Gén
MYLK
myosin light chain kinase
- HGNC 7590↗(új lapon nyílik meg)
- Ensembl gén ENSG00000065534↗(új lapon nyílik meg)
- NCBI Gene 4638↗(új lapon nyílik meg)
Összefoglalás
- Citogenetikai elhelyezkedés
- 3q21.1
- Koordináták
- 3. kromoszóma: 123 610 049–123 884 332 (GRCh38)
- Exonok
- 34 exon, összesen 274,3 kb
- Fehérje
- 1914 aminosav
- Más néven ismert
- MLCK, smMLCK, MYLK1, MLCK1, KRP, Telokin, MLCK108, MLCK210, MYLK-L
- MANE Select transzkriptum
- ENST00000360304.8NM_053025.4
- Lokusz típusa
- Fehérjét kódoló
- Nagyon magas
- Megbízható
- Alacsony
- Nagyon alacsony
Ez az oldal adatként
Adja hozzá a .json végződést az oldal címéhez, vagy kérjen application/json típust, hogy JSON-ként olvassa be.
library(jsonlite)
url <- "https://dantelabs.com/genes/mylk.json"
page <- fromJSON(url)
page$gene$nameOlvassa el a MYLK-t és genomja többi részét egyetlen teszttel.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt
Kérem a Genome TestemetEhhez a génhez kapcsolódó, kurált jelentések
Aortic Aneurysm
- Familial Thoracic Aortic Aneurysm and DissectionAutoszomális domináns
Inherited widening and tearing of the thoracic aorta, caused by changes in genes such as ACTA2, MYH11, MYLK, LOX, PRKG1, MFAP5 and THSD4.
- A ClinGen a kapcsolatot a következőként minősíti: erős
- 2 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Knowing about it supports regular aortic imaging, blood pressure control and timely preventive surgery, and screening of relatives.
Hereditary Visceral Myopathy, CIPO & MMIHS
- Megacystis-microcolon-intestinal hypoperistalsis syndrome (MMIHS)
A severe newborn condition with a greatly enlarged bladder, a small colon and poor bowel movement, caused by variants in smooth-muscle genes such as ACTG2, MYH11, MYLK, MYL9 and LMOD1.
- 1 GenCC-beküldő szerint bizonyított vagy erős
▶Beavatkozhatóság
Early diagnosis supports planning for nutritional support, bladder drainage and, in some cases, transplant.
A MYLK felépítése
- Kódoló szekvencia
- Transzlálatlan régió
- Intron
- A transzkripció iránya
- Ismert betegségokozó helyek
- Olyan szakaszok, amelyeket a rövid olvasatok nehezen értelmeznek
A gén MANE Select átiratának exonjai (kiadás: v1.5), az NCBI és az EMBL-EBI adatai alapján, a GRCh38 referencia-genomon.
Kromoszómasávok az UCSC GRCh38 ideogramjából (2022-10-29).
Közeli gének az Ensembl 116 kiadásából, GRCh38 szerint.
Az exonok a gén 274,3 kb-jából 10,1 kb-ot tesznek ki; ezek közül 5745 bázis kódolja a fehérjét.
MYLK szekvenálása
16Közepes
Mennyire nehéz a MYLK rövid olvasatokkal történő szekvenálása, 100-ból
0 · Könnyű100 · Nehéz
A MYLK exonjainak egy része olyan helyen van, ahol a rövid olvasatok elronthatnak vagy rosszul helyezhetnek el egy változást.
Ehhez hozzájárul: a MYLK exonjainak aránya az egyes típusú nehéz régiókban
- LeképezhetőségOlyan szakaszok, ahol a 100 vagy 250 bp-os olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen, így a hívás ott hiányozhat vagy hibás lehet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 100 pontot kapna.2,9%
- HomológiaSzegmentális duplikációk: a genomban máshol található másolatok, például paralógok és pszeudogének, legalább 90%-os azonossággal. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.18%
- Közös a chrY-nalA pszeudoautoszomális régiók és az X-transzponált régió, ahol a chrX és a chrY azonos vagy szinte azonos szekvenciát hordoz, így az egyikről származó olvasat a másikra kerülhet. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 60 pontot kapna.0%
- Referencia-lefedettségA referencia-összeszerelésben a közelben lévő hiányok, ahol nincs olyan szekvencia, amelyhez az olvasatok igazodhatnának. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 50 pontot kapna.0%
- IsmétlődésekTandem ismétlődések és egyetlen bázisból álló szakaszok, amelyeken az olvasatok megcsúszhatnak, és amelyeket nem biztos, hogy teljes egészükben át tudnak fogni. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 30 pontot kapna.4,2%
- GC-tartalom25% alatti vagy 65% feletti G- és C-tartalmú ablakok, amelyeket a könyvtárkészítés gyengén fed le. Egy teljesen ilyen típusú régióban lévő gén önmagában 20 pontot kapna.10%
A Dante Labs saját kutatásán alapuló pontszám, amely a NIST Genome in a Bottle térképein alapul, a nehezen szekvenálható régiókról.Így számítjuk kiMinden oszlop a MYLK exonbázisainak azon részét mutatja, amely az adott típusú nehéz régióban van. Bármelyik típus önmagában nehezíthet egy gént, és minden további típus egyre kevesebbet ad hozzá: 0, ha egyetlen bázis sincs ilyen régióban, 100, ha minden bázis olyan helyen van, ahol az olvasatok nem helyezhetők el egyértelműen.
65
a MYLK azon pozíciói, ahol a ClinVar kórokozónak vagy valószínűleg kórokozónak minősíti a változást
Ezek közül 16 (25%) olyan régiókban van, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- Low mappabilityRegions where 100 bp or 250 bp reads cannot be placed uniquely. (1 hely)
- Segmental duplicationsCopies of at least 1 kb sharing at least 90% identity with another part of the genome (paralogues, pseudogenes); reads may align to the wrong copy. (16 hely)
A teljes genom a MYLK mind a 274,3 kb-ját lefedi, az intronokat is beleértve, nem csak az 10,1 kb exont.
ClinVar pathogenic variants (67)
The MYLK variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Patogén 45
- Valószínűleg patogén 22
| Variáns | Conditions | ClinVar-besorolás | Felülvizsgálati állapot |
|---|---|---|---|
| NM_053025.4(MYLK):c.5197A>T (p.Lys1733Ter) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.5169del (p.Lys1724fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.5083_5092del (p.Phe1695fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4874del (p.Pro1625fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4568dup (p.Cys1524fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4522C>T (p.Gln1508Ter) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4489_4493del (p.Ala1497fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4470G>A (p.Trp1490Ter) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4459C>T (p.Arg1487Ter) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4451dup (p.Lys1485fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4438C>T (p.Arg1480Ter) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 and 1 other | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4422del (p.Lys1474fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4414dup (p.Ser1472fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4404_4407del (p.Glu1468fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4377dup (p.Val1460fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4114del (p.Asp1372fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4112G>A (p.Trp1371Ter) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4098C>A (p.Tyr1366Ter) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4093_4094del (p.Ser1365fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4091_4092del (p.Gln1364fs) (opens in a new tab) | familial thoracic aortic aneurysm and aortic dissection | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4056G>A (p.Trp1352Ter) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.4001dup (p.Ala1335fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.3989del (p.Lys1330fs) (opens in a new tab) | familial thoracic aortic aneurysm and aortic dissection | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.3967dup (p.Val1323fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
| NM_053025.4(MYLK):c.3876_3937del (p.Ser1293fs) (opens in a new tab) | aortic aneurysm, familial thoracic 7 | Patogén | ★★★★1 csillag a 4-ből kritériumok megadva, egy beküldő |
See all 67 with every other MYLK variant in ClinVar → (opens in a new tab)
Ugyanazokhoz a betegségekhez kapcsolódó gének
- MYH11myosin heavy chain 112 betegséget oszt meg
- ACTA2actin alpha 2, smooth muscle1 betegséget oszt meg
- FBN1fibrillin 11 betegséget oszt meg
- FOXE3forkhead box E31 betegséget oszt meg
- LOXlysyl oxidase1 betegséget oszt meg
- MFAP5microfibril associated protein 51 betegséget oszt meg
- MYL9myosin light chain 91 betegséget oszt meg
- PRKG1protein kinase cGMP-dependent 11 betegséget oszt meg
- TGFB2transforming growth factor beta 21 betegséget oszt meg
- TGFBR1transforming growth factor beta receptor 11 betegséget oszt meg
- TGFBR2transforming growth factor beta receptor 21 betegséget oszt meg
- THSD4thrombospondin type 1 domain containing 41 betegséget oszt meg
A(z) MYLK génhez kapcsolódó tulajdonságok
Az Emberi Fenotípus Ontológia ezeket a ritka betegségek jellemzőiként sorolja fel, amelyeket a(z) MYLK gén okozhat. Az egyes tulajdonságok oldalán fel vannak tüntetve a hozzájuk kapcsolódó további gének.
Abnormality of the cardiovascular system
- Cutis marmorata
- Mucoid extracellular matrix accumulation
- Abnormal left ventricular function
- Aortic regurgitation
- Aortic rupture
- Ascending aortic dissection
- Descending aortic dissection
- Enlarged heart
Még 18 tulajdonság megjelenítése
- High blood pressure
- Plaque build-up in arteries supplying blood to heart
- Abdominal aortic aneurysm
- Abnormal cardiovascular system morphology
- Aortic valve has two leaflets rather than three
- Brain aneurysm
- Bulge in wall of root of large artery that carries blood away from heart
- Carotid artery dilatation
- Depleted blood volume
- Descending thoracic aorta aneurysm
- Heart tumor
- Ischemic stroke
- Mini stroke
- Patent ductus arteriosus
- Peripheral arterial stenosis
- Stroke
- Tear in inner wall of large artery that carries blood away from heart
- Bulge in wall of large artery that carries blood away from heart
Abnormality of the digestive system
- Abdominal bloating
- Hypoperistalsis
- Microcolon
- Nausea and vomiting
- Abnormality of the gastrointestinal tract
- Intestinal malrotation
- Inguinal hernia
- Omphalocele
Még 1 tulajdonság megjelenítése
Külső hivatkozások
Génadatok
Átirat
Fehérje
Az adatok forrásai
- HGNC: a gén jelölése, neve, egyéb jelölései és elhelyezkedése.
- MANE Select v1.5, az NCBI és az EMBL-EBI adatai: a transzkriptum, exonjai és kódoló szekvenciája.
- GenCC és ClinGen, 2026-10-19 kiadás: mely állapotokhoz kapcsolódik a gén, és milyen erős a kapcsolat.
- Az ACMG másodlagos leletek listája, SF v3.2.
- ClinVar és a GIAB-stratifikációk: ismert betegséget okozó helyek és azok a régiók, amelyeket a rövid olvasatok nehezen kezelnek.
- A Genome in a Bottle genomstratifikációi a NIST-től: a szekvenálási nehézségi pontszám.
- Az Emberi Fenotípus Ontológia, 2026-09-01. kiadás: a génhez kapcsolódó tulajdonságok. További információ: hpo.jax.org.
- Adatkiadás: 2026.10.19-9814e911.
Az oldal idézése
Dante Labs. (n.d.). MYLK gén: myosin light chain kinase. Lekérve: 2026. október 20., forrás: https://dantelabs.com/hu/genes/mylk
Dante Labs. MYLK gén: myosin light chain kinase [Internet]. [idézve: 2026. október 20.]. Elérhető: https://dantelabs.com/hu/genes/mylk
Egy teszt. Egy életen át tartó válaszok.
449 $-tólIngyenes szállítás · Eredmények 6–8 hét alatt