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Gène

COLGALT2

collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2

Résumé

Localisation cytogénétique
1q25.3
Coordonnées
Chromosome 1 : 183 935 834–184 037 728 (GRCh38)
Exons
12 exons sur 101,9 kb
Protéine
626 acides aminés
Aussi appelé
KIAA0584
Symboles précédents
C1orf17, GLT25D2
Transcrit MANE Select
ENST00000361927.9NM_015101.4
Type de locus
gene with protein product
  • Très élevé
  • Fiable
  • Faible
  • Très faible

Génome de référenceGRCh38

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Rapport d'expertise pertinent pour ce gène

Aucun rapport Genome Test ne lit encore COLGALT2. Le test séquence l'intégralité de votre génome, donc vos données l'incluent tout de même.

Structure de COLGALT2

  • Séquence codante
  • Région non traduite
  • Intron
  • Sens de la transcription
  • Régions que les lectures courtes peinent à analyser
Chromosome 1, avec un crochet à l'emplacement de COLGALT2. COLGALT2 et 7 gènes à proximité sur le chromosome 1, de 183 486 781 à 184 486 780.Chromosome 11q25.3p36.33p36.32p36.31p36.23p36.22p36.21p36.13p36.12p36.11p35.3p35.2p35.1p34.3p34.2p34.1p33p32.3p32.2p32.1p31.3p31.2p31.1p22.3p22.2p22.1p21.3p21.2p21.1p13.3p13.2p13.1p12p11.2p11.1q11q12q21.1q21.2q21.3q22q23.1q23.2q23.3q24.1q24.2q24.3q25.1q25.2q25.3q31.1q31.2q31.3q32.1q32.2q32.3q41q42.11q42.12q42.13q42.2q42.3q43q44183,6 Mb183,8 Mb184 Mb184,2 Mb184,4 MbSMG7 : 183 471 871–183 598 246, brin directSMG7NCF2 : 183 554 461–183 593 499, brin inverseNCF2ARPC5 : 183 620 846–183 635 908, brin inverseARPC5RGL1 : 183 636 066–183 928 532, brin directRGL1APOBEC4 : 183 646 275–183 653 316, brin inverseAPOBEC4COLGALT2 : 183 935 834–184 037 728, brin inverseCOLGALT2TSEN15 : 184 051 629–184 123 978, brin directTSEN15C1orf21 : 184 386 067–184 629 019, brin directC1orf21Schéma de COLGALT2 : 12 exons sur le brin inverse du chromosome 1Exon 12 : 183 935 834–183 939 037, 3 204 basesExon 11 : 183 940 581–183 940 787, 207 basesExon 10 : 183 944 196–183 944 323, 128 basesExon 9 : 183 945 432–183 945 564, 133 basesExon 8 : 183 951 007–183 951 113, 107 basesExon 7 : 183 954 762–183 954 838, 77 basesExon 6 : 183 963 901–183 964 020, 120 basesExon 5 : 183 969 269–183 969 473, 205 basesExon 4 : 183 973 616–183 973 750, 135 basesExon 3 : 183 975 097–183 975 214, 118 basesExon 2 : 183 978 410–183 978 520, 111 basesExon 1 : 184 037 095–184 037 728, 634 bases1210864215′3′

Exons du transcrit MANE Select du gène (version v1.5), issus de NCBI et d'EMBL-EBI, sur le génome de référence GRCh38.

Bandes chromosomiques issues de l'idéogramme UCSC GRCh38 (2022-10-29).

Gènes voisins issus d'Ensembl, version 116, sur GRCh38.

Les exons représentent 5,2 kb sur les 101,9 kb du gène ; 1 881 de ces bases codent pour la protéine.

D'où viennent ces informations

  • HGNC : le symbole du gène, son nom, ses autres symboles et sa localisation.
  • MANE Select v1.5, de NCBI et EMBL-EBI : le transcrit, ses exons et sa séquence codante.

Citer cette page

APA

Dante Labs. (s.d.). Gène COLGALT2 : collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2. Consulté le 17 octobre 2026, à l'adresse https://dantelabs.com/fr/genes/colgalt2

Vancouver

Dante Labs. Gène COLGALT2 : collagen beta(1-O)galactosyltransferase 2 [Internet]. [consulté le 17 octobre 2026]. Disponible à : https://dantelabs.com/fr/genes/colgalt2

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