Gène
TSEN15
tRNA splicing endonuclease subunit 15
- HGNC 16791↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000198860↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 116461↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 1q25.3
- Coordonnées
- Chromosome 1 : 184 051 730–184 074 212 (GRCh38)
- Exons
- 5 exons sur 22,5 kb
- Protéine
- 171 acides aminés
- Symboles précédents
- C1orf19
- Transcrit MANE Select
- ENST00000645668.2NM_052965.4
- Type de locus
- Codant pour une protéine
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
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Hypoplasie ponto-cérébelleuse (TSEN54 et MINPP1)
- Hypoplasie ponto-cérébelleuseAutosomique récessif
Causée par des modifications des deux copies de TSEN54 ou de MINPP1. TSEN54 fait partie d'une enzyme qui traite l'ARN de transfert, et une modification fréquente, p.Ala307Ser, est retrouvée dans l'hypoplasie ponto-cérébelleuse de type 2. Les modifications de MINPP1 provoquent une forme distincte, de type 16.
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
La prise en charge est de soutien, avec une aide à l'alimentation, un traitement des crises et des mouvements, de la kinésithérapie et des soins palliatifs. Le conseil génétique explique l'hérédité récessive, et un dépistage des porteurs ainsi qu'un diagnostic prénatal sont disponibles pour les familles.
Amyotrophie spinale
Groupe d'affections caractérisées par la dégénérescence des cellules de la corne antérieure de la moelle épinière, entraînant une faiblesse et une atrophie musculaires progressives.
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
Thérapie génique (onasemnogene abeparvovec), traitement par oligonucléotides antisens (nusinersen), modulateur d'épissage par voie orale (risdiplam), soins de support
Regroupements plus larges
Maladies neurodégénératives héréditaires
- Maladie neurodégénérative liée à KIF5AAutosomique dominant
L'un des 372 gènes qui lui sont liés
Causée par des modifications d'une copie du gène KIF5A, qui code une protéine motrice dotée d'une queue de liaison à sa cargaison. Différents types de modifications entraînent différentes affections : la paraplégie spastique héréditaire de type 10, une forme axonale de la maladie de Charcot-Marie-Tooth et la sclérose latérale amyotrophique (SLA).
- 3 évaluateurs GenCC le classent comme définitif ou fort
▶Actionnabilité
La prise en charge est symptomatique et dépend de la forme clinique ; elle comprend la kinésithérapie, des médicaments contre la spasticité et un suivi pluridisciplinaire de la SLA. Chaque enfant d'une personne atteinte a une chance sur 2 d'hériter de la modification ; le conseil génétique aide les familles à comprendre ce risque.
Structure de TSEN15
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 1,9 kb sur les 22,5 kb du gène ; 516 de ces bases codent pour la protéine.
Séquençage de TSEN15
1
position de TSEN15 où ClinVar classe une variation comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une zone que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome complet couvre les 22,5 kb de TSEN15, introns compris, et pas seulement les 1,9 kb d'exons.
ClinVar pathogenic variants (1)
The TSEN15 variants ClinVar classifies pathogenic or likely pathogenic for any condition, reviewed by at least one submitter with criteria, and the most reviewed of them. It is ClinVar's public record of the gene, never a result.
- Probablement pathogène 1
| Variant | Conditions | Classification ClinVar | Statut de révision |
|---|---|---|---|
| NM_052965.4(TSEN15):c.346C>T (p.His116Tyr) (opens in a new tab) | pontocerebellar hypoplasia, type 2F | Probablement pathogène | ★★★★1 étoile sur 4 critères fournis, un seul soumetteur |
Gènes liés aux mêmes affections
- EXOSC3exosome component 3Partage 3 affections
- EXOSC8exosome component 8Partage 3 affections
- SEPSECSSep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthasePartage 3 affections
- TSEN2tRNA splicing endonuclease subunit 2Partage 3 affections
- TSEN54tRNA splicing endonuclease subunit 54Partage 3 affections
- VRK1VRK serine/threonine kinase 1Partage 3 affections
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Partage 2 affections
- ATP7AATPase copper transporting alphaPartage 2 affections
- BICD2BICD cargo adaptor 2Partage 2 affections
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinPartage 2 affections
- CHCHD10coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10Partage 2 affections
- COASYCoenzyme A synthasePartage 2 affections
Traits associés à TSEN15
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que TSEN15 peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the nervous system
- Delayed fine motor development
- Delayed speech and language development
- Extra-axial cerebrospinal fluid accumulation
- Global developmental delay
- Hypoplasia of the pons
- Intellectual disability
- Small cerebellum
- Cerebellar vermis hypoplasia
Afficher 26 traits supplémentaires
- Choreoathetosis
- Difficulty sleeping
- Epilepsy
- Generalized myoclonic seizure
- Hypoplasia of the ventral pons
- Severe global developmental delay
- Decrease in size of the outer layer of the brain due to loss of brain cells
- Delayed motor skills
- Infantile spasms
- Irritability
- Motor delay
- Paroxysmal dystonia
- Small brainstem
- Thin corpus callosum
- Abnormal cortical gyration
- Babinski sign
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Decreased reflex response
- Dysplastic corpus callosum
- Inability to walk
- Increased reflexes
- Simple febrile seizure
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Widened cerebellar subarachnoid space
- Cerebellar cyst
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où proviennent ces données
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, issu de NCBI et d'EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés en 2026-10-18 : les maladies auxquelles le gène est associé et la solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.18-8b139e39.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène TSEN15 : tRNA splicing endonuclease subunit 15. Consulté le 18 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/tsen15
Dante Labs. Gène TSEN15 : tRNA splicing endonuclease subunit 15 [Internet]. [consulté le 18 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/tsen15
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