, versie 2026-09-01: de kenmerken die aan het gen zijn gekoppeld. Meer informatie vindt u op hpo.jax.org.
- Gegevensrelease 2026.10.19-9814e911.
Deze pagina citeren
Dante Labs. (z.d.). TUBA1A-gen: tubulin alpha 1a. Geraadpleegd op 19 oktober 2026, van https://dantelabs.com/nl/genes/tuba1a
Dante Labs. TUBA1A-gen: tubulin alpha 1a [Internet]. [geraadpleegd 19 oktober 2026]. Beschikbaar op: https://dantelabs.com/nl/genes/tuba1a
Eén test. Een leven lang antwoorden.
Vanaf $ 449Gratis verzending · Resultaten binnen 6–8 weken