Gène
SEPSECS
Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase
- HGNC 30605↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène Ensembl ENSG00000109618↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
- Gène NCBI 51091↗(s'ouvre dans un nouvel onglet)
Résumé
- Localisation cytogénétique
- 4p15.2
- Coordonnées
- Chromosome 4 : 25 120 014–25 160 449 (GRCh38)
- Exons
- 11 exons sur 40,4 kb
- Protéine
- 501 acides aminés
- Aussi appelé
- SLA/LP, SLA, SLA-p35, SecS
- Transcrit MANE Select
- ENST00000382103.7NM_016955.4
- Type de locus
- gene with protein product
- Très élevé
- Fiable
- Faible
- Très faible
Génome de référenceGRCh38hg38
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Obtenir mon Genome TestRapport d'expertise pertinent pour ce gène
Amyotrophie spinale
Groupe d'affections caractérisées par la dégénérescence des cellules de la corne antérieure de la moelle épinière, entraînant une faiblesse et une atrophie musculaires progressives.
- 5 soumetteurs GenCC le classent comme définitif ou fort
Ce que la connaissance change
Thérapie génique (onasemnogene abeparvovec), traitement par oligonucléotides antisens (nusinersen), modulateur d'épissage par voie orale (risdiplam), soins de support
Structure de SEPSECS
- Séquence codante
- Région non traduite
- Intron
- Sens de la transcription
- Sites connus associés à une maladie
- Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.
Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).
Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.
Les exons représentent 5,5 kb sur les 40,4 kb du gène ; 1 506 de ces bases codent pour la protéine.
Comment un test génomique lit SEPSECS
70
positions dans SEPSECS où ClinVar classe une modification comme pathogène ou probablement pathogène
Aucune d'entre elles ne se situe dans une région que les lectures courtes peinent à analyser.
Un génome entier couvre les 40,4 kb de SEPSECS, introns compris, et pas seulement les 5,5 kb d'exons.
Gènes liés aux mêmes affections
- ASAH1N-acylsphingosine amidohydrolase 1Partage 1 affection
- ATP7AATPase copper transporting alphaPartage 1 affection
- BICD2BICD cargo adaptor 2Partage 1 affection
- BSCL2BSCL2 lipid droplet biogenesis associated, seipinPartage 1 affection
- CHCHD10coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain containing 10Partage 1 affection
- DCTN1dynactin subunit 1Partage 1 affection
- DNAJB2DnaJ heat shock protein family (Hsp40) member B2Partage 1 affection
- DYNC1H1dynein cytoplasmic 1 heavy chain 1Partage 1 affection
- EMILIN1elastin microfibril interfacer 1Partage 1 affection
- EXOSC3exosome component 3Partage 1 affection
- EXOSC8exosome component 8Partage 1 affection
- FBXO38F-box protein 38Partage 1 affection
Traits associés à SEPSECS
L'Human Phenotype Ontology répertorie ces traits comme caractéristiques des maladies rares que SEPSECS peut provoquer. La page de chaque trait indique les autres gènes qui lui sont associés.
Abnormality of the nervous system
- Cerebellar vermis atrophy
- Epilepsy
- Global developmental delay
- Cerebellar vermis hypoplasia
- Choreoathetosis
- Difficulty sleeping
- Generalized myoclonic seizure
- Hypoplasia of the ventral pons
Afficher 23 traits supplémentaires
- Severe global developmental delay
- Small cerebellum
- Infantile spasms
- Motor delay
- Paroxysmal dystonia
- Small brainstem
- Abnormal cortical gyration
- Babinski sign
- Bilateral tonic-clonic seizure with generalized onset
- Dysplastic corpus callosum
- Simple febrile seizure
- Underdevelopment of part of brain called corpus callosum
- Ventriculomegaly
- Widened cerebellar subarachnoid space
- Cerebellar cyst
- Abnormal periventricular white matter morphology
- Chorea
- Clonus
- Degeneration of cerebellum
- Degeneration of cerebrum
- Delayed myelination
- IQ less than 20
- Irritability
Liens externes
Fiches de gènes
Transcrit
Protéine
D'où viennent ces informations
- HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
- MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.
- GenCC et ClinGen, publiés le 2026-10-16 : les affections auxquelles le gène est associé, et le niveau de solidité de ce lien.
- La liste ACMG des résultats secondaires, SF v3.2.
- ClinVar et les stratifications GIAB : les sites connus responsables de maladies, et les régions que les lectures courtes peinent à analyser.
- L'Human Phenotype Ontology, version 2026-09-01 : les traits associés au gène. Pour en savoir plus, rendez-vous sur hpo.jax.org.
- Version des données 2026.10.16-c6eea6bf.
Citer cette page
Dante Labs. (s.d.). Gène SEPSECS : Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase. Consulté le 16 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/sepsecs
Dante Labs. Gène SEPSECS : Sep (O-phosphoserine) tRNA:Sec (selenocysteine) tRNA synthase [Internet]. [consulté le 16 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/sepsecs
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